tibljТуберкулез и болезни легкихTuberculosis and Lung Diseases2075-12302542-1506Медицинские знания и технологии10.21292/2075-1230-2017-95-5-54-59tiblj-1005Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИORIGINAL ARTICLESМОНИТОРИНГ ВИДОВОГО РАЗНООБРАЗИЯ НЕТУБЕРКУЛЕЗНЫХ МИКОБАКТЕРИЙ В РЯДЕ ОБЛАСТЕЙ РФ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ ДНК-СТРИПОВ GENOTYPE MYCOBACTERIUM CM/AS (HAIN LIFESCIENCE, ГЕРМАНИЯ)MONITORING OF SPECIES DIVERSITY OF NON-TUBERCULOSIS MYCOBACTERIA IN THE SOME RUSSIAN REGIONS USING DNA-STRIPS OF GENOTYPE MYCOBACTERIUM CM/AS (HAIN LIFESCIENCE, GERMANY)СмирноваТ. Г.SmirnovаT. G.

кандидат медицинских наук, старший научный сотрудник отдела микробиологии

Candidate of Medical Sciences, Senior Researcher of Microbiological Department

s_tatka@mail.ruАндреевскаяС. Н.АndreevskаyaS. N.

кандидат медицинских наук, старший научный сотрудник отдела микробиологии

Candidate of Medical Sciences, Senior Researcher of Microbiological Department

andsofia@mail.ruЛарионоваЕ. Е.LаrionovаE. E.

кандидат биологических наук, старший научный сотрудник отдела микробиологии

Candidate of Biological Sciences, Senior Researcher of Microbiological Department

larionova_lena@mail.ruАндриевскаяИ. Ю.АndrievskаyaI. Yu.

младший научный сотрудник отдела микробиологии

Junior Researcher of Microbiological Department

andrievskaya.iri@mail.ruУстиноваВ. В.UstinovаV. V.

младший научный сотрудник отдела микробиологии

Junior Researcher of Microbiological Department

ustinoville@gmail.comЧерноусоваЛ. Н.ChernousovаL. N.

доктор биологических наук, профессор, руководитель отдела микробиологии

Doctor of Biological Sciences, Professor, Head of Microbiology Department

lchernousova@mail.ruФГБНУ «Центральный НИИ туберкулеза», МоскваРоссияCentral Tuberculosis Research Institute, MoscowRussian Federation2017290520179555459Copyright © Смирнова Т.Г., Андреевская С.Н., Ларионова Е.Е., Андриевская И.Ю., Устинова В.В., Черноусова Л.Н., 20172017Смирнова Т.Г., Андреевская С.Н., Ларионова Е.Е., Андриевская И.Ю., Устинова В.В., Черноусова Л.Н.Smirnovа T.G., Аndreevskаya S.N., Lаrionovа E.E., Аndrievskаya I.Y., Ustinovа V.V., Chernousovа L.N.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.tibl-journal.com/jour/article/view/1005Цель исследования

Цель исследования: установить виды нетуберкулезных микобактерий (НТМ), выделяемых из дыхательных путей больных в различных регионах РФ, используя для идентификации НТМ ДНК-стрипы.

Материалы и методы

Материалы и методы. Исследовано 1 204 культуры НТМ, выделенных на плотных и жидких питательных средах от 727 больных с подозрением на туберкулез/микобактериоз, за период с 2011 по февраль 2017 г. Видовую принадлежность НТМ устанавливали с использованием ДНК-стрипов Hain Lifescience (Германия) GenoType® Mycobacterium CM/AS согласно инструкции производителя.

Результаты

Результаты. Выделено 17 видов НТМ (11 видов относились к группе медленнорастущих и 6 – быстрорастущих НТМ). Преобладали медленнорастущие НТМ (564/727, 77,58%), а наиболее распространенным видом был M. avium (210/727; 28,89%). Также встречались (в порядке убывания) M. gordonae (99/727; 13,62%), M. intracellulare (68/727; 9,35%), M. lentiflavum и M. fortuitum (по 66/727; 9,08%), M. abscessus (49/727; 6,74%), M. kansasii (48/727; 6,60%), M. xenopi (29/727; 3,99%). Описаны региональные особенности встречаемости видов НТМ.

Goal of study

Goal of study: to define species of non-tuberculosis mycobacteria, isolated from the respiratory tract of the patients from various Russian regions using DNA strips for identification of non-tuberculous mycobacteria.

Materials and methods

Materials and methods. 1204 cultures of non-tuberculosis mycobacteria isolated on solid and liquid media from 727 patients in whom tuberculosis/mycobacteriosis was suspected were examined from 2011 to February, 2017. Species of non-tuberculosis mycobacteria were identified using DNA-strips of Hain Lifescience (Germany) GenoType® Mycobacterium CM/AS in compliance with manufacturer's instructions.

Results

Results. 17 species of non-tuberculosis mycobacteria were identified (11 species belonged to the group of those slow-growing and 6 species belonged to fast growing non-tuberculosis mycobacteria). Slow-growing mycobacteria prevailed (564/727, 77.58%) and M. avium was the most prevalent (210/727; 28.89%). The following mycobacteria were found (in descending order): M. gordonae (99/727; 13.62%), M. intracellulare (68/727; 9.35%), M. lentiflavum and M. fortuitum (по 66/727; 9.08%), M. abscessus (49/727; 6.74%), M. kansasii (48/727; 6.60%), M. xenopi (29/727; 3.99%). Prevalence of non-tuberculosis mycobacteria is described in respect of the regions.

диагностика микобактериозанетуберкулезные микобактерииДНК-стрипыGenoType Mycobacterium CMGenoType Mycobacterium ASReferencesГунтупова Л. Д., Борисов С. Е., Соловьева И. П. Микобактериозы во фтизиопульмонологической практике: обзор литературы и собственный опыт // Практическая медицина. – 2011. – № 3 (51). – С. 39-50.Guntupova L.D., Borisov S.E., Solovieva I.P. Mycobacterioses in phthisiopulmonary practice: literature review and personal experience. Prakticheskaya Meditsina, 2011, no. 3 (51), pp. 39-50. (In Russ.)Литвинов В. И., Дорожкова И. Р., Макарова М. В., Краснова М. А., Фрейман Г. Е. Выделение и идентификация нетуберкулезных микобактерий // Вестник РАМН. – 2010. – № 3. – С. 7-11.Litvinov V.I., Dorozhkova I.R., Makarova M.V., Krasnova M.А., Freyman G.E. Isolation and identification of non-tuberculous mycobacteria. Vestnik RAMN, 2010, no. 3, pp. 7-11. (In Russ.)Оттен Т. Ф., Васильев А. В. Микобактериоз. – СПб.: Медицинская пресса, 2005. – 224 с.Otten T.F., Vasiliev А.V. Mikobaketerioz. [Mycobacteriosis]. St. Petersburg, Meditsinskaya Pressa Publ., 2005, 224 p.Приказ Минздрава РФ от 21.03.2003 г. № 109 «О совершенствовании противотуберкулезных мероприятий в Российской Федерации». – М., 2003. – 347 с.Edict no. 109 by RF MoH as of 21.03.2003 On Improvement of TB Control Measures in the Russian Federation. Moscow, 2003, 347 p. (In Russ.)Billinger M. E., Olivier K. N., Viboud C., de Oca R. M., Steiner C., Holland S. M., Prevots D. R. Nontuberculous mycobacteria-associated lung disease in hospitalized persons, United States, 1998-2005 // Emerg. Infect. Dis. – 2009. – Vol. 15, № 10. – P. 1562-1569.Billinger M.E., Olivier K.N., Viboud C., de Oca R.M., Steiner C., Holland S.M., Prevots D.R. Nontuberculous mycobacteria-associated lung disease in hospitalized persons, United States, 1998-2005. Emerg. Infect. Dis., 2009, vol. 15, no. 10, pp. 1562-1569.Blanc P., Dutronc H., Peuchant O., Dauchy F. A., Cazanave C., Neau D., Wirth G., Pellegrin J. L., Morlat P., Mercié P., Tunon-de-Lara J. M., Doutre M. S., Pélissier P., Dupon M. Nontuberculous mycobacterial infections in a French Hospital: A 12-Year Retrospective Study // PLoS One. – 2016. – Vol. 11, № 12. – Р. e0168290.Blanc P., Dutronc H., Peuchant O., Dauchy F.A., Cazanave C., Neau D., Wirth G., Pellegrin J.L., Morlat P., Mercié P., Tunon-de-Lara J.M., Doutre M.S., Pélissier P., Dupon M. Nontuberculous mycobacterial infections in a French Hospital: A 12-Year Retrospective Study. PLoS One, 2016, vol. 11, no. 12, pp. e0168290.Falkinham J. O. Epidemiology of infection by nontuberculous mycobacteria // Clin. Microbiol. Rev. – 1996. – Vol. 9, № 2. – P. 177-215.Falkinham J.O. Epidemiology of infection by nontuberculous mycobacteria. Clin. Microbiol. Rev., 1996, vol. 9, no. 2, pp. 177-215.Gitti Z., Neonakis I., Fanti G., Kontos F., Maraki S., Tselentis Y. Use of the GenoType Mycobacterium CM and AS Аssays to analyze 76 nontuberculous mycobacterial isolates from Greece // J. Clin. Microbiol. – 2006. – Vol. 44, № 6. – P. 2244-2246.Gitti Z., Neonakis I., Fanti G., Kontos F., Maraki S., Tselentis Y. Use of the GenoType Mycobacterium CM and AS Аssays to analyze 76 nontuberculous mycobacterial isolates from Greece. J. Clin. Microbiol., 2006, vol. 44, no. 6, pp. 2244-2246.Lai C. C., Tan C. K., Chou C. H., Hsu H. L., Liao C. H., Huang Y. T., Yang P. C., Luh K. T., Hsueh P. R. Increasing incidence of nontuberculous mycobacteria, Taiwan, 2000-2008 // Emerg. Infect. Dis. – 2010. – Vol. 16, № 2. – P. 294-296.Lai C.C., Tan C.K., Chou C.H., Hsu H.L., Liao C.H., Huang Y.T., Yang P.C., Luh K.T., Hsueh P.R. Increasing incidence of nontuberculous mycobacteria, Taiwan, 2000-2008. Emerg. Infect. Dis., 2010, vol. 16, no. 2, pp. 294-296.Lee Y. C., Kim S. B., Gang S. J., Park S. Y., Kim S. R. Acute necrotizing pneumonia combined with parapneumonic effusion caused by Mycobacterium lentiflavum: a case report // BMC Infect Dis. – 2015. – Vol. 15. – Р. 354.Lee Y.C., Kim S.B., Gang S.J., Park S.Y., Kim S.R. Acute necrotizing pneumonia combined with parapneumonic effusion caused by Mycobacterium lentiflavum: a case report. BMC Infect Dis., 2015, vol. 15, pp. 354.Mirsaeidi M., Machado R. F., Garcia J. G. N., Schraufnagel D. E. Nontuberculous mycobacterial disease mortality in the United States, 1999-2010: A population-based comparative study // PLoS One. – 2014. – Vol. 9, № 3. – Р. e91879.Mirsaeidi M., Machado R.F., Garcia J.G.N., Schraufnagel D.E. Nontuberculous mycobacterial disease mortality in the United States, 1999-2010: A population-based comparative study. PLoS One, 2014, vol. 9, no. 3, pp. e91879.Molteni C., Gazzola L., Cesari M., Lombardi A., Salerno F., Tortoli E., Lombardi A., Salerno F., Tortoli E., Codecasa L., Penati V., Franzetti F., Gori A. Mycobacterium lentiflavum infection in immunocompetent patient // Emerg. Infect. Dis. – 2005. – Vol. 11, № 1. – P. 119-122.Molteni C., Gazzola L., Cesari M., Lombardi A., Salerno F., Tortoli E., Lombardi A., Salerno F., Tortoli E., Codecasa L., Penati V., Franzetti F., Gori A. Mycobacterium lentiflavum infection in immunocompetent patient. Emerg. Infect. Dis., 2005, vol. 11, « 1, pp. 119-122.Moore J., Kruijshaar M. E., Ormerod L. P., Drobniewski F., Abubakar I. Increasing number of non-tuberculous mycobacteria in England, Wales and Northern Ireland, 1995-2006 // BMC Public Health. – 2010. – Vol. 10. – Р. 612.Moore J., Kruijshaar M.E., Ormerod L.P., Drobniewski F., Abubakar I. Increasing number of non-tuberculous mycobacteria in England, Wales and Northern Ireland, 1995-2006. BMC Public Health, 2010, vol. 10, pp. 612.Richter E., Rüsch-Gerdes S., Hillemann D. Evaluation of the GenoType Mycobacterium Assay for identification of mycobacterial species from cultures // J. Clin. Microbiol. – 2006. – Vol. 44, № 5. – P. 1769-1775.Richter E., Rüsch-Gerdes S., Hillemann D. Evaluation of the GenoType Mycobacterium Assay for identification of mycobacterial species from cultures. J. Clin. Microbiol., 2006, vol. 44, no. 5, pp. 1769-1775.Russo C., Tortoli E., Menichella D. Evaluation of the new GenoType Mycobacterium Assay for identification of mycobacterial species // J. Clin. Microbiol. – 2006. – Vol. 44, № 2. – P. 334-339.Russo C., Tortoli E., Menichella D. Evaluation of the new GenoType Mycobacterium Assay for identification of mycobacterial species. J. Clin. Microbiol., 2006, vol. 44, no. 2, pp. 334-339.Simons S., van Ingen J., Hsueh P. R., Hung N. V., Dekhuijzen P. N. R., Boeree M. J., van Soolingen D. Nontuberculous mycobacteria in respiratory tract infections, Eastern Asia // Emerg. Infect. Dis. – 2011. – Vol. 17, № 3. – P. 343-349.Simons S., van Ingen J., Hsueh P.R., Hung N.V., Dekhuijzen P.N.R., Boeree M.J., van Soolingen D. Nontuberculous mycobacteria in respiratory tract infections, Eastern Asia. Emerg. Infect. Dis., 2011, vol. 17, no. 3, pp. 343-349.Tortoli E. Impact of genotypic studies on mycobacterial taxonomy: the new mycobacteria of the 1990s // Clin. Microbiol. Rev. – 2003. – Vol. 16, № 2. – P. 319-354.Tortoli E. Impact of genotypic studies on mycobacterial taxonomy: the new mycobacteria of the 1990s. Clin. Microbiol. Rev., 2003, vol. 16, no. 2, pp. 319-354.van der Werf M. J, Ködmön C., Katalinić-Janković V., Kummik T., Soini H., Richter E., Papaventsis D., Tortoli E., Perrin M., van Soolingen D., Žolnir-Dovč M., Thomsen V. Ø. Inventory study of non-tuberculous mycobacteria in the European Union // BMC Infect. Dis. – 2014. – Vol. 14. – Р. 62.van der Werf M.J, Ködmön C., Katalinić-Janković V., Kummik T., Soini H., Richter E., Papaventsis D., Tortoli E., Perrin M., van Soolingen D., Žolnir-Dovč M., Thomsen V.Ø. Inventory study of non-tuberculous mycobacteria in the European Union. BMC Infect. Dis., 2014, vol. 14. pp. 62.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.