tibljТуберкулез и болезни легкихTuberculosis and Lung Diseases2075-12302542-1506Медицинские знания и технологии10.21292/2075-1230-2017-95-10-29-35tiblj-1050Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИORIGINAL ARTICLESОПЫТ ПРИМЕНЕНИЯ ТЕХНОЛОГИИ «ТБ-ТЕСТ» («БИОЧИП-ИМБ», РОССИЯ) В ДИАГНОСТИЧЕСКОМ АЛГОРИТМЕEXPERIENCE OF USING TB-TEST TECHNOLOGY (BIOCHIP-IMB, RUSSIA) WITHIN THE DIAGNOSTIC PROCEDUREВахрушеваД. В.VakhrushevaD. V.

кандидат биологических наук, ученый секретарь, руководитель референс-лаборатории по этиологической диагностике туберкулеза и микобактериозов,

620039, г. Екатеринбург, 22-го Партсъезда, д. 50

Candidate of Biological Sciences, Academic Secretary, Head of Reference Laboratory for Etiological Diagnostics of Tuberculosis and Mycobacteriosis,

50, XXII Parts"ezda St., Yekaterinburg, 620039

vakhrusheva@urniif.ruЕремееваН. И.EremeevaN. I.

кандидат биологических наук, заведующая лабораторией микробиологии и ПЦР-диагностики,

620039, г. Екатеринбург, 22-го Партсъезда, д. 50

Candidate of Biological Sciences, Head of Microbiology and PCR Diagnostics Laboratory,

50, XXII Parts"ezda St., Yekaterinburg, 620039

eremeevani@yandex.ruУмпелеваТ. В.UmpelevaT. V.

кандидат биологических наук, старший научный сотрудник,

620039, г. Екатеринбург, 22-го Партсъезда, д. 50

Candidate of Biological Sciences, Senior Researcher,

50, XXII Parts"ezda St., Yekaterinburg, 620039

tumpeleva@ya.ruБелоусоваК. В.BelousovaK. V.

кандидат биологических наук, старший научный сотрудник,

620039, г. Екатеринбург, 22-го Партсъезда, д. 50

Candidate of Biological Sciences, Senior Researcher,

50, XXII Parts"ezda St., Yekaterinburg, 620039

kbobrovskaya@mail.ruУральский НИИ фтизиопульмонологии Национального медицинского исследовательского центра фтизиопульмонологии и инфекционных заболеваний МЗ РФРоссияUral Research Institute of PhthisiopulmonologyRussian Federation20171811201795102935Copyright © Вахрушева Д.В., Еремеева Н.И., Умпелева Т.В., Белоусова К.В., 20172017Вахрушева Д.В., Еремеева Н.И., Умпелева Т.В., Белоусова К.В.Vakhrusheva D.V., Eremeeva N.I., Umpeleva T.V., Belousova K.V.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.tibl-journal.com/jour/article/view/1050

Проанализированы результаты включения технологии «ТБ-ТЕСТ» («БИОЧИП-ИМБ», Россия) в алгоритм исследования клинического материала для диагностики туберкулеза и определения лекарственной устойчивости возбудителя в Уральском НИИ фтизиопульмонологии. Использование данной тест-системы целесообразно при наличии не менее 102 клеток микобактерий туберкулеза (МБТ) в 1 мл диагностического материала и высоком уровне множественной лекарственной устойчивости возбудителей в регионе и позволяет за один тест в течение 2-4 дней выявить мутации, ассоциированные с устойчивостью МБТ к основным препаратам 1-го и 2-го рядов, а также провести внутривидовое типирование возбудителя, что необходимо в целях эпидемиологического мониторинга и установления случаев нозокомиальной суперинфекции.

The article analyzes the results of using TB-Test technology (Biochip-IMB, Russia) within the diagnostic procedure for testing clinical specimens with the purpose of tuberculosis diagnostics and drug susceptibility testing in Ural Research Institute of Phthisiopulmonology. The use of this test system is feasible if there are at least 102 cells of tuberculous mycobacteria in 1 ml of the specimen, and there is a high level of multiple drug resistance in the region; and within 2-4 days one test allows detecting mutations associated with resistance to main first and second line TB drugs and performing intraspecific typing of mycobacteria, which is needed for epidemiological monitoring and detection of cases with nosocomial superinfection.

Mycobacterium tuberculosisалгоритм этиологической диагностики«ТБ-ТЕСТ»лекарственная устойчивостьMycobacterium tuberculosisetiological diagnostic procedureTB-TESTdrug resistanceReferencesБеспятых Ю. А., Зименков Д. В., Кулагина Е. В. и др. Определение лекарственной устойчивости и генотипирование клинических штаммов Mycobacterium tuberculosis при помощи экспериментального набора «ТБ-ТЕСТ» // Пульмонология. ‒ 2013. ‒ № 4. ‒ С. 77-81.Bespyatykh Yu.А., Zimenkov D.V., Kulagina E.V.et al. Drug susceptibility testing and genotyping of clinical strains of Mycobacterium tuberculosis using the experimental toolkit of TB-TEST. Pulmonoloiya, 2013, no. 4, pp. 77-81. (In Russ.)Бобровская К. В., Камаев Е. Ю., Кравченко М. А., Вахрушева Д. В. Определение лекарственной устойчивости М. tuberculosis к рифампицину и изониазиду методом абсолютных концентраций и анализ мутаций на биологических микрочипах // Омский научный вестник. ‒ № 1 (84). ‒ 2009. ‒ С. 9-13.Bobrovskaya K.V., Kamaev E.Yu., Kravchenko M.А., Vakhrusheva D.V. Testing drug susceptibility of M.tuberculosis to rifampicin and isoniazid by absolute concentrations and analysis of mutations using biological microchips. Omskiy Nauchny Vestnik, no. 1 (84), 2009, pp. 9-13. (In Russ.)Вахрушева Д. В., Голубев Д. Н. Схема бактериологического обследования пациентов, поступающих в приемно-диагностическое отделение УНИИФ. Патент на промышленный образец № 82725 от 16.08.2012 г.Vakhrusheva D.V., Golubev D.N. Skhema bakteriologicheskogo obsledovaniya patsientov, postupayuschikh v priemno-diagnosticheskoe otdelenie UNIIF. [Bacteriological testing scheme of the patients admitted to the admission diagnostic department of Ural Research Institute of Phthisiopulmonology]. RF Patent no. 82725 as of 16.08.2012.Зименков Д. В., Кулагина Е. В., Антонова О. В. и др. Анализ генетических детерминант множественной и широкой лекарственной устойчивости возбудителя туберкулеза с использованием олигонуклеотидного микрочипа // Молекулярная биология. ‒ 2014. ‒ Т. 48, № 2. ‒ С. 1-14.Analysis of genetic determinants of multiple and extensive drug resistance of tuberculous mycobacteria using oligonucleotide microchip. Molekulyarnaya Biologiya, 2014, vol. 48, no. 2, pp. 1-14. (In Russ.)Исакова Ж. Т., Совхозова Н. А., Гончарова З. К., Алдашев А. А. Сравнительный анализ определения лекарственно-устойчивых штаммов M. tuberculosis бактериологическим методом абсолютных концентраций и методом биологических микрочипов // Туб. и болезни легких. ‒ 2011. ‒№ 3. ‒ С. 57-59.Isakova Zh.T., Sovkhozova N.А., Goncharova Z.K., Аldashev А.А.Comparative analysis of DST by absolute concentrations and biological microchips. Tuberculosis and Lung Diseases, 2011, no. 3, pp. 57-59. (In Russ.)Кравченко М. А., Еремеева Н. И., Камаев Е. Ю. и др. Схема «Набор страниц алгоритма этиологической диагностики туберкулеза и контроля химиотерапии». Патент на промышленный образец № 89414 от 16.07.2014 г.Kravchenko M.А., Eremeeva N.I., Kamaev E.Yu. et al. Skhema «Nabor stranits algoritma etiologicheskoy diagnostiki tuberkuleza i kontrolya khimioterapii». [Scheme on the set of pages for the procedure of etiological diagnostics of tuberculosis and treatment monitoring]. RF Patent no. 89414 as of 16.07.2014.Носова Е. Ю., Краснова М. А., Галкина К. Ю. Сравнительная оценка эффективности молекулярных тест-систем “ТБ-биочип”, “Xpert MTB/Rif” и “Genotype MTBDRplus” для быстрого определения мутаций, ответственных за лекарственную устойчивость Мycobacterium tuberculosis complex (в респираторном материале пациентов московского региона) // Молекулярная биология. ‒ 2013. ‒ Т. 47, № 2. ‒ С. 267.Nosova E.Yu., Krasnova M.А., Galkina K.Yu. Comparative efficiency of molecular test systems of TB-Biochip, Xpert MTB/Rif and Genotype MTBDRplus for rapid detection of mutations accounting for drug resistance of Мycobacterium tuberculosis complex (in specimens collected from the respiratory tract of the patients residing in Moscow Region). Molekulyarnaya Biologiya, 2013, vol. 47, no. 2, pp. 267. (In Russ.)Носова Е. Ю., Хахалина А. А., Исакова А. И. и др. Одновременное определение генетических детерминант широкой лекарственной устойчивости и генотипирование M. tuberculosis с помощью гибридизационного анализа на биочипах // Туберкулез и социально-значимые заболевания. ‒ 2016. ‒ № 2. ‒ С. 24-33.Nosova E.Yu., Khakhalina А.А., Isakova А.I. et al. Simultaneous testing of genetic determinants of extensive drug resistance and genotyping of M. tuberculosis with hybrid biochip analysis. Tuberkulez i Sotsialno-Znachimye Zabolevaniya, 2016, no. 2, pp. 24-33. (In Russ.)Павлова М. В., Сапожникова Н. В., Журавлев В. Ю. и др. Ускоренная диагностика множественной лекарственной устойчивости МБТ на основе тест-системы «ТБ-биочип» // Туб. и болезни легких. ‒ 2011. ‒ Т. 88, № 5. ‒ С. 93.Pavlova M.V., Sapozhnikova N.V., Zhuravlev V.Yu. et al. Express diagnostics of multiple drug resistance of mycobacterium tuberculosis based on the TB-Biochip test system. Tuberculosis and Lung Diseases, 2011, vol. 88, no. 5, pp. 93. (In Russ.)Умпелева Т. В., Кравченко М. А., Еремеева Н. И., Вязовая А. А., Нарвская О. В. Молекулярно-генетическая характеристика штаммов Mycobacterium tuberculosis, циркулирующих на территории Уральского региона России // Инфекция и иммунитет. ‒ 2013. ‒ Т. 3, № 1. ‒ Р. 21-28.Umpeleva T.V., Kravchenko M.А., Eremeeva N.I., Vyazovaya А.А., Narvskaya O.V. Molecular genetic characteristics of Mycobacterium tuberculosis strains, circulating in Ural Region of Russia. Infektsiya and Immunitet, 2013, vol. 3, no. 1, pp. 21-28. (In Russ.)Федеральные клинические рекомендации по диагностике и лечению туберкулеза органов дыхания. ‒ М.-Тверь: Триада, 2014. ‒ 56 с.Federalnye klinicheskie rekomendatsii po diagnostike i lecheniyu tuberkuleza organov dykhaniya. [Federal recommendations for diagnostics and treatment of respiratory tuberculosis in children]. Moscow, Tver, Triada Publ., 2014. 56 p.Федеральные клинические рекомендации по диагностике и лечению туберкулеза органов дыхания с множественной и широкой лекарственной устойчивостью возбудителя. – М.-Тверь: Триада, 2014. ‒ 72 с.Federal clinical recommendations for diagnosis and treatment of respiratory tuberculosis with multiple and extensive drug resistance. Moscow, Tver, Triada Publ., 2014. 72 p.Федеральные клинические рекомендации по организации и проведению микробиологической и молекулярно-генетической диагностики туберкулеза. ‒ М., 2015. ‒ 35 с.Federal'nye klinicheskie rekomendatsii po organizatsii i provedeniyu mikrobiologicheskoy i molekulyarno-geneticheskoy diagnostiki tuberkuleza. [Federal clinical recommendations in organisation and implementation of microbiological and molecular-genetic diagnostics of tuberculosis]. Moscow, 2015. 35 p.BakuBa Z., Napiorkowska A., Bielecki J. et al. Mutations in the embB gene and their association with ethambutol resistance in multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis clinical isolates from Poland // BioMed. Res. Intern. ‒ 2013. ‒ Vol. 167954. ‒ P. 5.BakuBa Z., Napiorkowska A., Bielecki J. et al. Mutations in the embB gene and their association with ethambutol resistance in multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis clinical isolates from Poland. Biomed. Res. Intern., 2013, vol. 167954, pp. 5.Bespyatykh J. A., Zimenkov D. V., Shitikov E. A. et al. Spoligotyping of Mycobacterium tuberculosis complex isolates using hydrogel oligonucleotide microarrays // Infection Genetics and Evolution. ‒ 2014. ‒ Vol. 26. ‒ Р. 41-46.Bespyatykh J.A., Zimenkov D.V., Shitikov E.A. et al. Spoligotyping of Mycobacterium tuberculosis complex isolates using hydrogel oligonucleotide microarrays. Infection, Genetics and Evolution, 2014, vol. 26, pp. 41-46.Nosova E. Y., Zimenkov D. V., Khakhalina A. A. еt al. A comporation of the Sensititre MycoTB Plate, the Bactec MGIT 960, and microarray-based molecular assay for the detection of drug resistance in clinical Mycobacterium tuberculosis isolates in Moscow, Russia // PLOS ONE|DOI:10.1371/journal. pone.0167093.Nosova E.Y., Zimenkov D.V., Khakhalina A.A. еt al. A comporation of the Sensititre MycoTB Plate, the Bactec MGIT 960, and microarray-based molecular assay for the detection of drug resistance in clinical Mycobacterium tuberculosis isolates in Moscow, Russia. PLOS ONE|DOI:10.1371/journal.pone.0167093.Plinke C., Rusch-Gerdes S., Niemann S. Significance of mutations in embB Codon 306 for prediction of ethambutol resistance in clinical Mycobacterium tuberculosis isolates // Antimicrobial Agents and Chemotherapy. ‒ 2006. Vol. 50, № 5. ‒ P. 1900-1902.Plinke C., Rusch-Gerdes S., Niemann S. Significance of mutations in embB Codon 306 for prediction of ethambutol resistance in clinical Mycobacterium tuberculosis isolates. Antimicrobial Agents and Chemotherapy, 2006, vol. 50, no. 5, pp. 1900-1902.Zimenkov D. V., Antonova O. V., Kuz'min A. V. et al. Detection of second-line drug resistance in Mycobacterium tuberculosis using oligonucleotide microarrays // BMC Infectious diseases. ‒ 2013. ‒ № 13. ‒ Р. 240.Zimenkov D.V., Antonova O.V., Kuz'min A.V. et al. Detection of second-line drug resistance in Mycobacterium tuberculosis using oligonucleotide microarrays. BMC Infectious Diseases, 2013, no. 13, pp. 240.Zimenkov D. V., Kulagina E. V., Antonova O. V. еt al. Evaluation of a low-density hydrogel microarray technique for Mycobacterial species identification // J. Clinical Microbiology. ‒ 2015. ‒ Vol. 53, № 4. ‒ P. 1103-1114.Zimenkov D.V., Kulagina E.V., Antonova O.V. еt al. Evaluation of a low-density hydrogel microarray technique for Mycobacterial species identification. J. Clinical Microbiology, 2015, vol. 53, no. 4, pp. 1103-1114.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.