tibljТуберкулез и болезни легкихTuberculosis and Lung Diseases2075-12302542-1506Медицинские знания и технологии10.21292/2075-1230-2018-96-4-32-37tiblj-1111Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИORIGINAL ARTICLESКЛИНИКО-ЭПИДЕМИЧЕСКОЕ ЗНАЧЕНИЕ РАЗНЫХ ГЕНОТИПОВ M. TUBERCULOSIS И ДИНАМИКА ИХ РАСПРОСТРАНЕНИЯ В САРАТОВСКОЙ ОБЛАСТИ ЗА ЧЕТЫРЕХЛЕТНИЙ ПЕРИОД НАБЛЮДЕНИЯCLINICAL AND EPIDEMIOLOGICAL VALUE OF VARIOUS GENOTYPES OF M. TUBERCULOSIS AND CHANGES IN THEIR TRANSMISSION IN SARATOV REGION DURING 4-YEAR PERIODСалинаТ. Ю.SаlinаT. Yu.

доктор медицинских наук, доцент, профессор, кафедра фтизиатрии ИДПО

Тел.: 8 (8452) 26-56-08

410012 г. Саратов, ул. Б. Казачья, д. 112

Doctor of Medical Sciences, Associate Professor, Professor of Phthisiology Department with the Unit for Professional Development

Phone: +7 (8452) 26-56-08

meduniv@sgmu.ruМорозоваТ. И.MorozovаT. I.

доктор медицинских наук, профессор, заведующая кафедрой, кафедра фтизиатрии ИДПО

Тел./факс: 8 (8452) 26-16-90

Doctor of Medical Sciences, Professor, Head of Phthisiology Department with the Unit for Professional Development

Phone/Fax: +7 (8452) 26-16-90

dispans@san.ruФГБОУ ВО «Саратовский государственный медицинский университет им. В. И. Разумовского» МЗ РФРоссияV. I. Razumovsky Saratov State Medical UniversityRussian Federation2018170520189643237Copyright © Салина Т.Ю., Морозова Т.И., 20182018Салина Т.Ю., Морозова Т.И.Sаlinа T.Y., Morozovа T.I.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.tibl-journal.com/jour/article/view/1111Цель

Цель: выявить особенности циркуляции микобактерий туберкулеза (МБТ) разных генотипов в Саратовской области, определить их клинико-эпидемическое значение и динамику распространения за четырехлетний период наблюдения (2014-2017 гг.).

Материалы

Материалы. Исследовано 310 клинических изолятов МБТ, полученных из образцов мокроты больных впервые выявленным туберкулезом легких. Использовали метод сполиготипирования и гибридизации на биологическом микрочипе с применением набора «Сполиго-биочип» (ООО «БИОЧИП-ИМБ», Москва).

Результаты

Результаты. Установлено, что в Саратовской области в 2014-2017 гг. циркулировало 11 генотипов МБТ (Bejing, Beijing-like, Haarlem+Ural, LAM, T, Microti, Rus 1, EAI, Canetti, Cas, Manu), доминирующими из которых были Bejing, Beijing-like, Haarlem и T. Beijing и Beijing-like характеризовались однородностью генетической структуры с наличием крупных кластеров сполиготипов (SIT) 1, 265 и 250. SIT 1 генотипа Beijing достоверно чаще встречался у пациентов с тяжелыми формами туберкулеза с бактериовыделением. МБТ генотипов Haarlem и Т характеризовались большой гетерогенностью и низкой кластеризацией. Генотипы Beijing и Haarlem наиболее эпидемически неблагоприятны, так как достоверно чаще выделялись от пациентов с деструкциями и бактериовыделением. Зарегистрировано положительное изменение эпидемиологии туберкулеза в Саратовской области в 2016-2017 гг. в сторону уменьшения циркуляции генотипа Beijing, а также увеличение циркуляции МБТ генотипа Т.

Goal

Goal: to detect specific features of circulation of tuberculosis mycobacteria belonging to various genotypes in Saratov Region, define their clinical and epidemiological value and changes in the transmission during 4 years of monitoring (2014-2017).

Materials

Materials. 310 clinical isolates of M. tuberculosis were studied, all isolates were obtained from sputum of new pulmonary tuberculosis patients. The toolkit of Spoligo-Biochip (OOO BIOCHIP-IMB, Moscow) was used for spoligotyping and hybridization on the biological microchips.

Results

Results. It was found out that in 2014-2017 in Saratov Region,11 genotypes of M. tuberculosis were circulating (Bejing, Beijing-like, Haarlem+Ural, LAM, T, Microti, Rus 1, EAI, Canetti, Cas, Manu), of them, Bejing, Beijing-like, Haarlem и T. dominated. The homogeneous genetic structure was typical of Beijing и Beijing-like with large clusters of spoligotypes of (SIT) 1, 265 и 250. Beijing SIT 1 was confidently more frequent in those with severe forms of tuberculosis and bacillary excretion. M. tuberculosis of Haarlem and T genotypes had a higher heterogeneity and lower clusterization. Beijing and Haarlem were the most unfavorable from the epidemic point of view and they were confidently more frequent in patients with lung tissue destruction and bacillary excretion. For 2016-2017, the positive change in tuberculosis epidemics was registered in Saratov Region, namely, the circulation of Beijing decreased while the circulation of T genotype increased.

микобактерии туберкулезагенотипысполиготипированиеtuberculous mycobateriagenotypesspoligotypingReferencesБаранов А. А., Марьяндышев А. О., Маркелов Ю. М., Бьюне Г., Дале У. Молекулярная эпидемиология туберкулеза в четырех административных территориях Баренц-региона Российской Федерации // Экология человека. ‒ 2007. ‒ № 9. ‒ С. 34-38.Baranov А.А., Maryandyshev А.O., Markelov Yu.M., Byune G., Dale U. Molecular epidemiology of tuberculosis in four administrative regions of Barents Region of the Russian Federation. Ekologiya Cheloveka, 2007, no. 9, pp. 34-38. (In Russ.)Васильева И. А., Белиловский Е. М., Борисов С. Е., Стерликов С. А. Глобальные отчеты ВОЗ по туберкулезу: формирование и интерпретация // Туб. и болезни легких. ‒ 2017. ‒ Т. 95, № 5. ‒ С. 7-15.Vasilyeva I.А., Belilovskiy E.M., Borisov S.E., Sterlikov S.А. Global tuberculosis reports by WHO, compilation and interpretation. Tuberculosis and Lung Diseases, 2017, vol. 95, no. 5, pp. 7-15. (In Russ.)Васильева И. А., Белиловский Е. М., Борисов С. Е., Стерликов С. А. Заболеваемость, смертность и распространенность как показатели бремени туберкулеза в регинах ВОЗ, странах мира и в Российской Федерации. Часть 1. Заболеваемость и распространность туберкулеза // Туб. и болезни легких. ‒ 2017. ‒ Т. 95, № 6. ‒ С. 9-21.Vasilyeva I.А., Belilovskiy E.M., Borisov S.E., Sterlikov S.А. Incidence, mortality and prevalence as indicators of tuberculosis burden in WHO regions, countries of the world and the Russian Federation. Part 1. Tuberculosis incidence and prevalence. Tuberculosis and Lung Diseases, 2017, vol. 95, no. 6, pp. 9-21. (In Russ.)Дымова М. А. Выявление генетического разнообразия Mycobacterium tuberculosis на территории стран СНГ: Автореф. дис. … канд.биол. наук. ‒ Новосибирск, 2011. – 19 с.Dymova M.A. Vyyavlenie geneticheskogo raznoobraziya Mycobacterium tuberculosis na territorii stran SNG. Diss. kand. biol. nauk. [Detection of genetic variety of Mycobacterium tuberculosis on the territory of CIS countries. Cand. Diss.]. Novosibirsk, 2011, 19 p.Залуцкая О. М., Вийкандер М. М., Скрягина Е. М., Хоффнер С., Гуревич Г. Л., Сагальчик Е. Р. Молекулярная характеристика штаммов M. tuberculosis в г. Минске // Туб. и болезни легких. ‒ 2013. ‒ Т. 90, № 11. ‒ С. 47-51.Zalutskaya O.M., Viykander M.M., Skryagina E.M., Khoffner S., Gurevich G.L., Sagalchik E.R. Molecular description of M. tuberculosis strains in the city of Minsk. Tuberculosis and Lung Diseases, 2013, vol. 90, no. 11, pp. 47-51. (In Russ.)Мокроусов И. В. Методологические подходы к генотипированию Mycobacterium tuberculosis для эволюционных и эпидемиологических исследований // Инфекция и иммунитет. ‒ 2012. ‒ Т. 2, № 3. – С. 603-614.Mokrousov I.V. Methodical approaches to genotyping to Mycobacterium tuberculosis for evolutional and epidemiological research. Infektsiya and Immunitet, 2012, vol. 2, no. 3, pp. 603-614. (In Russ.)Потейко П. И., Шевченко О. С., Крутько В. С., Ляшенко А. А., Филипенко М. Л., Рот М. А. Генетические штаммы M. tuberculosis у впервые выявленных больных туберкулезом в г. Харькове // II конгресс Национальной ассоциации фтизиатров: сб. науч. тр. – Санкт-Петербург, 2013 ‒ С. 69.Poteyko P.I., Shevchenko O.S., Krutko V.S., Lyashenko А.А., Filipenko M.L., Rot M.А. Genetic strains of M. tuberculosis in new tuberculosis patients in Kharkov. II kongress Natsionalnoy assotsiatsii ftiziatrov: sb. nauch. tr. [IInd Congress of National Association of Phthisiologists. Abst. Book]. St. Petersburg, 2013, pp. 69. (In Russ.)Савилов Е. Д., Синьков В. В., Огарков О. Б. Эпидемиология туберкулеза на Евро-Азиатском континенте: оценка глобального движения штаммов генотипа «Пекин». ‒ Иркутск: РИО ГБОУ ДПО ИГМАПО, 2013. ‒ 120 с.Savilov E.D., Sinkov V.V., Ogarkov O.B. Epidemiologiya tuberkuleza na Evro-aziatskom kontinente: otsenka globalnogo dvizheniya shtammov genotipa «Pekin». [Epidemiology of tuberculosis in Euro-Asian Continent: evaluation of global movement of strains of Beijing genotype]. Irkutsk, RIO GBOU DPO IGMAPO Publ., 2013, 120 p.Скорняков С. Н., Умпелева Т. В., Вязовая А. А., Кравченко М. А., Еремеева Н. И., Нарвская О. В. Генотипирование уральских изолятов Mycobacterium tuberculosis // Биологические науки. – 2014. ‒ № 9. ‒ C. 2485-2488.Skornyakov S.N., Umpeleva T.V., Vyazovaya А.А., Kravchenko M.А., Eremeeva N.I., Narvskaya O.V. Genotyping of Ural isolates of Mycobacterium tuberculosis. Biologicheskiye Nauki, 2014, no. 9, pp. 2485-2488. (In Russ.)Черноусова Л. Н., Голышевская В. И., Ерохин В. В., Кузнецов С. И., Захарова С. М., Мелентьев А. С., Федорин И. М., Николаевский В. В., Ради М., Балабанова Я. М., Дробневский Ф. Преобладание штаммов Mycobacterium tuberculosis семейства Beijing и факторы их трансмиссии в Самарской области // Пробл. туберкулеза и болезней легких. ‒ 2006. ‒ № 2. ‒ С. 31-37.Chernousova L.N., Golyshevskaya V.I., Erokhin V.V., Kuznetsov S.I., Zakharova S.M., Melentiev А.S., Fedorin I.M., Nikolaevskiy V.V., Radi M., Balabanova Ya.M., Drobnevskiy F. Prevalence of Mycobacterium tuberculosis strains of Beijing family and risk factors of their transmission in Samara Region. Probl. Tuberkuleza i Bolezni Legkikh, 2006, no. 2, pp. 31-37. (In Russ.)Global Tuberculosis Report 2016, WHO/HTM/TB2016.13. Geneva: World Health Organization, 2016.Global Tuberculosis Report 2016, WHO/HTM/TB2016.13. Geneva, World Health Organization, 2016.Kremer K., Werf M. J. van der, Au B. K., Anh D. D., Kam K. M., Doorn H. R. van., Borgdorff M. W., Soolingen D van. Vaccine-induced immunity circumvented by typical Mycobacterium tuberculosis Beijing strains // Emerg. Infect. Dis. ‒ 2009. ‒ Vol. 15. ‒ P. 335-339.Kremer K., Werf M.J. van der, Au B.K., Anh D.D., Kam K.M., Doorn H.R. van., Borgdorff M.W., Soolingen D van. Vaccine-induced immunity circumvented by typical Mycobacterium tuberculosis Beijing strains. Emerg. Infect. Dis., 2009, vol. 15, pp. 335-339.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.