tibljТуберкулез и болезни легкихTuberculosis and Lung Diseases2075-12302542-1506Медицинские знания и технологии10.21292/2075-1230-2019-97-3-40-45tiblj-1251Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИORIGINAL ARTICLESГЕНЕТИЧЕСКИЙ ПОЛИМОРФИЗМ ВОЗБУДИТЕЛЯ ТУБЕРКУЛЕЗА НА ТЕРРИТОРИИ ГОРОДА С ОГРАНИЧЕННОЙ МИГРАЦИЕЙ НАСЕЛЕНИЯ И ВЫСОКИМ УРОВНЕМ ЗАБОЛЕВАЕМОСТИ ВИЧ-ИНФЕКЦИЕЙGENETIC POLYMORPHISM OF TUBERCULOSIS MYCOBACTERIA IN THE CITY WITH LIMITED POPULATION MIGRATION AND HIGH INCIDENCE OF HIV INFECTIONУмпелеваТ. В.UmpelevaT. V.

кандидат биологических наук, старший научный сотрудник

Candidate of Biological Sciences, Senior Researcher

tumpeleva@ya.ruБелоусоваК. В.BelousovaK. V.

кандидат биологических наук, старший научный сотрудник

Candidate of Biological Sciences, Senior Researcher

kbobrovskaya@mail.ruГолубеваЛ. А.GolubevaL. A.

младший научный сотрудник

Junior Researcher

golubeva.luda2010@yandex.ruМорозоваИ. М.MorozovaI. M.

заведующая туберкулезным отделением, врач-фтизиатр, главный внештатный специалист-фтизиатр Новоуральского городского округа

Head of Tuberculosis Department, Phthisiologist, Chief Visiting Phthisiologist of Novouralsk Municipality

docirina2008@yandex.ruЕремееваН. И.EremeevaN. I.

кандидат биологических наук, старший научный сотрудник

Candidate of Biological Sciences, Senior Researcher

eremeevani@ya.ruВахрушеваД. В.VakhrushevaD. V.

кандидат биологических наук, ученый секретарь

Candidate of Biological Sciences, Academic Secretary

vakhrusheva@urniif.ruФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр фтизиопульмонологии и инфекционных заболеваний» МЗ РФ, г. ЕкатеринбургРоссияNational Medical Research Center of Phthisiopulmonology and Infectious Diseases, YekaterinburgRussian FederationФГБУЗ «ЦМСЧ № 31 ФМБА России», г. НовоуральскРоссияCentral Medical Sanitary Unit no. 31 by the Russian Federal Medical Biological Agency, NovouralskRussian Federation2019030420199734045Copyright © Умпелева Т.В., Белоусова К.В., Голубева Л.А., Морозова И.М., Еремеева Н.И., Вахрушева Д.В., 20192019Умпелева Т.В., Белоусова К.В., Голубева Л.А., Морозова И.М., Еремеева Н.И., Вахрушева Д.В.Umpeleva T.V., Belousova K.V., Golubeva L.A., Morozova I.M., Eremeeva N.I., Vakhrusheva D.V.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.tibl-journal.com/jour/article/view/1251

Проведено исследование 87 изолятов M. tuberculosis, выделенных от больных туберкулезом жителей Новоуральского городского округа в 2013-2016 гг. Выявлен высокий процент изолятов, обладающих множественной лекарственной устойчивостью: 66 и 85,3% среди впервые выявленных и ранее леченных больных соответственно. Генотипирование позволило установить доминирование изолятов группы Beijing как среди впервые выявленных (75,5%), так и среди ранее леченных больных (85,3%), при этом 52,8 и 67,6% изолятов соответственно принадлежали варианту Beijing B0/W148. MIRU-VNTR-типирование позволило выявить девять изолятов группы Beijing B0/W148 с нетипичным числом повторов в локусе QUB26 (два). В работе отмечен высокий процент больных туберкулезом с ВИЧ-инфекцией (39,1%), при этом в группах больных туберкулезом с различным ВИЧ-статусом отличий в доле возбудителя с множественной лекарственной устойчивостью и принадлежностью к генотипу Beijing (BeijingB0/W148) не выявлено. Показана возможность использования технологий генотипирования для подтверждения/опровержения эпидемических связей между пациентами и поиска ранее неизвестных механизмов передачи туберкулезной инфекции.

87 isolates of M. tuberculosis isolated from tuberculosis patients in the Novouralsk municipality in 2013-2016 were studied. It was found out that a high percentage of isolates had multiple drug resistance: 66 and 85.3% among newly diagnosed and previously treated patients, respectively. Genotyping allowed revealing the dominance of isolates of the Beijing family, both among newly diagnosed (75.5%) and previously treated patients (85.3%), with 52.8 and 67.6% of isolates, respectively, belonging to the Beijing B0/W148 variant. MIRU-VNTR-typing detected nine isolates of the Beijing B0/W148 family with an atypical number of repeats in the QUB26 locus (two). A high rate of tuberculosis with concurrent HIV (39.1%) was noted, while in groups of tuberculosis patients with various HIV statuses, no difference was detected in the ratio of multiple drug resistant pathogens and belonging to the Beijing genotype (BeijingB0/W148). The article demonstrates the possibility of using genotyping technologies to confirm/deny the epidemiological relationship between patients and search for previously unknown mechanisms of tuberculosis infection transmission.

M. tuberculosisгенотипированиеНовоуральсклекарственная устойчивостьBeijingВИЧ-инфекцияM. tuberculosisgenotypingNovouralskdrug resistanceBeijingHIV infectionReferencesВязовая А. А., Мокроусов И. В., Журавлев В. Ю., Соловьева Н. С., Оттен Т. Ф., Маничева О. А., Вишневский Б. И., Нарвская О. В. Молекулярная характеристика мультирезистентных штаммов Mycobacterium tuberculosis, выделенных на Северо-Западе России // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. ‒ 2016. ‒ № 1. ‒ С. 30-33.Vyazovaya А.А., Mokrousov I.V., Zhuravlev V.Yu., Solovieva N.S., Otten T.F., Manicheva O.А., Vishnevskiy B.I., Narvskaya O.V. Molecular description of multiple drug resistant strains of Mycobacterium tuberculosis, isolated in North-West Russia. Molekulyarnaya Genetika, Mikrobiologiya i Virusologiya, 2016, no. 1, pp. 30-33. (In Russ.)Вязовая А. А., Соловьева Н. С., Сунчалина Т. В., Мокроусов И. В., Журавлев В. Ю., Нарвская О. В. Характеристика популяции Mycobacterium tuberculosis в Республике Карелия // Туб. и болезни легких. ‒ 2016. ‒ № 8. ‒ С. 48-53.Vyazovaya А.А., Solovieva N.S., Sunchalina T.V., Mokrousov I.V., Zhuravlev V. Yu., Narvskaya O.V. Characteristics of Mycobacterium tuberculosis population in Kareliya Republic. Tuberculosis and Lung Diseases, 2016, no. 8, pp. 48-53. (In Russ.)Жданова С. Н. Молекулярно-эпидемиологическое исследование распространения основных генотипов возбудителя туберкулеза в Северной Азии: Дис. … д-ра мед. наук. ‒ Иркутск, 2018. ‒ 276 с.Zhdanova S.N. Molekulyarno-epidemiologicheskoe issledovanie rasprostraneniya osnovnykh genotipov vozbuditelya tuberkuleza v Severnoy Аzii. Dis. dokt. med. nauk. [The molecular epidemiological study of transmission of main genotypes of M. tuberculosis in the Northern Asia. Doct. Diss.]. Irkutsk, 2018, 276 p.Киселев В. Г., Пичугин В. В. К истории закрытых административных территориальных образований атомной отрасли [Электронный ресурс] // Proatom.ru. – 2011 URL: http://www.proatom.ru/modules.php?name=News&file=article&sid=3223 (дата обращения 21.09.2018)Kiselev V.G., Pichugin V.V. K istorii zakrytykh administrativnykh territorialnykh obrazovaniy atomnoy otrasli. [About the history of closed municipalities within nuclear industry]. (Epub.), Proatom.ru. 2011, Available: http://www.proatom. ru/modules.php?name=News&file=article&sid=3223 (Accessed: 21.09.2018)Материалы для государственного доклада «О состоянии санитарно- эпидемиологического благополучия населения Новоуральского городского округа в 2017 году» [Электронный ресурс] // fmbaros.ru-2018 URL: http://fmbaros.ru/Public/Ru/mru31/sancondition (дата обращения 21.09.2018).Materialy dlya gosudarstvennogo doklada «O sostoyanii sanitarno-epidemio logicheskogo blagopoluchiya naseleniya Novouralskogo gorodskogo okruga v 2017 godu». [Materials for the state report on the sanitary and epidemiological well-being of population of Novouralsk municipality in 2017]. (Epub.), fmbaros.ru2018, Available: http://fmbaros.ru/Public/Ru/mru31/sancondition (Accessed 21.09.2018).Михайлищева М. С. Лекарственная устойчивость Mycobacterium tuberculosis у впервые выявленных больных в Свердловской области: Дис. … магистра биологии. Уральский федеральный университет, Екатеринбург, 2018. ‒ 44 с.Mikhaylischeva M.S. Lekarstvennaya ustojchivost Mycobacterium tuberculosis u vpervye vyyavlennykh bolnykh v Sverdlovskoy oblasti. Diss. magistra biologii. [Drug resistance of tuberculous mycobacteria in new cases of Sverdlovsk Region. Thesis of Master of Biology]. Ural Federal University, Yekaterinburg, 2018, 44 p.Новоуральский городской округ. Официальный сайт правительства Свердловской области [Электронный ресурс] URL: http://www. midural.ru/100034/100089/mu_leaders/document2400/ (дата обращения 21.09.2018).Novouralsk municipality. Official website of Sverdlovsk Regional Government. (Epub.) Available: http://www.midural.ru/100034/100089/mu_ leaders/document2400/ (Accessed 21.09.2018). (In Russ.)Огарков О. Б., Жданова С. Н., Зарбуев А. Н., Бадлеева М. В., Унтанова Л. С., Темирбаева И. В., Лац А. А., Савилов Е. Д. Полиморфизм Mycobacterium tuberculosis, выделенных от больных туберкулезом в пенитенциарной системе Бурятии: высокая распространенность генотипа Пекин // Сибирский мед. журнал. ‒ 2012. ‒ № 6. ‒ С. 54-57.Ogarkov O.B., Zhdanova S.N., Zarbuev А.N., Badleeva M.V., Untanova L.S., Temirbaeva I.V., Lats А.А., Savilov E.D.Polymorphism of Mycobacerium tuberculosis, isolated from tuberculosis patients in the penitentiary system of Buryatia: high prevalence of Beijing strain. Sibirskiy Med. Journal, 2012, no. 6, pp. 54-57. (In Russ.)Панов Г. А. Биологические свойства и эпидемиологическая значимость Mycobacterium tuberculosis, выделенных от больных с сочетанной патологией (туберкулез/ВИЧ): Дис. … канд. мед. наук. ‒ М., 2017.Panov G.A. Biologicheskie svoystva i epidemiologicheskaya znachimost Mycobacterium tuberculosis, vydelennykh ot bolnykh s sochetannoy patologiey (tuberkulez/VICH).Dis. kand. med. nauk. [Biological properties and epidemiological value of Mycobacterium tuberculosis isolated in the co-infected patients (tuberculosis/HIV). Cand. Diss.]. Moscow, 2017.Умпелева Т. В., Вязовая А. А., Еремеева Н. И., Кравченко М. А., Нарвская О. В., Скорняков С. Н. Генетические особенности возбудителя туберкулеза в Уральском федеральном округе России // Туб. и болезни легких. ‒ 2016. ‒ Т. 94, № 8. ‒ С. 60-64.Umpeleva T.V., Vyazovaya А.А., Eremeeva N.I., Kravchenko M.А., Narvskaya O.V., Skornyakov S.N. Specific genetic features of Mycobacterium tuberculosis in Ural Federal District of Russia. Tuberculosis and Lung Diseases, 2016, vol. 94, no. 8, pp. 60-64. (In Russ.)Федеральные клинические рекомендации по организации и проведению микробиологической и молекулярно-генетической диагностики туберкулеза, Москва. – 2015. ‒ 36 с.Federalnye klinicheskie rekomendatsii po organizatsii i provedeniyu mikrobiologicheskoy i molekulyarno-geneticheskoy diagnostiki tuberkuleza. [Federal clinical recommendations on organization and implementation of microbiological and molecular-genetic diagnostics of tuberculosis]. 2015, 36 p.Mokrousov I., Narvskaya O., Vyazovaya A., Otten T., Jiao W., Gomes L., Suffys P., Shen A., Vishnevsky B. Russian “Successful” Clone B0/W148 of Mycobacterium tuberculosis Beijing Genotype: a Multiplex PCR Assay for Rapid Detection and Global Screening // J. Clin Microbiol. ‒ 2012. ‒ № 50 (11). ‒ P. 3757-3759.Mokrousov I., Narvskaya O., Vyazovaya A., Otten T., Jiao W., Gomes L., Suffys P., Shen A., Vishnevsky B. Russian “Successful” Clone B0/W148 of Mycobacterium tuberculosis Beijing Genotype: a Multiplex PCR Assay for Rapid Detection and Global Screening. J. Clin Microbiol., 2012, no. 50 (11), pp. 3757-3759.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.