<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE article PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.3 20210610//EN" "JATS-journalpublishing1-3.dtd">
<article article-type="research-article" dtd-version="1.3" xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xml:lang="ru"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">tiblj</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="ru">Туберкулез и болезни легких</journal-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Tuberculosis and Lung Diseases</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn pub-type="ppub">2075-1230</issn><issn pub-type="epub">2542-1506</issn><publisher><publisher-name>Медицинские знания и технологии</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="doi">10.21292/2075-1230-2020-98-2-5-9</article-id><article-id custom-type="elpub" pub-id-type="custom">tiblj-1390</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="heading"><subject>Research Article</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="ru"><subject>ОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="en"><subject>ORIGINAL ARTICLES</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title>Распространенность и клинико-эпидемиологическое значение редких генотипов М. tuberculosis, выделенных от больных туберкулезом в Саратовской области</article-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>The prevalence, clinical and epidemiological significance of rare genotypes of M. tuberculosis isolated from tuberculosis patients in Saratov Region</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Салина</surname><given-names>Т. Ю.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Salina</surname><given-names>T. Yu.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>доктор медицинских наук, доцент, профессор кафедры фтизиатрии</p><p>Тел.: + 7 (8452) 26-56-08   410012, г. Саратов, ул. Б. Казачья, д. 112 </p></bio><bio xml:lang="en"><p>Doctor of Medical Sciences, Associate Professor, Professor of Phthisiology Department</p><p>Phone: + 7 (8452) 26-56-08</p><p>112, B. Kazachya St., Saratov, 410012 </p></bio><email xlink:type="simple">meduniv@sgmu.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Морозова</surname><given-names>Т. И.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Morozova</surname><given-names>T. I.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>доктор медицинских наук, профессор, заведующая кафедрой фтизиатрии</p><p>Тел./факс: + 7 (8452) 26-16-90 E-mail: </p><p>410012, г. Саратов, ул. Б. Казачья, д. 112 </p></bio><bio xml:lang="en"><p>Doctor of Medical Sciences, Professor, Head of Phthisiology Department</p><p>Phone/Fax: + 7 (8452) 26-16-90 112, B. Kazachya St., Saratov, 410012 </p></bio><email xlink:type="simple">dispans@san.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff-1"><aff xml:lang="ru"><institution>ФГБОУ ВО «Саратовский государственный медицинский университет им. В. И. Разумовского» МЗ РФ</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>V.I. Razumovsky Saratov State Medical University</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><pub-date pub-type="collection"><year>2020</year></pub-date><pub-date pub-type="epub"><day>10</day><month>03</month><year>2020</year></pub-date><volume>98</volume><issue>2</issue><fpage>5</fpage><lpage>9</lpage><permissions><copyright-statement>Copyright &amp;#x00A9; Салина Т.Ю., Морозова Т.И., 2020</copyright-statement><copyright-year>2020</copyright-year><copyright-holder xml:lang="ru">Салина Т.Ю., Морозова Т.И.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="en">Salina T.Y., Morozova T.I.</copyright-holder><license xml:lang="ru" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.</license-p></license><license xml:lang="en" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.</license-p></license></permissions><self-uri xlink:href="https://www.tibl-journal.com/jour/article/view/1390">https://www.tibl-journal.com/jour/article/view/1390</self-uri><abstract><sec><title>Цель</title><p>Цель: выявить роль и клинико-эпидемиологическое значение редких генотипов М. tuberculosis (МБТ) в эпидемиологии туберкулеза (ТБ) Саратовской области.</p></sec><sec><title>Материалы</title><p>Материалы. Методом сполиготипирования и гибридизации на биологическом микрочипе с применением набора «Сполиго-биочип» (ООО «БИОЧИП-ИМБ», Москва) исследованы образцы мокроты 353 больных впервые выявленным ТБ легких, постоянных жителей 20 городов и районов Саратовской области.</p></sec><sec><title>Результаты</title><p>Результаты. Популяция МБТ, циркулирующая среди обследованных больных ТБ, гетерогенна и представлена 13 генотипами (Beijing, Beijing-like, Haarlem, Ural, LAM, T, Manu, Microti, Rus 1, Cas, EAI, Canetti, AFRI). Редкие генотипы (EAI, Manu, Microti, Rus 1, Cas, AFRI, Canetti) обнаружены у 42/353 (11,9%) пациентов, из них генотип EAI выявлен у 8 (2,3%), Manu – у 14 (3,9%), Microti – у 13 (3,7%), Cas – у 2 (0,57%), Rus 1 – у 1 (0,28%), Canetti – у 3 (0,85%), AFRI – у 1 (0,28%). Случаи ТБ, вызванного МБТ генотипа Microti, отличались эндемичностью и характеризовались гомогенностью выявленных сполиготипов (SIT 539). Изоляты генотипа Manu зарегистрированы только у мужчин (100%), преимущественно проживающих в сельской местности (71,4%), и характеризовались большой гетерогенностью SIT (1195, 1485, 1460, 1482, 1088). ТБ, вызванный генотипом EAI, характеризовался меньшим количеством деструктивных форм и бактериовыделения и также большой гетерогенностью SIT (300, 1431, 1428, 924, 622, 192). МБТ генотипов Cas, Canetti, R представлены единичными случаями.  </p></sec></abstract><trans-abstract xml:lang="en"><sec><title>The objective</title><p>The objective: to identify the role, clinical and epidemiological significance of rare genotypes of M. tuberculosis (MTB) in the epidemiology of tuberculosis in Saratov Region.</p></sec><sec><title>Materials</title><p>Materials. The spoligotyping and hybridization method by the Spoligo-biochip kit (BIOCHIP-IMB OOO, Moscow) was used to examine sputum samples of 353 patients with newly diagnosed pulmonary TB, who were permanent residents of 20 cities and districts of Saratov Region.</p></sec><sec><title>Results</title><p>Results. MTB population circulating in the examined TB patients was heterogeneous and represented by 13 genotypes (Beijing, Beijing-like, Haarlem, Ural, LAM, T, Manu, Microti, Rus 1, Cas, EAI, Canetti, AFRI). Rare genotypes (EAI, Manu, Microti, Rus 1, Cas, AFRI, Canetti) were found in 42/353 (11.9%) patients, of which EAI genotype was found in 8 patients (2.3%), Manu in 14 ( 3.9%), Microti - 13 (3.7%), Cas - 2 (0.57%), Rus 1 - 1 (0.28%), Canetti - 3 (0.85%) , and AFRI - in 1 (0.28%). Tuberculosis cases caused by the Microti genotype were endemic and characterized by homogeneity of the revealed spoligotypes (SIT 539). Isolates of the Manu genotype were registered only in men (100%), mainly living in rural areas (71.4%) and were characterized by a high heterogeneity of SIT (1195, 1485, 1460, 1482, 1088). Tuberculosis caused by the EAI genotype was characterized by a smaller number of destructive forms and forms with bacterial excretion, and high SIT heterogeneity (300, 1431, 1428, 924, 622, 192). There were single cases of the Cas, Canetti, and R genotypes. </p></sec></trans-abstract><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>микобактерии туберкулеза</kwd><kwd>редкие генотипы</kwd><kwd>сполиготипирование</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="en"><kwd>tuberculosis mycobateria</kwd><kwd>genotypes</kwd><kwd>spoligotyping</kwd></kwd-group></article-meta></front><back><ref-list><title>References</title><ref id="cit1"><label>1</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Василенко Н. В., Будрицкий А. М. Современные взгляды на генетические семейства M. tuberculosis // Вестник ВГМУ. ‒ 2014. ‒ Т. 13, № 5. ‒ С. 16-22.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Vasilenko N.V., Budritskiy А.M. Contemporary views on genetic families of M. tuberculosis. Vestnik VGMU, 2014, vol. 13, no. 5, pp. 16-22. (In Russ.)</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit2"><label>2</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Лиманская О. Ю. Видоспецифическая детекция микобактерий туберкулезного комплекса // Туб. и болезни легких. ‒ 2009. ‒ Т. 86, № 10. ‒ С. 49-55.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Limanskaya O.Yu. Species-specific detection of mycobacterium tuberculosis complex. Tuberculosis and Lung Diseases, 2009, vol. 86, no. 10, pp. 49-55. (In Russ.)</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit3"><label>3</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Прозоров А. А., Даниленко В. Н. Микобактерии туберкулезного комплекса: геномика, молекулярная эпидемиология, пути эволюции // Успехи современной биологии. ‒ 2011. ‒ Т. 131, № 3. ‒ С. 227-243.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Prozorov А.А., Danilenko V.N. Mycobacteria of tuberculous complex: genomics, molecular epidemiology, ways of evolution. Uspekhi Sovremennoy Biologii, 2011, vol. 131, no. 3, pp. 227-243. (In Russ.)</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit4"><label>4</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Савилов Е. Д., Синьков В. В., Огарков О. Б. Эпидемиология туберкулеза на Евро-Азиатском континенте: оценка глобального движения штаммов генотипа «Пекин» – Иркутск: РИО ГБОУ ДПО ИГМАПО, 2013. – 120 с.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Savilov E.D., Sinkov V.V., Ogarkov O.B. Epidemiologiya tuberkuleza na Evro-Aziatskom kontinente: otsenka globalnogo dvizheniya shtammov genotipa «Pekin» – Irkutsk. [Epidemiology of tuberculosis in Euro-Asian Continent: evaluation of global movement of strains of Beijing genotype – Irkutsk]. RIO GBOU DPO IGMAPO Publ., 2013, 120 p.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit5"><label>5</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Шитиков Е. А. Геномная вариабельность возбудителей лекарственноустойчивого туберкулеза, распространенных на территории Российской Федерации: Дис. … канд. биол. наук. ‒ М., 2014. – 123 с.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Shitikov E.А. Genomnaya variabelnost vozbuditeley lekarstvenno-ustoychivogo tuberkuleza, rasprostranennykh na territorii Rossiyskoy Federatsii. Diss. kand. biol. nauk. [Genomic complexity of drug resistant tuberculosis macybacteria prevalent on the territory of the Russian Federation. Cand. Diss.]. Moscow, 2014, 123 p.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit6"><label>6</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Шульгина М. В., Нарвская О. В., Мокроусов И. В., Васильева И. А. Патогенные и условно-патогенные микобактерии. ‒ М.: НЬЮ-ТЕРРА, 2018. ‒ 104 с.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Shulgina M.V., Narvskaya O.V., Mokrousov I.V., Vasilyeva I.А. Patogennye i uslovno-patogennye mikobakterii. [Pathogenic and opportunistic pathogenic mycobacteria]. Moscow, New Terra Publ., 2018, 104 p.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit7"><label>7</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Maguga-Phasha N. T. C., Manyai N. S., Mashinya F., Makgatho M. E., Mbajiorgu E. F. Cenetic diversity and distribution of Mycobacterium tuberculosis genotypes in Limpopo, South Africa // BMC Infect Dis. ‒ 2017. – Vol. 17, № 1. ‒ Р. 764. doi: 10.1186/s12879-017-2881-z. PubMed PMID: 2 8.9233106; PubMed Central PMCID: PMC5727936.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Maguga-Phasha N.T.C., Manyai N.S., Mashinya F., Makgatho M.E., Mbajiorgu E.F. Cenetic diversity and distribution of Mycobacterium tuberculosis genotypes in Limpopo, South Africa. BMC Infect Dis., 2017, vol. 17, no. 1, pp. 764. doi: 10.1186/s12879-017-2881-z. PubMed PMID: 2 8. 9233106; PubMed Central PMCID: PMC5727936.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit8"><label>8</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Michelet L., de Cruz К., Zanella G., Aaziz R., Bulach T., Karoui C., Henault S., Jouncour G, Boschiroli M. L. Infection with Micobacterium microti in Animals in France // J. Clin. Microbiol. ‒ 2015. ‒ Vol. 53, № 3. ‒ P. 981-985.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Michelet L., de Cruz К., Zanella G., Aaziz R., Bulach T., Karoui C., Henault S., Jouncour G, Boschiroli M.L. Infection with Micobacterium microti in Animals in France. J. Clin. Microbiol., 2015, vol. 53, no. 3, pp. 981-985.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit9"><label>9</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Panteix G., Gutierrez M. C., Boschiroli M. L., Rouviere M., Plaidy A., Pressac D., Porcheret H., Chyderiotis G., Ponsada M., Van Oortegem K., Salloum S., Cabuzel S., Bañuls A. L., Van de Perre P., Godreuil S. Pulmonary tuberculosis due to Mycobacterium microti: a study of six recent cases in France // J. Med. Microbiol. – 2010. ‒ № 59. – Р. 984-989.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Panteix G., Gutierrez M.C., Boschiroli M.L., Rouviere M., Plaidy A., Pressac D., Porcheret H., Chyderiotis G., Ponsada M., Van Oortegem K., Salloum S., Cabuzel S., Bañuls A.L., Van de Perre P., Godreuil S. Pulmonary tuberculosis due to Mycobacterium microti: a study of six recent cases in France. J. Med. Microbiol., 2010, no. 59, pp. 984-989.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit10"><label>10</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Singh U. B., Suresh N., Bhanu N. V., Arora J., Pant H., Sinha S., Aggarwal R. C., Singh S., Pande J. N., Sola C., Rastogi N., Seth P. Predominant Tuberculosis Spoligotypes, Delhi, India // Emerg. Infect. Dis. ‒ 2004. ‒ Vol. 10, № 6. ‒ P. 1138-1142.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Singh U.B., Suresh N., Bhanu N.V., Arora J., Pant H., Sinha S., Aggarwal R. C., Singh S., Pande J.N., Sola C., Rastogi N., Seth P. Predominant Tuberculosis Spoligotypes, Delhi, India. Emerg. Infect. Dis., 2004, vol. 10, no. 6, pp. 1138-1142.</mixed-citation></citation-alternatives></ref></ref-list><fn-group><fn fn-type="conflict"><p>The authors declare that there are no conflicts of interest present.</p></fn></fn-group></back></article>
