tibljТуберкулез и болезни легкихTuberculosis and Lung Diseases2075-12302542-1506Медицинские знания и технологии10.21292/2075-1230-2020-98-12-27-32tiblj-1490Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИORIGINAL ARTICLESОпределение роли полиморфных вариантов гена интерферона-гамма (IFNG) в развитии туберкулеза у лиц якутской национальностиDetermination of the role of polymorphic variants of the interferon-gamma gene (IFNG) in the development of tuberculosis in the Yakut populationМордовскаяЛ. И.MordovskayaL. I.

Мордовская Лариса Ивановна – заведующая иммунологической лабораторией

677005, Республика Саха (Якутия), г. Якутск, ул. П. Алексеева, д. 87/5Тел.: 8 (411) 240-24-43 

Larisa I. Mordovskaya – Head of Immunological Laboratory

87/5, P. Alekseev St., Yakutsk, Sakha Republic (Yakutia), 677005Phone: +7 (411) 240-24-43

limordovskaya@mail.ruЕгороваМ. В.EgorovaM. V.

Егорова Марина Васильевна – врач КЛД иммунологической лаборатории

677005, Республика Саха (Якутия), г. Якутск, ул. П. Алексеева, д. 87/5Тел.: 8 (411) 240-24-43

Marina V. Egorova – Clinical Pathologist of Immunological Laboratory

87/5, P. Alekseev St., Yakutsk, Sakha Republic (Yakutia), 677005Phone: +7 (411) 240-24-43

https://orcid.org/0000-0003-2746-0608КлимоваТ. М.KlimovaT. M.

Климова Татьяна Михайловна – кандидат медицинских наук, доцент кафедры фармакологии и фармации

677013, Республика Саха (Якутия), г. Якутск, ул. Ойунского, д. 27Тел.: 8 (411) 249-66-23

Tatyana M. Klimova – Candidate of Medical Sciences, Associate Professor of Pharmacology and Pharmacy Department

27, Oyunskogo St., Yakutsk, Sakha Republic (Yakutia), 677013Phone: +7 (411) 249-66-23

biomedykt@mail.ruАлексееваС. Д.АlekseevaS. D.

Алексеева Светлана Дмитриевна – врач КЛД иммунологической лаборатории

677005, Республика Саха (Якутия), г. Якутск, ул. П. Алексеева, д. 87/5Тел.: 8 (411) 240-24-43

Svetlana D. Аlekseeva – Clinical Pathologist of Immunological Laboratory

87/5, P. Alekseev St., Yakutsk, Sakha Republic (Yakutia), 677005Phone: +7 (411) 240-24-43

immlab@mail.ruГБУ РС (Я) «Научно-практический центр "Фтизиатрия"»; Медицинский институт ФГАОУ ВО «Северо-Восточный федеральный университет им. М. К. Аммосова»РоссияScientific Practical Phthisiology Center; Institute of Medicine at M. K. Ammosov North-Eastern Federal UniversityRussian FederationГБУ РС (Я) «Научно-практический центр "Фтизиатрия"»РоссияScientific Practical Phthisiology CenterRussian FederationМедицинский институт ФГАОУ ВО «Северо-Восточный федеральный университет им. М. К. Аммосова»; Якутский научный центр комплексных медицинских проблемРоссияInstitute of Medicine at M. K. Ammosov North-Eastern Federal University; Yakut Science Center of Complex Medical ProblemsRussian Federation20201801202198122732Copyright © Мордовская Л.И., Егорова М.В., Климова Т.М., Алексеева С.Д., 20212021Мордовская Л.И., Егорова М.В., Климова Т.М., Алексеева С.Д.Mordovskaya L.I., Egorova M.V., Klimova T.M., Аlekseeva S.D.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.tibl-journal.com/jour/article/view/1490Цель исследования

Цель исследования: определение роли полиморфных вариантов Т6000А (rs2430561), Т8360C (rs2069718) гена IFNG в развитии туберкулеза у лиц якутской национальности.

Материал и методы

Материал и методы. Дизайн исследования – случай-контроль. Материалом для исследования послужили образцы ДНК 172 больных туберкулезом (группа «случай») и 367 человек с исключенным диагнозом туберкулеза (группа «контроль»). Все участники исследования ‒ лица якутской национальности. Для генотипирования выделена ДНК из венозной крови. Генотипирование проводили методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени. Для статистической обработки использовали критерий χ2 Пирсона и отношение шансов с 95%-ными доверительными интервалами.

Результаты исследования показали, что распределение генотипов полиморфизмов Т6000А (rs2430561), Т8360C (rs2069718) гена IFNG в группах «случай» и «контроль» соответствовало равновесию Харди ‒ Вайнберга. Частоты аллелей и генотипов полиморфизмов Т6000А (rs2430561), T8360C (rs2069718) гена IFNG у больных групп «случай» и «контроль» статистически значимо не отличались.

Выводы

Выводы. Результаты исследования не выявили ассоциации аллелей и генотипов полиморфных вариантов rs2430561 и rs2069718 гена IFNG с риском развития туберкулеза для лиц якутской национальности.

The objective of the study: to determine the role of polymorphic variants T6000A (rs2430561), T8360C (rs2069718) of the IFNG gene in the development of tuberculosis in the population of Yakut nationality.

Subjects and methods

Subjects and methods. The case-control study was conducted. The subject for the study was DNA samples from 172 tuberculosis patients (the case group) and 367 people with an excluded diagnosis of tuberculosis (the control group). All participants of the study belonged to Yakut nationality. For genotyping, DNA was isolated from venous blood. The genotyping was performed by real-time polymerase chain reaction. For statistical processing, Pearson's χ2 test and odds ratio with 95% confidence intervals were used.

The results of the study showed that the distribution of genotypes of polymorphisms T6000A (rs2430561), T8360C (rs2069718) of the IFNG gene in the case and control groups corresponded to the Hardy – Weinberg equilibrium. There was no statistically significant difference in frequencies of alleles and genotypes of polymorphisms T6000A (rs2430561), T8360C (rs2069718) of the IFNG gene in the patients from the case and control groups.

Conclusions

Conclusions. The results of the study did not reveal the association of alleles and genotypes of the rs2430561 and rs2069718 polymorphic variants of the IFNG gene with the risk of developing tuberculosis for people of Yakut nationality.

туберкулезполиморфизмген IFNGякутская популяцияtuberculosispolymorphismIFNG geneYakut populationReferencesАвербах М. М. Влияние полиморфизмов генов IFNγ и IL-10 на синтез цитокинов при туберкулезе легких у детей и подростков // Туб. и болезни легких. – 2011. – № 3. – С. 52-56.Averbakh M.M. Impact of IFN-γ and IL-10 gene polymorphism on cytokines synthesis in pulmonary tuberculosis in children and adolescents. Tuberculosis and Lung Diseases, 2011, no. 3. pp. 52-56. (In Russ.)Бабушкина Н. П., Рудко А. А., Фрейдин М. Б., Кучер А. Н., Пузырев В. П., Павлова Е. С., Алексеева Е. А., Лугинова Е. Ф., Горохов А. В., Кравченко А. Ф., Романов Н. Р. Изучение полиморфизма генов-кандидатов подверженности туберкулезу у разных этнотерриториальных групп Российской Федерации // Якутский медицинский журнал. – 2010. № 1 (29). – С. 35-39.Babushkina N.P., Rudko А.А., Freydin M.B., Kucher А.N., Puzyrev V.P., Pavlova E.S., Аlekseeva E.А., Luginova E.F., Gorokhov А.V., Kravchenko А.F., Romanov N.R. Study of polymorphism of candidate genes for susceptibility to tuberculosis in different ethnic territorial groups of the Russian Federation. Yakutsky Meditsinsky Journal, 2010, no. 1 (29), pp. 35-39. (In Russ.)Бикмаева А. Р., Сибиряк С. В., Хуснутдинова Э. К. Генетический полиморфизм GSTM, CYP1A1 и CYP2E1 у больных инфильтративным туберкулезом легких (ИТЛ): возможная ассоциация с иммунологическими нарушениями // Медицинская иммунология. – 2002. – Т. 4, № 2. – С. 229.Bikmaeva А.R., Sibiryak S.V., Khusnutdinova E.K. Genetic polymorphism of GSTM, CYP1A1 and CYP2E1 in patients with infiltrative pulmonary tuberculosis: a possible association with immunological disorders. Meditsinskaya Immunologiya, 2002, vol. 4, no. 2, pp. 229. (In Russ.)Никулина Е. Л. Аллельный полиморфизм гена при туберкулезе легких // Медицинская иммунология. – 2010. – Т. 12, № 3. – С. 259-264.Nikulina E.L. Allelic gene polymorphism in pulmonary tuberculosis. Meditsinskaya Immunologiya, 2010, vol. 12, no. 3, pp. 259-264. (In Russ.)Пузырев В. П., Фрейдин М. Б., Рудко А. А., Стрелис А. К., Колоколова О. В. Анализ взаимосвязи полиморфных маркеров генов NRAMP1 и IL-12р40 и туберкулеза // Медицинская генетика – 2002. – Т. 1, № 1. – С. 44-46.Puzyrev V.P., Freydin M.B., Rudko А.А., Strelis А.K., Kolokolova O.V. Analysis of the relationship between polymorphic markers of the NRAMP1 and IL-12p40 genes and tuberculosis. Meditsinskaya Genetika, 2002, vol. 1, no. 1, pp. 44-46. (In Russ.)Синьков В. В., Огарков О. Б., Зоркальцева Е. Ю., Скворцова Р. Г., Савилов Е. Д., Воробьева Д. В., Корчина С. И., Жданова С. Н., Косенкова Д. В., Медведева Т. В. Полиморфизм генов DC–SIGN –336 A/G, MCP1 –2518 A/G и INFγ +874 A/T у больных легочным туберкулезом в Иркутской области // Сибирский медицинский журнал. – 2009. – № 7. – С. 30-33.Sinkov V.V., Ogarkov O.B., Zorkaltseva E.Yu., Skvortsova R.G., Savilov E.D., Vorobieva D.V., Korchina S.I., Zhdanova S.N., Kosenkova D.V., Medvedeva T.V. Polymorphism of genes DC–SIGN –336 A/G, MCP1–2518 A/G and INFγ +874 A/T in patients with pulmonary tuberculosis in Irkutsk Region. Sibirsky Meditsinsky Journal, 2009, no. 7, pp. 30-33. (In Russ.)Ansari A., Hasan Z., Dawood G. Differential combination of cytokine and interferon-gamma +874 T/A polymorphisms determines disease severity in pulmonary tuberculosis // PLoS ONE. – 2011. № – 6. – P. 1-5.Ansari A., Hasan Z., Dawood G. Differential combination of cytokine and interferon-gamma +874 T/A polymorphisms determines disease severity in pulmonary tuberculosis. PLoS ONE, 2011, no. 6, pp. 1-5.Asgharzadeh M., Ghorghanlu S., Rashedi J. Association of promoter polymorphisms of interleukin-10 and interferon-gamma genes with tuberculosis in Azeri population of Iran // Iran. J. Allergy Asthma Immunol. 2016. – Vol. 15, № 3. – P. 167-173.Asgharzadeh M., Ghorghanlu S., Rashedi J. Association of promoter polymorphisms of interleukin-10 and interferon-gamma genes with tuberculosis in Azeri population of Iran. Iran. J. Allergy Asthma Immunol., 2016, vol. 15, no. 3, pp. 167-173.Baghdadi J. El., Grant A.V., Sabri A. Human genetics of tuberculosis // Pathol Biol. – 2013. – Vol. 61, № 1. – P. 11-16.Baghdadi J.El., Grant A.V., Sabri A. Human genetics of tuberculosis. Pathol. Biol., 2013, vol. 61, no. 1, pp. 11-16.Cellier M., Govoni G., Vidal S. Human natural resistance-associated macrophage protein: cDNA cloning, chromosomal mapping, genomic organization and tissue-specific expression // J. Exp. Med. – 1994. – № 180. – P. 1741-1752.Cellier M., Govoni G., Vidal S. Human natural resistance-associated macrophage protein: cDNA cloning, chromosomal mapping, genomic organization and tissue-specific expression. J. Exp. Med., 1994, no. 180, pp. 1741-1752.Cooper A. M., Dalton D. K., Stewart T. A., Griffin J. P., Russell D. G., Orme I. M. Disseminated tuberculosis in interferon gamma gene-disrupted mice // J. Exp. Med. – 1993. – № 178. – P. 2243-2247.Cooper A.M., Dalton D.K., Stewart T.A., Griffin J.P., Russell D.G., Orme I.M. Disseminated tuberculosis in interferon gamma gene-disrupted mice. J. Exp. Med., 1993, no. 178, pp. 2243-2247.de Albuquerque A.C., Rocha L.Q., de Morais Batista A.H. Association of polymorphism +874 A/T of interferon-gamma and susceptibility to the development of tuberculosis: meta-analysis // Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. – 2012. – № 31. – P. 2887-2895.de Albuquerque A.C., Rocha L.Q., de Morais Batista A.H. Association of polymorphism +874 A/T of interferon-gamma and susceptibility to the development of tuberculosis: meta-analysis. Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis., 2012, no. 31, pp. 2887-2895.Etokebe G. E. Interferon-gamma gene (T874A and G2109A) polymorphisms are associated with microscopy-positive tuberculosis // Scand. J. Immunol. 2006. – № 63. – P. 136-141.Etokebe G.E. Interferon-gamma gene (T874A and G2109A) polymorphisms are associated with microscopy-positive tuberculosis. Scand. J. Immunol., 2006, no. 63, pp. 136-141.Lee S. W., Chuang T. Y., Huang H. H., Lee K. F., Chen T. T., Kao Y. H., Wu L. S. Interferon gamma polymorphisms associated with susceptibility to tuberculosis in a Han Taiwanese population // J. Microbiol. Immunol. Infect. – 2015. Vol. 48, № 4. – P. 376-80.Lee S.W., Chuang T.Y., Huang H.H., Lee K.F., Chen T.T., Kao Y.H., Wu L.S. Interferon gamma polymorphisms associated with susceptibility to tuberculosis in a Han Taiwanese population. J. Microbiol. Immunol. Infect., 2015, vol. 48, no. 4, pp. 376-80.Li J., Zhou Y., Zhang H. Association of IFNG gene polymorphisms with pulmonary tuberculosis but not with spinal tuberculosis in a Chinese Han population // Microb. Pathog. – 2017. – № 111. – P. 238-243. – Doi: 10.1016/j.micpath.2017.08.054.Li J., Zhou Y., Zhang H. Association of IFNG gene polymorphisms with pulmonary tuberculosis but not with spinal tuberculosis in a Chinese Han population. Microb. Pathog., 2017, no. 111, pp. 238-243. – Doi: 10.1016/j.micpath.2017.08.054.Shen C., Jiao W. W., Feng W. X. IFNG polymorphisms are associated with tuberculosis in Han Chinese pediatric female population // Mol. Biol. Rep. 2013. – № 40. – Р. 5477-5482.Shen C., Jiao W.W., Feng W.X. IFNG polymorphisms are associated with tuberculosis in Han Chinese pediatric female population. Mol. Biol. Rep., 2013, no. 40, pp. 5477-5482.Shibasaki M., Yagi T., Yatsuya H. An influence of interferon-gamma gene polymorphisms on treatment response to tuberculosis in Japanese population // J. Infect. – 2009. – Vol. 58, № 6. – P. 467-469. – doi: 10.1016/j.jinf.2009.04.002.Shibasaki M., Yagi T., Yatsuya H. An influence of interferon-gamma gene polymorphisms on treatment response to tuberculosis in Japanese population. J. Infect., 2009, vol. 58, no. 6, pp. 467-469. doi: 10.1016/j.jinf.2009.04.002.Strachan D. P., Powell K. J., Thaker A. Vegetarian diet as a risk factor for tuberculosis in immigrant south London Asians // Thorax. – 1995. – № 50. P. 175-180.Strachan D.P., Powell K.J., Thaker A. Vegetarian diet as a risk factor for tuberculosis in immigrant south London Asians. Thorax, 1995, no. 50, pp. 175-180.Wei Z., Wenhao S., Yuanyuan M. A single nucleotide polymorphism in the interferon-gamma gene (IFNG+874 T/A) is associated with susceptibility to tuberculosis // Oncotarget. – 2017. – Vol. 8, № 31. – P. 50415-50429. – doi: 10.18632/oncotarget.17304.Wei Z., Wenhao S., Yuanyuan M. A single nucleotide polymorphism in the interferon-gamma gene (IFNG+874 T/A) is associated with susceptibility to tuberculosis. Oncotarget. 2017, vol. 8, no. 31, pp. 50415-50429. doi: 10.18632/oncotarget.17304.Yerezhepov D., Zhabagin A., Askapuli A. Genetic diversity of IFgamma, IL1beta, TLR2 and TLR8 loci in pulmonary tuberculosis in Kazakhstan // Cent. Asian. J. Glob. Health. – 2014. – Vol. 12, № 3. – P. 181. Doi:10.5195/cajgh.2014.181.Yerezhepov D., Zhabagin A., Askapuli A. Genetic diversity of IFgamma, IL1beta, TLR2 and TLR8 loci in pulmonary tuberculosis in Kazakhstan. Cent. Asian. J. Glob. Health., 2014, vol. 12, no. 3, pp. 181, Doi:10.5195/cajgh.2014.181.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.