tibljТуберкулез и болезни легкихTuberculosis and Lung Diseases2075-12302542-1506Медицинские знания и технологии10.21292/2075-1230-2021-99-1-41-47tiblj-1501Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИORIGINAL ARTICLESРезультаты лечения новых случаев туберкулеза легких в зависимости от основных генотипов Mycobacterium tuberculosisв Республике Саха (Якутия)Treatment outcomes in new pulmonary tuberculosis cases depending on the main genotypes of Mycobacterium tuberculosis in the Republic of Sakha (Yakutia)ЕвдокимоваН. Е.EvdokimovN. E.

Евдокимова Надежда Евстафьевна - врач-ординатор отделения терапии туберкулеза легких.

677015, Якутск, ул. П. Алексеева, д. 93, Тел.: +7 (4112) 44-80-33

Nadezhda E. Evdokimova - Resident Physician of Pulmonary Tuberculosis Treatment Department.

93, P. Alekseev St., Yakutsk, 677015, Phone: +7 (4112) 44-80-33

Nadya_evdok@mail.ruВинокуроваМ. К.VinokurovаM. K.

Винокурова Мария Константиновна - доктор медицинских наук, заместитель директора по науке.

677015, Якутск, ул. П. Алексеева, д. 93, Тел.: +7 (4112) 39-03-30

Maria K. Vinokurova - Doctor of Medical Sciences, Deputy Director for Research.

mkvin61@mail.ruЖдановаС. Н.ZhdаnovаS. N.

Жданова Светлана Николаевна - доктор медицинских наук, старший научный сотрудник лаборатории эпидемиологически и социально значимых инфекций.

Svetlana N. Zhdanova - Doctor of Medical Sciences, Senior Researcher of the Laboratory of Epidemiologically and Socially Important Diseases.

svetnii@mail.ruОгарковО. Б.OgаrkovO. B.

Огарков Олег Борисович - доктор медицинских наук, главный научный сотрудник, заведующий отделом эпидемиологии и микробиологии.

Oleg B. Ogarkov - Doctor of Medical Sciences, Senior Researcher, Head of Epidemiology and Microbiology Department.

16, Timiryazeva St., Irkutsk, 664003, Phone: +7 (3952) 20-73-67

obogarkov@mail.ruКравченкоА. Ф.KrаvchenkoA. F.

Кравченко Александр Федорович - доктор медицинских наук, директор.

677015, Якутск, ул. П. Алексеева, д. 93, Тел.: +7 (4112) 47-51-59

Aleksandr F. Kravchenko - Doctor of Medical Sciences, Director.

93, P. Alekseev St., Yakutsk, 677015, Phone: +7 (4112) 47-51-59

kravchenkoaf@tub.ykt.ruСавиловЕ. Д.SаvilovE. D.

Савилов Евгений Дмитриевич - доктор медицинских наук, профессор, главный научный сотрудник лаборатории эпидемиологически и социально значимых инфекций.

Evgeniy D. Savilov - Doctor of Medical Sciences, Professor, Chief Researcher of the Laboratory of Epidemiologically and Socially Important Diseases.

16, Timiryazeva St., Irkutsk, 664003, Phone: +7 (3952) 33-34-23

savilov47@gmail.comГБУ РС (Я) Научно-практический центр ФтизиатрияРоссияScientific Practical Phthisiology CenterRussian FederationГБУ РС (Я) Научно-практический центр Фтизиатрия; ФГАОУ ВО Северо-Восточный федеральный университет им. М.К. АммосоваРоссияScientific Practical Phthisiology Center; M.K. Ammosov Medical Institute of North-Eastern Federal UniversityRussian FederationГБНУ Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человекаРоссияResearch Center of Family Health and Reproduction ProblemsRussian FederationГБНУ Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека; Иркутская государственная медицинская академия последипломного образования - филиал ФГБОУ ДПО Российская медицинская академия непрерывного профессионального образованияРоссияResearch Center of Family Health and Reproduction Problems; Irkutsk State Medical Academy of Postgraduate Education - Branch of Russian Medical Academy of Continuing Professional EducationRussian Federation2021020220219914147Copyright © Евдокимова Н.Е., Винокурова М.К., Жданова С.Н., Огарков О.Б., Кравченко А.Ф., Савилов Е.Д., 20212021Евдокимова Н.Е., Винокурова М.К., Жданова С.Н., Огарков О.Б., Кравченко А.Ф., Савилов Е.Д.Evdokimov N.E., Vinokurovа M.K., Zhdаnovа S.N., Ogаrkov O.B., Krаvchenko A.F., Sаvilov E.D.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.tibl-journal.com/jour/article/view/1501Цель исследования

Цель исследования: изучить эффективность лечения впервые выявленных больных туберкулезом легких в зависимости от генотипов M. tuberculosis в Республике Саха (Якутия).

Материалы и методы

Материалы и методы. Изучены клиническое течение и исходы 312 бактериологически подтвержденных впервые выявленных случаев туберкулеза легких у пациентов, госпитализированных в 2010-2014 гг. Молекулярно-генетические исследования включали делеционный анализ RD105 и RD207 регионам ДНК возбудителя с последующим MIRU-VNTR-генотипированием по 24 локусам.

Результаты

Результаты. В Республике Саха (Якутия) эпидемическое значение имеют генотипы Beijing и S, которые доминируют по распространенности лекарственной устойчивости возбудителя заболевания. Туберкулез, вызванный генотипом Beijing, имел в 30,6% случаев множественную (МЛУ) и широкую лекарственную устойчивость (ШЛУ), его субтип CC2/W148 - 85,3%. Генотип S сопровождался МЛУ/ШЛУ в 69,7% случаев, субтип S256 - в 78,9%. При лечении пациентов достигнута высокая эффективность по критериям прекращения бактериовыделения (92%) и закрытия полостей распада (89,4%). Наиболее низкие показатели определены при туберкулезе, вызванном генотипами Bejing и S, за счет их субтипов CC2/W148 и S256. Клиническое излечение впервые выявленного туберкулеза легких, вызванного генотипом Bejing, достигнуто в 73,4% случаев, субтипом CC2/W148 - в 41,2% при значимо более высокой доле пациентов с неэффективным исходом и умерших от туберкулеза, чем при других представителях этого генотипа. При генотипе S клинического излечения удалось достигнуть у 72,7% пациентов, без значимого отличия частоты неблагоприятных исходов у пациентов с субтипом S256.

The objective

The objective: to study treatment efficacy in new pulmonary tuberculosis patients depending on the genotypes of M. tuberculosis in the Republic of Sakha (Yakutia).

Subjects and methods

Subjects and methods. The authors studied the clinical course and outcomes of 312 bacteriologically confirmed new pulmonary tuberculosis cases among patients admitted to hospital in 2010-2014. Molecular genetic tests included deletion analysis of RD105 and RD207 regions of DNA of the pathogen followed by MIRU-VNTR genotyping at 24 loci.

Results

Results. In the Republic of Sakha (Yakutia), the Bejing and S genotypes are of epidemic importance, these genotypes prevail among drug resistance mycobacteria. Tuberculosis caused by the Bejing genotype had multiple (MDR) and extensive drug resistance (XDR) in 30.6% of cases, its subtype CC2/W148 - in 85.3%. The S genotype was accompanied by MDR/XDR in 69.7% of cases, subtype S256 - in 78.9%. The treatment of patients was highly efficient according to the criteria of sputum conversion (92%) and cavities healing (89.4%). The lowest rates were observed in case of tuberculosis caused by the Bejing and S genotypes due to their subtypes CC2/W148 and S256. Clinical cure of new pulmonary tuberculosis caused by the Bejing genotype was achieved in 73.4% of cases, by subtype CC2/W148 - in 41.2% with a significantly higher proportion of treatment failures and lethal outcomes of tuberculosis than in other subtypes of this genotype. With the S genotype, the clinical cure was achieved in 72.7% of patients, with no significant difference in the incidence of unfavorable outcomes in patients with subtype S256.

туберкулез легкихгенотипы Mycobacterium tuberculosisсубтип CC2/W148субтип S256впервые выявленные больныеисходы туберкулезаpulmonary tuberculosisgenotypes of Mycobacterium tuberculosissubtype CC2/W148subtype S256new patientstuberculosis outcomesReferencesАлексеева Г. И., Астафьев В. А., Винокуров И. И. и др. Туберкулез: эпидемиология и организация борьбы в современных условиях Крайнего Севера (на примере Республики Саха (Якутия)). - Новосибирск: Наука, 2015. - 196 с.Alekseeva G.I., Astafiev V.A., Vinokurov I.I. et al. Tuberkulez: epidemiologiya i organizatsiya borby v sovremennykh usloviyakh Kraynego Severa (na primere Respubliki Sakha (Yakutiya). [Tuberculosis: epidemiology and organization of control in the modern conditions of the High North (on the example of the Republic of Sakha (Yakutia)]. Novosibirsk, Nauka Publ., 2015, 196 p.Бадлеева М. В., Жданова С. Н., Баасансурэн Э., Огарков О. Б., Эрдэнэ-гэрэл Н., Орлова Е. А., Оюунтуяа Т., Савилов Е. Д., Буянхишиг Б., Пун-цаг Б., Нямхуу Д. Молекулярно-генетические особенности туберкулеза в Монголии и граничащих с ней регионах России // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. - 2017. - Т. 16, № 5 (96). - С. 53-57.Badleeva M.V., Zhdanova S.N., Baasansuren H., Ogarkov O.B., Erdehnehgeh-rehl N., Orlova E.A., Oyuuntuyaa T., Savilov E.D., Buyankhishig B., Puntsag B., Nyamkhuu D. Molecular genetic characteristics of tuberculosis in Mongolia and neighboring regions of Russia. Epidemiologiya i Vaktsionoprofilaktika, 2017, vol. 16, no. 5 (96), pp. 53-57. (In Russ.)Жданова С. Н. Молекулярно-эпидемиологическое исследование распространения основных генотипов возбудителя туберкулеза в Северной Азии: автореф. дис. ... д-ра мед. наук. - Иркутск, 2018. - 48 с.Zhdanova S.N. Molekulyarno-epidemiologicheskoe issledovanie rasprostraneniya osnovnykh genotipov vozbuditelya tuberkuleza v Severnoy Azii. Avtoref dis. dokt. med. nauk. [The molecular epidemiological study of transmission of main genotypes of M. tuberculosis in the Northern Asia. Synopsis of Doct. Diss.]. Irkutsk, 2018, 48 p.Жданова С. Н., Огарков О. Б., Винокурова М. К., Алексеева Г. И., Кравченко А. Ф., Савилов Е. Д. Моделирование эпидемического распространения генотипа Beijing Mycobacterium tuberculosis в Республике Саха (Якутия) // Туб. и болезни легких. - 2017. - № 7. - С. 40-48.Zhdanova S.N., Ogarkov O.B., Vinokurova M.K., Alekseeva G.I., Kravchenko A.F., Savilov E.D. Simulation of epidemic transmission of Mycobacterium tuberculosis of the Beijing genotype in the Sakha Republic (Yukutia). Tuberculosis and Lung Diseases, 2017, no. 7, pp. 40-48. (In Russ.)Кальф-Калиф Я. Я. Лейкоцитарный индекс интоксикации // Врачебное дело. - 1941. - № 1. - С. 31-33.Kalf-Kalif Ya.Ya. Leukocyte index of intoxication. Vrachebnoye Delo, 1941, no. 1, pp. 31-33. (In Russ.)Casali N., Nikolayevskyy V., Balabanova Y., Harris S. R., Ignatyeva O., Kontsevaya I., Corander J., Bryant J., Parkhill J., Nejentsev S., Horstmann R. D., Brown T., Drobniewski F. Evolution and transmission of drug-resistant tuberculosis in a Russian population // Nat Genet. - 2014. - 46. - Р. 279-286. doi: 10.1038/ng.2878.Casali N., Nikolayevskyy V., Balabanova Y., Harris S.R., Ignatyeva O., Kontsevaya I., Corander J., Bryant J., Parkhill J., Nejentsev S., Horstmann R.D., Brown T., Drobniewski F. Evolution and transmission of drug-resistant tuberculosis in a Russian population. Nat. Genet., 2014, 46, pp. 279-286. doi: 10.1038/ng.2878.Couvin D., Rastogi N. Tuberculosis - a global emergency: tools and methods to monitor, understand, and control the epidemic with specific example of the Beijing lineage // Tuberculosis (Edinb). - 2015. - Vol. 95, Suppl. 1. - P. S177-189. doi: 10.1016/j.tube.2015.02.023.Couvin D., Rastogi N. Tuberculosis - a global emergency: tools and methods to monitor, understand, and control the epidemic with specific example of the Beijing lineage. Tuberculosis (Edinb.), 2015, vol. 95, suppl. 1, pp. S177-189. doi: 10.1016/j.tube.2015.02.023.Dabernat H., Theves C., Bouakaze C. et al. Tuberculosis epidemiology and selection in an autochthonous Siberian population from the 16th-19th century // PLoS ONE. - 2014. - Vol. 9, № 2. - Р. e89877. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0089877.Dabernat H., Theves C., Bouakaze C. et al. Tuberculosis epidemiology and selection in an autochthonous Siberian population from the 16th-19th century. PLoS ONE, 2014, vol. 9, no. 2, pp. e89877. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0089877.de Steenwinkel J. E., ten Kate M. T., de Knegt G. J. et al. Drug susceptibility of Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype and association with MDR TB // Emerg Infect Dis. - 2012. - Vol. 18, № 4. - P. 660-663. DOI: 10.3201/eid1804.110912.de Steenwinkel J.E., ten Kate M.T., de Knegt G.J. et al. Drug susceptibility of My-cobacterium tuberculosis Beijing genotype and association with MDR TB. Emerg. Infect. Dis., 2012, vol. 18, no. 4, pp. 660-663. doi: 10.3201/eid1804.110912.Ford C. B., Shah R. R., Maeda M. K. et al. Mycobacterium tuberculosis mutation rate estimates from different lineages predict substantial differences in the emergence of drug-resistant tuberculosis // Nat Genet. - 2013. - Vol. 45, № 7. -Р. 784-790. doi: 10.1038/ng.2656.Ford C.B., Shah R.R., Maeda M.K. et al. Mycobacterium tuberculosis mutation rate estimates from different lineages predict substantial differences in the emergence of drug-resistant tuberculosis. Nat. Genet., 2013, vol. 45, no. 7, pp. 784-790. doi: 10.1038/ng.2656.Merker M., Blin C., Mona S. et al. Evolutionary history and global spread of the Mycobacterium tuberculosis Beijing lineage // Nat. Genet. - 2015. - Vol. 47, № 3. - P. 242-249. doi: 10.1038/ng.3195.Merker M., Blin C., Mona S. et al. Evolutionary history and global spread of the Mycobacterium tuberculosis Beijing lineage. Nat. Genet., 2015, vol. 47, no. 3, pp. 242-249. doi: 10.1038/ng.3195.Mokrousov I. Mycobacterium tuberculosis phylogeography in the context of human migration and pathogen's pathobiology: insights from Beijing and Ural families // Tuberculosis (Edinb). - 2015. - Vol. 95, Suppl. 1. - P. S167- S 176. DOI: 10.1016/j.tube.2015.02.031.Mokrousov I. Mycobacterium tuberculosis phylogeography in the context of human migration and pathogen's pathobiology: insights from Beijing and Ural families. Tuberculosis (Edinb.), 2015, vol. 95, suppl. 1, pp. S167- S176. doi: 10.1016/j.tube.2015.02.031.Pepperell C. S., Grank J. M., Alexander D. C. et al. Dispersal of Mycobacterium tuberculosis via the Canadian fur trade // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 2011. -Vol. 108, № 16. - P. 6526-6531. doi: 10.1073/pnas.1016708108.Pepperell C.S., Grank J.M., Alexander D.C. et al. Dispersal of Mycobacterium tuberculosis via the Canadian fur trade. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2011, vol. 108, no. 16, pp. 6526-6531. doi: 10.1073/pnas.1016708108.Shitikov E., Kolchenko S., Mokrousov I. et al. Evolutionary pathway analysis and unified classification of East Asian lineage of Mycobacterium tuberculosis // Sci Rep. - 2017. - Vol. 7, № 1. - P. 9227. doi:10.1038/s41598-017-10018-5.Shitikov E., Kolchenko S., Mokrousov I. et al. Evolutionary pathway analysis and unified classification of East Asian lineage of Mycobacterium tuberculosis. Sci. Rep., 2017, vol. 7, no. 1, pp. 9227. doi:10.1038/s41598-017-10018-5.Zhdanova S., Heysell S. K., Ogarkov O., Boyarinova G., Alexeeva G., Pholwat S., Zorkaltseva E., Houpt E. R., Savilov E. Primary multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis in 2 regions, Eastern Siberia, Russian Federation // Emerg. Infect. Dis. - 2013. - Vol. 19, № 10. - P. 1649-1652. doi: 10.3201/eid1910.121108.Zhdanova S., Heysell S.K., Ogarkov O., Boyarinova G., Alexeeva G., Pholwat S., Zorkaltseva E., Houpt E.R., Savilov E. Primary multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis in 2 regions, Eastern Siberia, Russian Federation. Emerg. Infect. Dis., 2013, vol. 19, no. 10, pp. 1649-1652. doi: 10.3201/eid1910.121108.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.