tibljТуберкулез и болезни легкихTuberculosis and Lung Diseases2075-12302542-1506Медицинские знания и технологии10.58838/2075-1230-2026-104-1-8-18tiblj-1940Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИORIGINAL ARTICLESВлияние химиотерапии лекарственно-устойчивого туберкулеза органов дыхания на состав микробиоты фекальных масс у детейThe Impact of Chemotherapy for Drug-Resistant Respiratory Tuberculosis on the Composition of Fecal Microbiota in Childrenhttps://orcid.org/0000-0002-9455-5597ЮхименкоН. В.YukhimenkoN. V.

Юхименко Наталья Валентиновна, д. м. н., ведущий научный сотрудник детско-подросткового отдела 

107564, Москва, Яузская аллея, д. 2

Tел.: +7 (499) 785-30-23

Natalya V. Yukhimenko, Doctor of Medical Sciences, Leading Researcher of Children and Adolescents Department

2 Yauzskaya Alleya, Moscow, 107564

Phone: +7 (499) 785-30-23

detstvocniit@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0001-9885-4108СтерликоваС. С.SterlikovaS. S.

Стерликова Светлана Сергеевна, врач младшего детского отделения

107564, Москва, Яузская аллея, д. 2

Tел.: +7 (499) 785-30-23

Svetlana S. Sterlikova, Physician of Junior Children Department

2 Yauzskaya Alleya, Moscow, 107564

Phone: +7 (499) 785-30-23

s.sterlikova@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0001-9724-9862ГубкинаМ. Ф.GubkinaM. F.

Губкина Марина Федоровна, д. м. н., главный научный сотрудник детско-подросткового отдела, профессор кафедры фтизиатрии

107564, Москва, Яузская аллея, д. 2

Tел.: +7 (499) 785-30-23

Marina F. Gubkina, Doctor of Medical Sciences, Head Researcher of Children and Adolescents Department, Professor of Phthisiology Department

2 Yauzskaya Alleya, Moscow, 107564

Phone: +7 (499) 785-30-23

detstvocniit@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0002-5233-3515КаюковаС. И.KayukovaS. I.

Каюкова Светлана Ивановна, д. м. н., ведущий научный сотрудник отдела иммунологии, профессор кафедры фтизиатрии

107564, Москва, Яузская аллея, д. 2

Tел.: +7 (499) 785-30-23

Sveltana I. Kayukova, Doctor of Medical Sciences, Leading Researcher of Immunology Department, Professor of Phthisiology Department

2 Yauzskaya Alleya, Moscow, 107564

Phone: +7 (499) 785-30-23

kajukovalnp@gmail.comhttps://orcid.org/0000-0003-3504-2406ДонниковА. Е.DonnikovA. E.

Донников Андрей Евгеньевич, к. м. н., заведующий лабораторией молекулярно-генетических методов, доцент кафедры клинической лабораторной диагностики, медицинской микробиологии и патологической анатомии Академии постдипломного образования ФГБУ ФНКЦ ФМБА России

117997, Москва, ул. Академика Опарина, д. 4

Tел.: +7 (495) 531-44-44

Andrey E. Donnikov, Candidate of Medical Sciences, Head of Laboratory of Molecular Genetic Methods, Associate Professor of Department of Clinical Laboratory Diagnostics, Medical Microbiology and Pathological Anatomy

4 Akademika Oparina St., Moscow, 117997

Phone: +7 (495) 531-44-44

a_donnikov@oparina4.ruФГБНУ «Центральный научно-исследовательский институт туберкулеза»РоссияCentral Tuberculosis Research InstituteRussian FederationФГБНУ «Центральный научно-исследовательский институт туберкулеза»; ФГАОУ ВО «Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И. Пирогова» МЗ РФРоссияCentral Tuberculosis Research Institute; Pirogov Russian National Research Medical University, Russian Ministry of HealthRussian FederationФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр акушерства, гинекологии и перинатологии им. акад. В.И. Кулакова» МЗ РФ; ФГБУ «Федеральный научно-клинический центр специализированных видов медицинской помощи и медицинских технологий Федерального медико-биологического агентства»РоссияV.I. Kulakov National Medical Research Center of Obstetrics, Gynecology and Perinatal Medicine, Russian Ministry of Health; Federal Scientific Clinical Center of Specialized Medical Care and Medical Technologies, Federal Medical Biological AgencyRussian Federation2026220320261041816Copyright © Юхименко Н.В., Стерликова С.С., Губкина М.Ф., Каюкова С.И., Донников А.Е., 20262026Юхименко Н.В., Стерликова С.С., Губкина М.Ф., Каюкова С.И., Донников А.Е.Yukhimenko N.V., Sterlikova S.S., Gubkina M.F., Kayukova S.I., Donnikov A.E.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.tibl-journal.com/jour/article/view/1940Цель исследования

Цель исследования: изучить видовой и количественный состав микробиоты фекальных масс у детей в процессе химиотерапии лекарственно-устойчивого туберкулеза органов дыхания.

Материалы и методы

Материалы и методы. В исследование включено 17 детей в возрасте 2–12 лет с туберкулезом органов дыхания, получавших лечение по поводу лекарственно-устойчивого туберкулеза органов дыхания в период с 2022 по 2024 гг. в ФГБНУ «ЦНИИТ». Исследование микробиоты фекальных масс проводилось методом ПЦР в режиме реального времени с использованием набора реагентов «ЭНТЕРОФЛОР®Дети» в сроки: до начала ХТ, через 2 и через 4 месяца ХТ.

Результаты

Результаты. Максимально выраженные нарушения микробиоценоза кишечника по представителям нормобиоты отмечены через 2 месяца ХТ, к 4 месяцам эти показатели не ухудшались как по количественному уровню, так и по частоте отклонений от референтных значений: для представителей филума Actinomycetota (Actinobacteria) – у Bifidobacterium spp. и Coriobacteriia, для представителей филума Bacteroidota (Bacteroidetes) – у Butyricimonas spp., Parabacteroides spp., Prevotella spp. Изменения в составе нормобиоты сопровождались увеличением доли условно-патогенной микробиоты к 2 мес. и сохранением этих значений к 4 мес. ХТ. Представители патогенной микробиоты, которых не было до начала ХТ, появились к 2 мес. ХТ с частотой: Streptococcus agalactiae – в 35,3% случаев, Clostridioides difficile, с генами токсигенности cdtА и cdtB – в 58,9%, и увеличением – до 71,5% к 4 мес. ХТ.

Заключение

Заключение. Применение режимов химиотерапии лекарственно-устойчивого туберкулеза статистически значимо отрицательно влияет на состояние микробиоты кишечника у детей: доля нормобиоты снижается, доля условно-патогенной микробиоты увеличивается, появляется патогенная микробиота.

The objective

The objective: to study the species and quantitative composition of fecal microbiota in children undergoing chemotherapy for drug-resistant respiratory tuberculosis.

Subjects and Methods

Subjects and Methods. The study included 17 children from 2 to 12 years old with respiratory tuberculosis who received treatment for drug-resistant respiratory tuberculosis from 2022 to 2024 at Central Tuberculosis Research Institute. Fecal microbiota was tested by real-time PCR using the ENTEROFLOR® Children reagent kit at the following time points: before the start of chemotherapy, after 2 and 4 months of chemotherapy.

Results

Results. The most pronounced disturbances in the intestinal microbiocenosis among representatives of normobiota were noted after 2 months of chemotherapy; by 4 months, those parameters did not deteriorate either in quantitative terms or frequency of deviations from reference values: for representatives of the phylum Actinomycetota (Actinobacteria) – in Bifidobacterium spp. and Coriobacteriia, for representatives of the phylum Bacteroidota (Bacteroidetes) – in Butyricimonas spp., Parabacteroides spp., Prevotella spp. Changes in the composition of normobiota were associated with the elevated proportion of opportunistic microbiota by 2 months and persistence of these values by 4 months of chemotherapy. Representatives of pathogenic microbiota, which were not present before chemotherapy, appeared by 2 months of chemotherapy with the following frequency: Streptococcus agalactiae – in 35.3% of cases, Clostridioides difficile, with the toxigenic genes cdtA and cdtB – in 58.9%, and increasing to 71.5% by 4 months of chemotherapy.

Conclusion

Conclusion. Treatment with chemotherapy regimens for drug-resistant tuberculosis has a statistically significant negative impact on intestinal microbiota in children: the proportion of normobiota decreases, the proportion of opportunistic microbiota increases, and pathogenic microbiota develops.

дисбиозмикробиота кишечникадетитуберкулез органов дыханияхимиотерапиялекарственно-устойчивый туберкулезЭНТЕРОФЛОР®Детиdysbiosisintestinal microbiotachildrenrespiratory tuberculosischemotherapydrug-resistant tuberculosisENTEROFLOR®ChildrenРабота выполнена в рамках НИОКТР ФГБНУ «ЦНИИТ» Рег. № 123061500085-1 «Комплексное лечение детей с впервые выявленным туберкулезом органов дыхания и дисбиозом кишечника».This research was carried out within the framework of the R&D program of Central Tuberculosis Research Institute, Reg. No. 123061500085-1 on Complex Treatment of Children with Newly Diagnosed Respiratory Tuberculosis and Intestinal Dysbiosis.ReferencesАрдатская М.Д. Роль низкомолекулярных метаболитов кишечной микробиоты в патогенезе, диагностике и профилактике колоректального рака // Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология. – 2017. – Т. 139, № 3. – С. 13-21.Ardatskaya M.D. The role of low molecular weight metabolites of the intestinal microbiota in the pathogenesis, diagnosis and prevention of colorectal cancer. Experimental and Clinical Gastroenterology, 2017, vol. 139, no. 3, pp. 13-21. (In Russ.)Туберкулез у детей. Клинические рекомендации. РОФ. – 2024. – URL: https://cr.minzdrav.gov.ru/view-cr/507_3. [Дата обращения 07.01.2025].Tuberkulez u detey. Klinicheskie rekomendatsii. [Tuberculosis in children. Guidelines]. RSP Publ., 2024. Available: https://cr.minzdrav.gov.ru/view-cr/507_3. Accessed January 7, 2025Усенко Д.В. Антибиотик-индуцированные изменения микробиома желудочно-кишечного тракта и их коррекция // РМЖ. – 2018. – Т. 26, № 2(II). – С. 96-99.Usenko D.V. Antibiotic-induced changes in the microbiota of the gastrointestinal tract and their correction. RMJ, 2018, vol. 26, no. 2 (II), pp. 96-99. (In Russ.)Chunxi L., Haiyue L., Yanxia L., Jianbing P., Jin S. The Gut Microbiota and Respiratory Diseases: New Evidence // J Immunol Res. – 2020. – № 1. – Р. 2340670. https://doi.org/10.1155/2020/2340670Chunxi L., Haiyue L., Yanxia L., Jianbing P., Jin S. The gut microbiota and respiratory diseases: new evidence. J. Immunol. Res., 2020, no. 1, pp. 2340670. https://doi.org/10.1155/2020/2340670Edlund C., Beyer G., Hiemer-Bau M., Ziege S., Lode H., Nord C.E. Comparative effects of moxifloxacin and clarithromycin on the normal intestinal microflora // Scand J Infect Dis. – 2000. – Vol. 32, № 1. – Р. 81-85. https://doi.org/10.1080/00365540050164272Edlund C., Beyer G., Hiemer-Bau M., Ziege S., Lode H., Nord C.E. Comparative effects of moxifloxacin and clarithromycin on the normal intestinal microflora. Scand. J. Infect. Dis., 2000, vol. 32, no. 1, pp. 81-85. https://doi.org/10.1080/00365540050164272Lode H., Von der Hоh N., Ziege S., et al. Ecological effects of linezolid versus amoxicillin/clavulanic acid on the normal intestinal microflora // Scand J Infect Dis. – 2001. – Vol. 33, № 12. – Р. 899-903.Lode H., Von der Hоh N., Ziege S. et al. Ecological effects of linezolid versus amoxicillin/clavulanic acid on the normal intestinal microflora. Scand. J. Infect. Dis., 2001, vol. 33, no. 12, pp. 899-903.Lynch S. The human intestinal microbiome in health and disease // The new England journal of medicine. – 2016. – Vol. 375, № 24. – P. 2369-2379. https://doi.org/10.1056/NEJMra1600266Lynch S. The human intestinal microbiome in health and disease. The New England Journal of Medicine, 2016, vol. 375, no. 24, pp. 2369-2379. https://doi.org/10.1056/NEJMra1600266Queen J., Zhang J., Sears C.L. Oral antibiotic use and chronic disease: long-term health impact beyond antimicrobial resistance and Clostridioides difficile // Gut Microbes. – 2020. – Vol. 11, № 4. – P. 1092-1103. https://doi.org/10.1080/19490976.2019.1706425Queen J., Zhang J., Sears C.L. Oral antibiotic use and chronic disease: long-term health impact beyond antimicrobial resistance and Clostridioides difficile. Gut Microbes, 2020, vol. 11, no. 4, pp. 1092-1103. https://doi.org/10.1080/19490976.2019.1706425Ramirez J., Guarner F., Bustos Fernandez L., Maruy A., Sdepanian V.L., Cohen H. Antibiotics as Major Disruptors of Gut Microbiota // Front Cell Infect Microbiol. – 2020. – Vol. 24, № 10. – Р. 572912. https://doi.org/10.3389/fcimb.2020.572912Ramirez J., Guarner F., Bustos Fernandez L., Maruy A., Sdepanian V.L., Cohen H. Antibiotics as major disruptors of gut microbiota. Front. Cell. Infect. Microbiol., 2020, vol. 24, no. 10, pp. 572912. https://doi.org/10.3389/fcimb.2020.572912Rui L., Zhengsheng M., Xujun Y., Tao Zuo H. Gut Microbiome and Liver Diseases: From Correlation to Causation // Microorganisms. – 2021. – Vol. 9, № 5. – Р. 1017. https://doi.org/10.3390/microorganisms9051017Rui L., Zhengsheng M., Xujun Y., Tao Zuo H. Gut microbiome and liver diseases: from correlation to causation. Microorganisms, 2021, vol. 9, no. 5, pp. 1017. https://doi.org/10.3390/microorganisms9051017Torun A. Intestinal Microbiota in Common Chronic Inflammatory Disorders Affecting Children // Front Immunol. – 2021. – № 12. – Р. 642166. https://doi.org/10.3389/fimmu.2021.642166Torun A. Intestinal microbiota in common chronic inflammatory disorders affecting children. Front Immunol., 2021, no. 12, pp. 642166. https://doi.org/10.3389/fimmu.2021.642166Xing R., Liu H., Qi X., Pan L. Measuring the process and rate of exogenous DNA degradation during digestion in mice // Sci Rep. – 2022. – Vol. 12, № 1. – Р. 6463. https://doi.org/10.1038/s41598-022-10340-7Xing R., Liu H., Qi X., Pan L. Measuring the process and rate of exogenous DNA degradation during digestion in mice. Sci. Rep., 2022, vol. 12, no. 1, pp. 6463. https://doi.org/10.1038/s41598-022-10340-7

The authors declare that there are no conflicts of interest present.