tibljТуберкулез и болезни легкихTuberculosis and Lung Diseases2075-12302542-1506Медицинские знания и технологииtiblj-795Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИORIGINAL ARTICLESГенотипирование изолятов M. tuberculosis с широкой лекарственной устойчивостью, циркулирующих в южных регионах казахстанаGENO-TYPING OF M. TUBERCULOSIS ISOLATES WITH MULTIPLE DRUG RESISTANCE CIRCULATING IN THE SOUTHERN REGIONS OF KAZAKHSTANТарлыковП. В.TarlykovP. V.

старший научный сотрудник,

010000, г. Астана, ул. Валиханова, д. 13/1

Astana

pavel.tarlykov@gmail.comРайымбекД. Р.RaiymbekD. R.

Astana

noemail@neicon.ruАленоваА. Х.AlenovaA. Kh.

Astana

noemail@neicon.ruАбилдаевТ. Ш.AbildaevT. Sh.

Astana

noemail@neicon.ruРаманкуловЕ. М.RamankulovE. M.

Astana

noemail@neicon.ruНациональный центр биотехнологии КН МОН РККазахстанBiotechnology National CenterKazakhstanНациональный центр биотехнологии КН МОН РК, г. Астана, КазахстанКазахстанBiotechnology National CenterKazakhstanНациональный центр проблем туберкулеза МЗ РК, г. Астана, КазахстанКазахстанNational Tuberculosis Control CenterKazakhstan201501092015094146Copyright © Тарлыков П.В., Райымбек Д.Р., Аленова А.Х., Абилдаев Т.Ш., Раманкулов Е.М., 20152015Тарлыков П.В., Райымбек Д.Р., Аленова А.Х., Абилдаев Т.Ш., Раманкулов Е.М.Tarlykov P.V., Raiymbek D.R., Alenova A.K., Abildaev T.S., Ramankulov E.M.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.tibl-journal.com/jour/article/view/795

Казахстан занимает одно из ведущих мест в мире по заболеваемости туберкулезом с лекарственной устойчивостью возбудителя. Цель - охарактеризовать изоляты M. tuberculosis, циркулирующие на юге Казахстана, на основе MIRU-VNTR-профиля и спектра мутаций генов, ответственных за появление лекарственной устойчивости к препаратам первого и второго рядов. Отобрано 58 клинических изолятов M. tuberculosis с широкой лекарственной устойчивостью. Генетический анализ проводили с помощью секвенирования генов rpoB, katG, embB и inhA-fabG оперона, а также генов gyrA, gyrB и rrs. Обнаружена ранее не описанная в научной литературе замена аспарагиновой кислоты цистеином в 94-м кодоне гена gyrA. Наблюдалось доминирование мутаций в 315-м кодоне гена katG (n = 53; 91,4%), в 531-м кодоне гена rpoB (n = 45; 77,6%), в положении 1 401 A/G гена rrs (n = 33; 56,9%) и в 94-м кодоне гена gyrA. MIRU-VNTR-типирование показало, что большинство изолятов относится к семейству W-Beijing (n = 53; 94,4%). Для семейства W-Beijing характерно появление устойчивости, что может объяснить рост показателей заболеваемости туберкулезом с лекарственной устойчивостью возбудителя в республике.

Kazakhstan has one of the highest incidence of multiple drug resistant tuberculosis in the world. The goal is to describe isolated of M. tuberculosis circulating in the Southern regions of Kazakhstan basing on MIRU-VNTR-profile and spectrum of gene mutations responsible for resistance to the first and second line drugs. 58 clinical isolates of M. tuberculosis with extensive drug resistance were collected. Genetic analysis was conducted by sequencing of genes of rpoB, katG, embB and inhA-fabG of operon and genes of gyrA, gyrB and rrs. The replacement of asparaginic acid with cysteine in the 94th codon of gyr4 gene was found out, which has not been described in literature before. Mutations dominated in the 315th codon of katG (n = 53; 91.4%), in the 531th codon of rpoB (n = 45; 77.6%), in position 1 401 of A/G gene rrs (n = 33; 56.9%) and in the 94th codon of gyrA. MIRU-VNTR typing showed that the majority of isolates belonged to W-Beijing family (n = 53, 94.4%). W-Beijing family often manifests resistance which can explain the increase of drug resistant tuberculosis incidence in the Republic.

туберкулездиагностикалекарственная чувствительностьлекарственная устойчивость возбудителяtuberculosisdiagnosticsdrug sensitivitydrug resistance of mycobacteriaReferencesАгзамова Р. А. Проблема лекарственной устойчивости микобактерий туберкулеза в Республике Казахстан // Фтизиопульмонология. - 2005. - № 1. - С. 12-16.Agzamova R.A. The problem of drug resistance of tuberculosis mycobacteria in Kazakhstan Republic. Phthisiopulmonology, 2005, no. 1, pp. 12-16. (In Russ.)Исмаилов Ш. Ш. Эпидемиологическая ситуация по ТБ МЛУ в Республике Казахстан // Фтизиопульмонология. - 2006. - № 2. - С. 71-73.Ismailov Sh.Sh. Epidemiological situation on MDR TB in Kazakhstan Republic. Phthisiopulmonology, 2006, no. 2, pp. 71-73. (In Russ.)Казенный Б. Я. Клиническое и эпидемиологическое значение первичной лекарственной устойчивости микобактерий туберкулеза: Автореф. … канд. мед. наук: 09.03.04. - М., 2004. - 27 с.Kazenny B.Ya. Klinicheskoye i epidemiologicheskoye znacheniye pervichnoy lekarstvennoy ustoychivostyu mikobaktery tuberkuleza. Diss. kand. med. nauk. [Clinical and epidemiological value of primary drug resistance of tuberculosis mycobacteria. Cand. Diss.]. 09.03.04, Moscow, 2004, 27 p.Мясникова Г. А., Ракишев Г. Б., Баймуханова К. Х. Туберкулез в тюрьмах // Актуальные вопросы фтизиатрии: сб. науч. тр. молодых ученых. - Алматы, 2002. - С. 30-33.Myasnikova G.А., Rakishev G.B., Baymukhanova K.Kh. Tuberkulez v tyur’makh. Аktual’nye voprosy ftiziatrii: sb. nauch. tr. molodykh uchenykh. [Tuberculosis in prisons. Actual issue of tuberculosis control. Coll. of articles by young scientists]. Almaty, 2002, pp. 30-33.Статистический обзор по туберкулезу в Республике Казахстан за 2013-2014 гг. - Алматы: Атамура, 2014. - 5 с.Statistichesky obzor po tuberkulezu v Republike Kazakhstan (2013-2014). [Statistic review of tuberculosis in Kazakhstan Republic in 2013-2014]. Almaty, Atamura Publ., 2014, 5 p.Ahmad S., Mokaddas E. Contribution of AGC to ACC and other mutations at codon 315 of the katG gene in isoniazid-resistant M. tuberculosis isolates from the Middle East // Int. J. Antimicrob. Ag. - 2004. - Vol. 32, № 5. - P. 1138-1152.Ahmad S., Mokaddas E. Contribution of AGC to ACC and other mutations at codon 315 of the katG gene in isoniazid-resistant M. tuberculosis isolates from the Middle East. Int. J. Antimicrob. Ag., 2004, vol. 32, no. 5, pp. 1138-1152.Allix-Béguec C., Supply P., Fauville-Dufaux M. Utility of fast mycobacterial interspersed repetitive unit-variable number tandem repeat genotyping in clinical mycobacteriological analysis // Clin. J. Infect. Dis. - 2004. - Vol. 39, № 6. - P. 783-789.Allix-Béguec C., Supply P., Fauville-Dufaux M. Utility of fast mycobacterial interspersed repetitive unit-variable number tandem repeat genotyping in clinical mycobacteriological analysis. Clin. J. Infect. Dis., 2004, vol. 39, no. 6, pp. 783-789.Drobnicwski F., Balabanova Y., Ruddy M. Rifampin- and multidrug-resistant tuberculosis in Russian civilians and prison inmates: dominance of the Beijing strain family // Emergency of Infection Disease. - 2002. - Vol. 8, № 11. - P. 127-132.Drobnicwski F., Balabanova Y., Ruddy M. Rifampin- and multidrug-resistant tuberculosis in Russian civilians and prison inmates: dominance of the Beijing strain family. Emergency of Infection Disease, 2002, vol. 8, no. 11, pp. 127-132.Dymova M. A., Cherednichenko A. G., Alkhovik O. I. Characterization of extensively drug-resistant Mycobacterium tuberculosis isolates circulating in Siberia // BMC Infect. Dis. - 2014. - Vol. 14, № 478. - P. 1471-2334.Dymova M.A., Cherednichenko A.G., Alkhovik O.I. Characterization of extensively drug-resistant Mycobacterium tuberculosis isolates circulating in Siberia. BMC Infect. Dis., 2014, vol. 14, no. 478, pp. 1471-2334.Global Tuberculosis Report 2013. http://www.who.int/tb/publications/global_report/en/index.htmlGlobal Tuberculosis Report 2013. http://www.who.int/tb/publications/global_report/en/index.htmlHillemann D., Kubica T., Agzamova R. et al. Rifampicin and isoniazid resistance mutations in Mycobacterium tuberculosis strains isolated from patients in Kazakhstan // Int. J. Tuberc. Lung Dis. - 2005. - Vol. 9, № 10. - P. 1161-1167.Hillemann D., Kubica T., Agzamova R. et al. Rifampicin and isoniazid resistance mutations in Mycobacterium tuberculosis strains isolated from patients in  Kazakhstan. Int. J. Tuberc. Lung Dis., 2005, vol. 9, no. 10, pp. 1161-1167.Takiff H. E., Salazar L., Guerrero C. et al. Cloning and nucleotide sequence of Mycobacterium tuberculosis gyrA and gyrB genes and detection of quinolone resistance mutations // Antimicrob. Agents Chemother. - 1994. - Vol. 38, № 4. - P. 773-780.Takiff H.E., Salazar L., Guerrero C. et al. Cloning and nucleotide sequence of  Mycobacterium tuberculosis gyrA and gyrB genes and detection of quinolone resistance mutations. Antimicrob. Agents Chemother., 1994, vol. 38, no. 4, pp. 773-780.http://www.miru-vntrplus.orghttp://www.miru-vntrplus.orghttp://www.miru-vntrplus.org/MIRU/http://www.miru-vntrplus.org/MIRU/

The authors declare that there are no conflicts of interest present.