tibljТуберкулез и болезни легкихTuberculosis and Lung Diseases2075-12302542-1506Медицинские знания и технологии10.21292/2075-1230-2016-94-8-48-53tiblj-917Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИORIGINAL ARTICLESХарактеристика популяции Mycobacterium tuberculosis в Республике КарелияCHARACTERISTICS OF MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS POPULATION IN KARELIYA REPUBLICВязоваяА. А.VyazovayaA. A.

старший научный сотрудник лаборатории молекулярной микробиологии,

197101, г. Санкт-Петербург, ул. мира, д. 14

Senior researcher of Molecular Microbiology laboratory,

14, Mira St., St. Petersburg, 197101

annavyazovaya@gmail.comСоловьеваН. С.SolovievaN. S.

заведующая бактериологической лабораторией,

194064, г. Санкт-Петербург, Политехническая ул., д. 32

Head of Bacteriological laboratory,

32, Politehknicheskaya St., St. Petersburg, 194064

baclab@spbniif.ruСунчалинаТ. В.SunchalinaT. V.

биолог,

185000, г. Петрозаводск, ул. льва толстого, д. 40

Biologist,

40, lva tolstogo St., Petrozavodsk, 185000

sun-tatjana@mail.ruМокроусовИ. В.MokrousovI. V.

ведущий научный сотрудник лаборатории молекулярной микробиологии,

197101, г. Санкт-Петербург, ул. мира, д. 14

Leading researcher of Molecular Microbiology laboratory,

14, Mira St., St. Petersburg, 197101

imokrousov@mail.ruЖуравлевВ. Ю.ZhuravlevV. Yu.

руководитель отдела лабораторной диагностики,

191014, г. Санкт-Петербург, лиговский пр., д. 2-4

Head of laboratory Diagnostics Department;

2-4, ligovsky Ave., St. Petersburg, 191014

jouravlev-slava@mail.ruНарвскаяО. В.NarvskayaO. V.

заведующая лабораторией молекулярной микробиологии,

197101, г. Санкт-Петербург, ул. мира, д. 14

Head of Molecular Microbiology laboratory,

14, Mira St., St. Petersburg, 197101

onarvskaya@gmail.comФБУН «НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера»РоссияPasteur St. Petersburg Research Institute of Epidemiology and MicrobiologyRussian FederationФГБУ «НИИ фтизиопульмонологии» МЗ РФРоссияSt. Petersburg Research Institute of PhthisiopulmonologyRussian FederationРеспубликанский противотуберкулезный диспансерРоссияRepublican TB DispensaryRussian FederationФБУН «НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера»; ФГБУ «НИИ фтизиопульмонологии» МЗ РФРоссияPasteur St. Petersburg Research Institute of Epidemiology and Microbiology; St. Petersburg Research Institute of PhthisiopulmonologyRussian Federation2016010820169484853Copyright © Вязовая А.А., Соловьева Н.С., Сунчалина Т.В., Мокроусов И.В., Журавлев В.Ю., Нарвская О.В., 20162016Вязовая А.А., Соловьева Н.С., Сунчалина Т.В., Мокроусов И.В., Журавлев В.Ю., Нарвская О.В.Vyazovaya A.A., Solovieva N.S., Sunchalina T.V., Mokrousov I.V., Zhuravlev V.Y., Narvskaya O.V.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.tibl-journal.com/jour/article/view/917Цель исследования

Цель исследования: генотипирование штаммов Mycobacterium tuberculosis, выделенных от больных туберкулезом легких в Республике Карелия с июня 2013 г. по январь 2014 г.

Результаты

Результаты. Сполиготипирование 78 штаммов M. tuberculosis выявило их принадлежность к генетическим семействам Beijing (n = 43), T (n = 11), URAL (n = 10), LAM (n = 8), Haarlem и Х. Восемь из 24 сполиготипов: SIT1 (Beijing); SIT40, SIT52, SIT53 (T); SIT35 и SIT262 (H3/URAL); SIT42 (LAM); SIT50 (Haarlem) были представлены двумя штаммами и более. Установлена ассоциация первичной множественной лекарственной устойчивости с генотипом Beijing возбудителя, причем 43,8% штаммов M. tuberculosis данного генотипа принадлежали к эпидемиологически и клинически значимому кластеру В0/W148. Группа T была представлена только лекарственно-чувствительными штаммами.

Goal of the study

Goal of the study: genotyping of Mycobacterium tuberculosis strains isolated from pulmonary tuberculosis patients in Kareliya Republic from June 2013 to January 2014.

Results

Results. Spoligotyping of 78 M. tuberculosis strains showed that they belonged to families of Beijing (n = 43), T (n = 11), URAL (n = 10), LAM (n = 8), Haarlem and Х. Eight out of 24 spoligotypes: SIT1 (Beijing); SIT40, SIT52, SIT53 (T); SIT35 и SIT262 (H3/URAL); SIT42 (LAM); SIT50 (Haarlem) were represented by two and more strains. The association between primary multiple resistance and Beijing genotype ofthe mycobacterium was defined, and 43.8% of M. tuberculosis strains of this genotype belonged to В0/W148 cluster which was of the epidemiological and clinical significance. T group was represented by drug susceptible strains only.

Республика Карелиягенотипированиегенотип BeijingM. tuberculosisM. tuberculosisKareliya RepublicgenotypingBeijing genotypeReferencesАрчакова Л. И., Исаева Н. Ю. Динамика развития эпидемической ситуации по туберкулезу в Северо-Западном федеральном округе России за 2004-2008 годы // Вестник новых медицинских технологий. - 2009. - Т. 16, № 4. - С. 160-162.Аrchakova L.I., Isaeva N.YU. Changes in tuberculosis epidemic situation development in the North-Western Federal District of Russia in 2004-2008. Vestn. Novykh Meditsinskikh Tekhnologiy, 2009, vol. 16, no. 4, pp. 160-162. (In Russ.)Вязовая А. А., Мокроусов И. В., Оттен Т. Ф. и др. Молекулярно-генетическая характеристика штаммов Mycobacterium tuberculosis, циркулирующих в Псковской области // Туб. и болезни легких. - 2012. - № 6. - С. 35-39.Vyazovaya А.А., Mokrousov I.V., Otten T.F. et al. Molecular and genetic characteristics of Mycobacterium tuberculosis strains circulating in Pskov Region. Tub. i Bolezni Legkikh, 2012, no. 6, pp. 35-39. (In Russ.)Маркелов Ю. М. Клинико-эпидемиологические особенности туберкулеза с множественной лекарственной устойчивостью и причины его распространения в Карелии // Туб. и болезни легких. - 2011. - № 8. - С. 11-17.Markelov Yu.M. Clinical and epidemiological specifics of multiple drug resistant tuberculosis and causes of its transmission in Karelia. Tub. i Bolezni Legkikh, 2011, no. 8, pp. 11-17. (In Russ.)Маркелов Ю. М., Нарвская О. В. Циркуляция штаммов возбудителя туберкулеза с множественной лекарственной устойчивостью на территории Республики Карелия // Туб. и болезни легких. - 2010. - № 2. - С. 54-56.Markelov Yu.M., Narvskaya O.V. Circulation of drug resistant tuberculosis strains on the territory of Karelia Republic. Tub. i Bolezni Legkikh, 2010, no. 2, pp. 54-56. (In Russ.)Нарвская О. В., Журавлев В. Ю., Соловьева Н. С. и др. Сполигопрофили Mycobacterium tuberculosis на Северо-Западе России. База данных № 2014620898 [Электронный ресурс] / ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера; ФГБУ «СПб НИИФ» Минздрава России. СПб., 2014. 1 электрон. опт. диск (CD-ROM): текст, табл. (336 Kb). Загл. с этикетки диска.Narvskaya O.V., Zhuravlev V.Yu., Solovieva N.S. et al. Spoligoprofili Mycobacterium tuberculosis na Severo-Zapade Rossii. [Spoligoprofiles of Mycobacteriumtuberculosis in the North-West ofRussia]. Database no. 2014620898 (Epub.),Огарков О. Б., Медведева Т. В., Zozio T. и др. Молекулярное типирование штаммов микобактерий туберкулеза в Иркутской области (Восточная Сибирь) в 2000-2005 гг. // Молекулярная медицина. - 2007. - № 2. - С. 33-38.Pasteur St. Petersburg Research Institute of Epidemiology and Microbiology, St. Petersburg Research Institute of Phthisiopulmonology, Russian Ministry of Health Publ., St. Petersburg, 2014, 1 CD-ROM.Эпидемическая ситуация по туберкулезу в России в 2014 г. (1.06 Mb) [Электронный ресурс] // Федеральный Центр мониторинга противодействия распространению туберкулеза [Офиц.сайт]. URL: http://www.mednet.ru/images/stories/files/CMT/tub_epidsituaciya.pdf (дата обращения: 15.09.2015).Ogarkov O.B., Medvedeva T.V., Zozio T. et al. Molecular typing of tuberculosis mycobacteria strains in Irkutsk Region (Eastern Siberia) in 2000-2005. Molekulyarnaya Meditsina, 2007, no. 2, pp. 33-38. (In Russ.)Brudey K., Driscoll J. R., Rigouts L. et al. Mycobacterium tuberculosis complex genetic diversity: mining the fourth international spoligotyping database (SpolDB4) for classification, population genetics and epidemiology // BMC Microbiol. - 2006. - Vol. 6. - P. 23-30.Epidemicheskaya situatsiya po tuberkulezu v Rossii v 2014 g. [Tuberculosis epidemiological situation in Russia in 2014]. (Epub.) Federal Monitoring Center of Tuberculosis Transmission Control. Available at: http://www.mednet.ru/images/stories/files/CMT/tub_epidsituaciya.pdf (Accessed: 15.09.2015).Demay C., Liens B., Burguière T. et al. SITVITWEB - A publicly available international multimarker database for studying Mycobacterium tuberculosis genetic diversity and molecular epidemiology // Infect. Genet. Evol. - 2012. - Vol. 12. - P. 755-766.Brudey K., Driscoll J.R., Rigouts L. et al. Mycobacterium tuberculosis complex genetic diversity: mining the fourth international spoligotyping database (SpolDB4) for classification, population genetics and epidemiology. BMC Microbiol., 2006, vol. 6, pp. 23-30.Gibson A., Huard R., Gey van Pittius N. et al. Application of sensitive and specific molecular methods to uncover global dissemination of the major RDRio Sublineage of the Latin American-Mediterranean Mycobacterium tuberculosis spoligotype family // J. Clin. Microbiol. - 2008. - Vol. 46, № 4. - P. 1259-1267.Demay C., Liens B., Burguière T. et al. SITVITWEB – A publicly available international multimarker database for studying Mycobacterium tuberculosis genetic diversity and molecular epidemiology. Infect.Genet. Evol., 2012, vol. 12, pp. 755-766.Kamerbeek J., Schouls L., Kolk A. et al. Simultaneous detection and strain differentiation of Mycobacterium tuberculosis for diagnosis and epidemiology // J. Clin. Microbiol. - 1997. - Vol. 35, № 4. - P. 907-914.Gibson A., Huard R., Gey van Pittius N. et al. Application of sensitive and specific molecular methods to uncover global dissemination of the major RDRio Sublineage of the Latin American-Mediterranean Mycobacterium tuberculosis spoligotype family. J. Clin. Microbiol., 2008, vol. 46, no. 4, pp. 1259-1267.Kovalev S. Y., Kamaev E. Y., Kravchenko M. A. et al. Genetic analysis of Mycobacterium tuberculosis strains isolated in Ural region, Russian Federation, by MIRU-VNTR genotyping // Int. J.Tuberc. Lung Dis. - 2005. - Vol. 9, № 7. - P. 46-52.Kamerbeek J., Schouls L., Kolk A. et al. Simultaneous detection and strain differentiation of Mycobacterium tuberculosis for diagnosis and epidemiology. J. Clin. Microbiol., 1997, vol. 35, no. 4, pp. 907-914.Mäkinen J., Marjamäki M., Haanperä-Heikkinen M. et al. Extremely high prevalence of multidrug resistant tuberculosis in Murmansk, Russia: a population-based study // Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. - 2011. - Vol. 30. - P. 1119-1126.Kovalev S.Y., Kamaev E.Y., Kravchenko M.A. et al. Genetic analysis of Mycobacterium tuberculosis strains isolated in Ural region, Russian Federation, by MIRU-VNTR genotyping. Int. J. Tuberc. Lung Dis., 2005, vol. 9, no. 7, pp. 46-52.Mokrousov I., Narvskaya O., Vyazovaya A. et al. Russian „successful“ clone B0/W148 of Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype: a multiplex PCR assay for rapid detection and global screening // J. Clin. Microbiol. - 2012. - Vol. 50, № 11. - P. 3757-3759.Mäkinen J., Marjamäki M., Haanperä-Heikkinen M. et al. Extremely high prevalence of multidrug resistant tuberculosis in Murmansk, Russia: a population-based study. Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis., 2011, vol. 30, pp. 1119-1126.Smit P. W., Haanperä M., Rantala P. et al. Molecular epidemiology of tuberculosis in Finland, 2008-2011. // PLoS One. - 2013. - 26;8(12):e85027. doi: 10.1371 / journal. pone. 0085027. eCollection 2013.Mokrousov I., Narvskaya O., Vyazovaya A. et al. Russian „successful“ clone B0/W148 of Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype: a multiplex PCR assay for rapid detection and global screening. J. Clin. Microbiol., 2012, vol. 50, no. 11, pp. 3757-3759.Supply P., Allix C., Lesjean S. et al. Proposal for standardization of optimized mycobacterial interspersed repetitive unit-variable-number tandem repeat typing of Mycobacterium tuberculosis // J. Clin. Microbiol. - 2006. - Vol. 44, № 12. - P. 4498-4510.Smit P.W., Haanperä M., Rantala P. et al. Molecular epidemiology of tuberculosis in Finland, 2008-2011. PLoS One, 2013, 26;8(12):e85027. doi: 10.1371/journal.pone.0085027. eCollection 2013.Van Embden J., Cave M., Crawford J. et al. Strain identification on Mycobacterium tuberculosis by DNA fingerprinting: recommendations for a standardized methodology // J. Clin. Microbiol. - 1993. - Vol. 31. - Р. 406-409.Supply P., Allix C., Lesjean S. et al. Proposal for standardization of optimized mycobacterial interspersed repetitive unit-variable-number tandem repeat typing of Mycobacterium tuberculosis. J. Clin. Microbiol., 2006, vol. 44, no. 12, pp. 4498-4510.World Health Organisation. Multidrug and extensively drug-resistant TB (M/XDR-TB): 2010 global report on surveillance and response. WHO/HTM/TB/2010.3. WHO, Geneva; 2010.Van Embden J., Cave M., Crawford J. et al. Strain identification on Mycobacteriumtuberculosis by DNA fingerprinting: recommendations for a standardized methodology. J. Clin. Microbiol., 1993, vol. 31, pp. 406-409.World Health Organisation. Multidrug and extensively drug-resistant TB (M/XDR-TB): 2010 global report on surveillance and response. WHO/HTM/TB/2010.3. WHO, Geneva; 2010.World Health Organisation. Multidrug and extensively drug-resistant TB (M/XDR-TB): 2010 global report on surveillance and response. WHO/HTM/TB/2010.3. WHO, Geneva; 2010.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.