Выявление нетуберкулезных микобактерий, циркулирующих в разных регионах Сибири, и анализ их лекарственной устойчивости

Цель исследования: выявить частоту видов нетуберкулезных микобактерий (НТМ), выделенных от пациентов противотуберкулезных учреждений Сибирского региона за период 2014-2018 гг., определить корреляционные взаимосвязи между показателями резистентности к разным антибактериальным препаратам.

Материалы и методы. Методом ПЦР-гибридизации на стрип-полосках (Hain Lifescience GenoType Mycobacterium CM/AS) проведено генотипирование 475 изолятов НТМ, выделенных от пациентов разных противотуберкулезных стационаров Сибири. Лекарственную устойчивость тестировали методом минимальных ингибирующих концентраций (МИК), культуральным методом серийных микроразведений в жидкой питательной среде с применением наборов TREK Diagnostic Systems. Использовали 64 панели для медленнорастущих микобактерий (SLOWMYCO), 46 – для быстрорастущих (RAPMYCO). Обработку данных проводили с использованием языка программирования 3.5.1 и среды анализа данных Rstudio, версии 1.1.442.

Результаты исследования.

1. Томская область отличается от остальных рассматриваемых регионов Сибири большей частотой встречаемости M. intracellulare среди изолятов, идентифицированных методом ПЦР-гибридизации. В остальных регионах наиболее часто встречающимся видом является M. fortuitum.

2. В сравнении с референсными данными (CLSI M62, 2018) получены отличия МИК некоторых видов НТМ, выделенных у больных на территориях Сибири и Дальнего Востока, скорее всего связанные с региональными особенностями данных изолятов.

3. Изоляты НТМ, устойчивые к моксифлоксацину, являются также резистентными к линезолиду, тримептоприму, ципрофлоксацину.

4. Быстрорастущие изоляты НТМ, устойчивые к кларитромицину, преимущественно являются чувствительными к моксифлоксацину, ципрофлоксацину и триметоприму.

1. Гунтупова Л. Д., Борисов С. Е., Соловьева И. П., Макарова М. В., Хачатурьянц Е. Н. Микобактериозы во фтизиопульмонологической практике: обзор литературы и собственный опыт // Практическая медицина. – 2011. – Т. 3, № 51. – С. 39-50.

2. Ивантер Э. В., Коросов А. В. Введение в количественную биологию. ‒ Петрозаводск: Петр ГУ, 2011. ‒ 302 с.

3. Литвинов В. И., Макарова М. В., Краснова М. А. Нетуберкулезные микобактерии. ‒ М.: МНПЦБТ, 2008. ‒ 95 с.

4. Лямин А. В., Жестков А. В., Исматуллин Д. Д., Ковалев А. М. Лабораторная диагностика микобактериозов // Вестник современной клинической медицины. – 2017. – Т. 10, вып. 1. – С. 29-35.

5. Ревякина О. В., Алексеева Т. В., Филиппова О. П. Основные показатели противотуберкулезной деятельности в Сибирском и Дальневосточном федеральных округах. – Новосибирск: Сибмедиздат НГМУ, 2016. – 92 с.

6. Adjemian J., Prevots D. R., Gallagher J. et al. Lack of adherence to evidence based treatment guidelines for nontuberculous mycobacterial lung disease // Ann. Am. Thorac. Soc. – 2014. – Vol. 11, № 1. – Р. 9-16.

7. Alexander K. A., Laver P. N., Michel A. L., Williams M., van Helden P. D., Warren R. M., Gey van Pittius N. C. Novel Mycobacterium tuberculosis complex pathogen, M. mungi // Emerg. Infect. Dis. – 2010. – Vol. 16, № 8. – Р. 1296-1299.

8. Andréjak C., Nielsen R., Thomsen V. et al. Chronic respiratory disease, inhaled corticosteroids and risk of non-tuberculous mycobacteriosis // Thorax. – 2013. – Vol. 68, № 3. – Р. 256-262.

9. Brode S. K., Daley C. L., Marras T. K. The epidemiologic relationship between tuberculosis and non-tuberculous mycobacterial disease: a systematic review // Int. J. Tuberc. lung Dis. – 2014. – Vol. 18, № 11. – Р. 1370-1377.

10. Daley C. L., Griffith D. E. Pulmonary non-tuberculous mycobacterial infections // Int. J. Tuberc. Lung. Dis – 2010. – Vol. 14, № 6 – Р. 665-671.

11. Griffith D. E., Aksamit T., Brown-Elliott B. A. et al. An official ATS/ IDSA statement: Diagnosis, treatment, and prevention of nontuberculous mycobacterial diseases // Am. J. Respir. Crit. Care Med. – 2007. – Vol. 175, № 4. – Р. 367-416.

12. Porvaznik I., Solovic I., Mokry J. Non-Tuberculous Mycobacteria: Classification, Diagnostics, and Therapy // Adv. Exp. Med. Biol. – 2017. – № 944. – Р. 19-25.

13. Salsgiver E. L., Fink A. K., Knapp E. A. et al. Changing epidemiology of the respiratory bacteriology of patients with cystic fibrosis // Chest. – 2016. – Vol. 149, № 2. – Р.390-400.

14. Van Ingen J. Diagnosis of nontuberculous mycobacterial infections // Semin. Respir. Crit. Care Med. – 2013. – Vol. 34, № 1. – Р. 103-109.

15. Van Ingen J., Wagner D., Gallagher J., et al. Poor adherence to management guidelines in nontuberculous mycobacterial pulmonary diseases // Eur. Respir J. – 2017. – Vol. 49, № 2. – Р. 10-13.