Сравнение различных методов определения лекарственной чувствительности Mycobacterium tuberculosis к рифампицину
https://doi.org/10.21292/2075-1230-2022-100-1-41-48
Аннотация
Цель исследования: сопоставление результатов тестирования чувствительности/устойчивости к рифампицину молекулярно-генетическими методами и фенотипическими тестами изолятов микобактерий туберкулеза, выделенных из клинического материала больных туберкулезом.
Материалы и методы. В исследование включены 915 образцов ДНК M. tuberculosis и 426 культур. Использованы генотипические тесты (TB-TEST (БИОЧИП-ИМБ, Россия), GenoType MTBDRplusV2) и фенотипические технологии (метод абсолютных концентраций, система Bactec MGIT 960, набор Sensititre Myco TB).
Результаты. Получен высокий процент (98,7%; ДИ 97,7-99,7%) подтверждения результатов молекулярно-генетического теста (TB-TEST) фенотипическим тестом (метод абсолютных концентраций). Показано, что в некоторых случаях система Bactec MGIT 960, а также метод абсолютных концентраций демонстрировали ложноотрицательные результаты устойчивости к рифампицину.
Об авторах
Т. В. Умпелева
ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр фтизиопульмонологии и инфекционных заболеваний» МЗ РФ
Россия
Россия
Умпелева Татьяна Валерьевна - ведущий научный сотрудник научно-исследовательского
отдела микробиологии и доклинических исследований
620039, г. Екатеринбург, 22 Партсъезда, д. 50
Е. А. Мазурина
ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр фтизиопульмонологии и инфекционных заболеваний» МЗ РФ
Россия
Россия
Мазурина Елена Александровна - лаборант-исследователь научно-исследовательского отдела микробиологии и доклинических исследований
620039, г. Екатеринбург, 22 Партсъезда, д. 50
Д. В. Вахрушева
ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр фтизиопульмонологии и инфекционных заболеваний» МЗ РФ
Россия
Россия
Вахрушева Диана Владимировна - заведующая научно-исследовательским отделом микробиологии и доклинических исследований
620039, г. Екатеринбург, 22 Партсъезда, д. 50
Н. И. Еремеева
ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр фтизиопульмонологии и инфекционных заболеваний» МЗ РФ
Россия
Россия
Еремеева Наталья Ивановна - ведущий научный сотрудник научно-исследовательского отдела микробиологии и доклинических исследований
620039, г. Екатеринбург, 22 Партсъезда, д. 50
Список литературы
1. Андреевская С. Н., Андриевская И. Ю., Киселева Е. А., Ларионова Е. Е., Смирнова Т. Г., Черноусова Л. Н., Эргешов А. Э. Влияние мутаций, связанных с устойчивостью к рифампицину, на «фитнес» штаммов M. tuberculosis // Туб. и социально-значимые заболевания. – 2016. – № 2. – С. 33-37.
2. Вахрушева Д. В., Еремеева Н. И., Умпелева Т. В., Белоусова К. В. Опыт применения технологии «ТБ-ТЕСТ» («БИОЧИП-ИМБ», Россия) в диагностическом алгоритме // Туб. и болезни легких. – 2017. – Т. 95, № 10. – С 29-35.
3. Исакова А. И., Носова Е. Ю., Гармаш Ю. Ю., Богданов К. А., Трусов В. Н., Сафонова С. Г. Современные молекулярно-генетические технологии в диагностике туберкулеза при исследовании операционного материала // Туб. и социально-значимые заболевания. – 2018. – № 1. – С. 12-19.
4. Носова Е. Ю., Хахалина А. А., Галкина К. Ю., Краснова М. А., Крылова Л. Ю., Сафонова С. Г. Определение множественной и широкой лекарственной устойчивости Mycobacterium tuberculosis с помощью различных молекулярных тестсистем и BACTECTM MGITTM 960 // Туберкулез и социально значимые заболевания. – 2015. – № 3. – С. 11-17.
5. Черноусова Л. Н., Севастьянова Е. В., Ларионова Е. Е., Смирнова Т. Г., Андреевская С. Н., Попов С. А. Федеральные клинические рекомендации по организации и проведению микробиологической и молекулярно-генетической диагностики туберкулеза. – 2014.
6. Abuali M. M., Katariwala R., LaBombardi V. J. A comparison of the Sensititre® MYCOTB panel and the agar proportion method for the susceptibility testing of Mycobacterium tuberculosis // Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. – 2011. – № 31 (5). – Р. 835–839.
7. Campbell E. A., Korzheva N., Mustaev A., Murakami K., Nair S., Goldfarb A., Darst S. A. Structural mechanism for rifampicin inhibition of bacterial RNA polymerase // Cell. – 2001. – № 104 (6). – Р. 901-912.
8. Di A., Levin B. R. The biological cost of antibiotic resistance // Curr. Opin. Microbiol. – 1999. – № 2. – Р. 489-493.
9. Hall L., Jude K. P., Clark S. L., Dionne K., Merson R., Boyer A., Parrish N. M., Wengenack N. L. Evaluation of the sensititre MycoTB plate for susceptibility testing of the Mycobacterium tuberculosis complex against first- and second-line agents // J. Clin. Microbiol. – 2012. – № 50 (11). – Р. 3732-3734.
10. Mokrousov I., Otten T., Vyshnevskiy B., Narvskaya O. Allele-specific rpoB PCR assays for detection of rifampin-resistant Mycobacterium tuberculosis in sputum smears // Antimicrob. Agents Chemother. – 2003. – № 47 (7). – Р. 2231-2235.
11. Morlock G. P., Plikaytis B. B., Crawford J. T. Characterization of spontaneous, in vitro-selected, rifampin-resistant mutants of Mycobacterium tuberculosis strain H37Rv // Antimicrob. Agents Chemother. – 2000. – № 44 (12). – Р. 3298-3301.
12. Rigouts L., Gumusboga M., De Rijk W. B., Nduwamahoro E., Uwizeye C., De Jong B., Van Deun A. Rifampin resistance missed in automated liquid culture system for Mycobacterium tuberculosis isolates with specific rpoB mutations // J. Clin. Microbiol. – 2013. – № 51(8). – Р. 2641-2645.
13. Siu G. K. H., Zhang Y., Lau T. C. K., Lau R. W. T., Ho P. L., Yew W. W., Tsui S. K. W., Cheng V. C. C., Yuen K. Y., Yam W. C. Mutations outside the rifampicin resistance-determining region associated with rifampicin resistance in Mycobacterium tuberculosis // J. Antimicrob. Chemother. – 2011. – № 66 (4). – Р. 730-733.
14. Toungoussova O. S., Sandven P., Mariandyshev A. O., Nizovtseva N. I., Bjune G., Caugant D. A. Spread of drug-resistant Mycobacterium tuberculosis strains of the Beijing genotype in the Archangel Oblast, Russia // J. Clin. Microbiol. – 2002. – № 40 (6). – Р. 1930-1937.
15. Wehrli W. Rifampin: Mechanisms of action and resistance // Rev. Infect. Dis. – 1983. – № 5 (3). – Р. S407–S411.
16. Williams D. L., Spring L., Collins L., Miller L. P., Heifets L. B., Gangadharam P. R. J., Gillis T. P. Contribution of rpoB mutations to development of rifamycin crossresistance in Mycobacterium tuberculosis // Antimicrob. Agents Chemother. – 1998. – № 42 (7). – Р. 1853-1857.
17. World Health Organization, Catalogue of mutations in Mycobacterium tuberculosis complex and their association with drug resistance. – 2021.
18. World Health Organization, Technical manual for drug susceptibility testing of medicines used in the treatment of tuberculosis. – 2018.
19. World Health Organization, Technical report on critical concentrations for drug susceptibility testing of isoniazid and the rifamycins (rifampicin, rifabutin and rifapentine). – 2021. 4, 38-44.
20. Yang B., Koga H., Ohno H., Ogawa K., Fukuda M., Hirakata Y., Maesaki S., Tomono K., Tashiro T., Kohno S. Relationship between antimycobacterial activities of rifampicin, rifabutin and KRM-1648 and rpoB mutations of Mycobacterium tuberculosis // J. Antimicrob. Chemother. – 1998. – № 42 (5). – Р. 621-628.
21. Yu, X., Ma, Y. F., Jiang, G. L., Chen, S. T., Wang, G. R., Huang, H. R. Sensititre® MYCOTB MIC plate for drug susceptibility testing of Mycobacterium tuberculosis complex isolates // The International Journal of Tuberculosis and Lung Disease: the Official Journal of the International Union Against Tuberculosis and Lung Disease. – 2016. – № 20 (3). – Р. 32-334.
22. Zimenkov D. V., Kulagina E. V., Antonova O. V., Zhuravlev V. Y., Gryadunov D. A. Simultaneous drug resistance detection and genotyping of Mycobacterium tuberculosis using a low-density hydrogel microarray // J. Antimicrob. Chemother. – 2009. – № 71 (6). – Р. 1520-1531.
Рецензия
Для цитирования:
Умпелева Т.В., Мазурина Е.А., Вахрушева Д.В., Еремеева Н.И. Сравнение различных методов определения лекарственной чувствительности Mycobacterium tuberculosis к рифампицину. Туберкулез и болезни легких. 2022;100(1):41-48. https://doi.org/10.21292/2075-1230-2022-100-1-41-48
For citation:
Umpeleva T.V., Mazurina E.A., Vakhrusheva D.V., Eremeeva N.I. Comparison of Different Methods for Drug Susceptibility Testing of Mycobacterium tuberculosis to Rifampicin. Tuberculosis and Lung Diseases. 2022;100(1):41-48. (In Russ.) https://doi.org/10.21292/2075-1230-2022-100-1-41-48
Просмотров: 424
Послать статью по эл. почте 