Молекулярно-генетическая характеристика изолятов Mycobacterium tuberculosis, выделенных от больных ВИЧ-ассоциированным туберкулезом

Цель исследования: дать молекулярно-генетическую характеристику изолятов Mycobacterium tuberculosis, выделенных от больных ВИЧ-ассоциированным туберкулезом.

Материалы и методы. В исследование были включены две группы изолятов M. tuberculosis: 103 изолята от больных, проходивших лечение по поводу генерализованного туберкулеза, сочетанного с ВИЧ-инфекцией, и 61 изолят из аутопсийного материала больных, страдавших генерализованным туберкулезом и ВИЧ-инфекцией. Принадлежность изолятов M. tuberculosis к генотипу Beijing, его сублиниям и основным российским субтипам устанавливали методами ПЦР и ПЦР в формате реального времени на основе анализа специфических маркеров и локусов генома (dnaA-dnaN::IS6110, Rv2664-Rv2665::IS6110, sigE, NTF, RD181). Генотипирование изолятов non-Beijing проводили с помощью сполиготипирования с последующим сравнением с международной базой данных SITVIT2. Результаты сравнивали с опубликованными данными по генетическому разнообразию M. tuberculosis на северо-западе РФ.

Результаты. В обеих группах было выявлено преобладание изолятов генотипа Beijing (89,3% и 70% соответственно), среди которых, в свою очередь, большинство принадлежало к субтипам 94-32 (51% и 44,1%) и B0/W148 (41,3% и 30%), относящимся к современной сублинии генотипа Beijing. Часть изолятов принадлежала к древней сублинии генотипа Beijing (8,7% и 4,6%). При сравнении с ранее полученными данными по северо-западу РФ доля изолятов МБТ древней сублинии от больных с ВИЧ-инфекцией оказалась значимо выше, чем среди изолятов, выделенных от ВИЧ-отрицательных больных (6,7% против 1,6%, P = 0,0028).

1. Азовцева О.В., Пантелеев А.М., Карпов А.В., Архипов Г.С., Вебер В.Р., Беляков Н.А., Архипова Е.И. Анализ медико-социальных факторов, влияющих на формирование и течение коинфекции ВИЧ, туберкулеза и вирусного гепатита // Инфекция и иммунитет. – 2019. – Т. 9, № 5-6. – С. 787-799. https://doi.org/10.15789/2220-7619-2019-5-6-787-799

2. Вязовая А.А., Лебедева И.А., Ушакова Н.Б., Павлов В.В., Герасимова А.А., Соловьева Н.С., Журавлев В.Ю., Нарвская О.В. Молекулярно-генетический анализ популяции Mycobacterium tuberculosis в Вологодской области – регионе с низкой заболеваемостью туберкулезом // Инфекция и иммунитет. – 2021. – Т. 11, № 3 – С. 497–505.

3. Вязовая А.А., Мокроусов И.В., Журавлев В.Ю., Соловьева Н.С., Оттен Т.Ф., Маничева О.А., Вишневский Б.И., Нарвская О.В. Молекулярная характеристика мультирезистентных штаммов Mycobacterium tuberculosis, выделенных на северо-западе России // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. – 2016. – № 1. – С. 30-33. https://doi.org/10.18821/0208-0613-2016-34-1-30-33

4. Загдын З.М., Чжао И., Соколович Е.Г., Яблонский П.К. МЛУ-туберкулез и ВИЧ-инфекция в Северо-Западном федеральном округе // Туберкулез и болезни легких. – 2021. – Т. 99, № 1. – С. 27-32. https://doi.org/10.21292/2075-1230-2021-99-1-27-32

5. Методические рекомендации по совершенствованию диагностики и лечения туберкулеза органов дыхания, утверждены приказом Министерства здравоохранения Российской Федерации от 29 декабря 2014 г. № 951. МЗ РФ, Москва, 2015.

6. Мишина А. В., Мишин В. Ю., Собкин А. Л., Осадчая О. А. Диссеминированный и генерализованный туберкулез легких и оппортунистические заболевания у больных на поздних стадиях ВИЧ-инфекции с иммуносупрессией // Туберкулез и болезни легких. – 2018. – Т. 96, № 12. – С. 68-70. https://doi.org/10.21292/2075-1230-2018-96-12-68-70

7. Пантелеев А.М. Результаты сопоставления прижизненного и посмертного выявления туберкулеза множественной локализации у больных ВИЧ-инфекцией // Туберкулез и болезни легких. – 2015. – № 7. – С. 106-108.

8. Пасечник О.А., Левахина Л.И., Тюменцев А.Т., Пиценко Н.Д. Динамика и структура смертности больных ВИЧ-инфекцией в Сибирском федеральном округе в 2006-2015 гг. // Журнал инфектологии. – 2017. – Т. 9, № 2. – С. 86-92. https://doi.org/10.22625/2072-6732-2017-9-2-86-92

9. Соловьева Н.С., Маничева О. А., Стеклова Л. Н., Олейник В. В., Шульгина М. В. Эффективность системы Вастес MGIT 960 для исследования операционного материала больных туберкулезным спондилитом // Клиническая лабораторная диагностика. – 2013. – № 12. – С. 45-47.

10. Чумаченко Г.В., Бабаева И.Ю., Авдеева М.Г. Актуальность проблемы сочетанной инфекции ВИЧ и туберкулеза в современных эпидемиологических условиях // Эпидемиология и инфекционные болезни – 2016. – Т. 21, № 6. – С. 304-312. https://doi.org/10.18821/1560-9529-2016-21-6-304-312

11. Hunter P.R., Gaston M.A. Numerical index of the discriminatory ability of typing systems: an application of Simpson's index of diversity // J Clin Microbiol. – 1988. – № 26. – P. 2465-2466.

12. Kamerbeek J., Schouls L., Kolk A., van Agterveld M., van Soolingen D., Kuijper S., et al. Simultaneous detection and strain differentiation of Mycobacterium tuberculosis for diagnosis and epidemiology // J Clin Microbiol. – 1997. – № 35. – P. 907-914.

13. Mokrousov I. Ubiquitous and multifaceted: SIT53 spoligotype does not correlate with any particular family of Mycobacterium tuberculosis // Tuberculosis (Edinb). – 2021. – № 126. – P. 102024. https://doi.org/10.1016/j.tube.2020.102024

14. Mokrousov I., Vyazovaya A., Zhuravlev V., Otten T., Millet J., Jiao W.W., Shen A.D., Rastogi N., Vishnevsky B., Narvskaya O. Real-time PCR assay for rapid detection of epidemiologically and clinically significant Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype isolates // J Clin Microbiol. – 2014. – Vol. 52, № 5. – P. 1691-1693. https://doi.org/10.1128/JCM.03193-13

15. Ogarkov O., Mokrousov I., Sinkov V., Zhdanova S., Antipina S., Savilov E. 'Lethal' combination of Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype and human CD209 -336G allele in Russian male population // Infect Genet Evol. – 2012. – Vol. 12, № 4. – P. 732-736. https://doi.org/10.1016/j.meegid.2011.10.005

16. Shitikov E., Vyazovaya A., Malakhova M., Guliaev A., Bespyatykh J., Proshina E., Pasechnik O., Mokrousov I. Simple Assay for Detection of the Central Asia Outbreak Clade of the Mycobacterium tuberculosis Beijing Genotype // J Clin Microbiol. – 2019. – Vol. 57, № 7– P. e00215-19. https://doi.org/10.1128/JCM.00215-19

17. Van Embden J., Cave M., Crawford J., Dale J., Eisenach K., Gicquel B., Hermans P., Martin C., McAdam R., Shinnick T., Small P. Strain identification of Mycobacterium tuberculosis by DNA fingerprinting: recommendations for a standardized methodology. // J Clin Microbiol. – 1993. – Vol. 31, № 2. – P. 406-409. https://doi.org/10.1128/JCM.31.2.406-409.1993

18. Vyazovaya A., Gerasimova A., Mudarisova R., Terentieva D., Solovieva N., Zhuravlev V., Mokrousov I. Genetic Diversity and Primary Drug Resistance of Mycobacterium tuberculosis Beijing Genotype Strains in Northwestern Russia // Microorganisms. – 2023. – Vol. 11, № 2. – P. 255. https://doi.org/10.3390/microorganisms11020255