Характеристика популяции Mycobacterium tuberculosis в Республике Карелия
https://doi.org/10.21292/2075-1230-2016-94-8-48-53
Аннотация
Цель исследования: генотипирование штаммов Mycobacterium tuberculosis, выделенных от больных туберкулезом легких в Республике Карелия с июня 2013 г. по январь 2014 г.
Результаты. Сполиготипирование 78 штаммов M. tuberculosis выявило их принадлежность к генетическим семействам Beijing (n = 43), T (n = 11), URAL (n = 10), LAM (n = 8), Haarlem и Х. Восемь из 24 сполиготипов: SIT1 (Beijing); SIT40, SIT52, SIT53 (T); SIT35 и SIT262 (H3/URAL); SIT42 (LAM); SIT50 (Haarlem) были представлены двумя штаммами и более. Установлена ассоциация первичной множественной лекарственной устойчивости с генотипом Beijing возбудителя, причем 43,8% штаммов M. tuberculosis данного генотипа принадлежали к эпидемиологически и клинически значимому кластеру В0/W148. Группа T была представлена только лекарственно-чувствительными штаммами.
Об авторах
А. А. Вязовая
ФБУН «НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера»
Россия
Россия
старший научный сотрудник лаборатории молекулярной микробиологии,
197101, г. Санкт-Петербург, ул. мира, д. 14
Н. С. Соловьева
ФГБУ «НИИ фтизиопульмонологии» МЗ РФ
Россия
Россия
заведующая бактериологической лабораторией,
194064, г. Санкт-Петербург, Политехническая ул., д. 32
Т. В. Сунчалина
Республиканский противотуберкулезный диспансер
Россия
Россия
биолог,
185000, г. Петрозаводск, ул. льва толстого, д. 40
И. В. Мокроусов
ФБУН «НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера»
Россия
Россия
ведущий научный сотрудник лаборатории молекулярной микробиологии,
197101, г. Санкт-Петербург, ул. мира, д. 14
В. Ю. Журавлев
ФГБУ «НИИ фтизиопульмонологии» МЗ РФ
Россия
Россия
руководитель отдела лабораторной диагностики,
191014, г. Санкт-Петербург, лиговский пр., д. 2-4
О. В. Нарвская
ФБУН «НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера»; ФГБУ «НИИ фтизиопульмонологии» МЗ РФ
Россия
Россия
заведующая лабораторией молекулярной микробиологии,
197101, г. Санкт-Петербург, ул. мира, д. 14
Список литературы
1. Арчакова Л. И., Исаева Н. Ю. Динамика развития эпидемической ситуации по туберкулезу в Северо-Западном федеральном округе России за 2004-2008 годы // Вестник новых медицинских технологий. - 2009. - Т. 16, № 4. - С. 160-162.
2. Вязовая А. А., Мокроусов И. В., Оттен Т. Ф. и др. Молекулярно-генетическая характеристика штаммов Mycobacterium tuberculosis, циркулирующих в Псковской области // Туб. и болезни легких. - 2012. - № 6. - С. 35-39.
3. Маркелов Ю. М. Клинико-эпидемиологические особенности туберкулеза с множественной лекарственной устойчивостью и причины его распространения в Карелии // Туб. и болезни легких. - 2011. - № 8. - С. 11-17.
4. Маркелов Ю. М., Нарвская О. В. Циркуляция штаммов возбудителя туберкулеза с множественной лекарственной устойчивостью на территории Республики Карелия // Туб. и болезни легких. - 2010. - № 2. - С. 54-56.
5. Нарвская О. В., Журавлев В. Ю., Соловьева Н. С. и др. Сполигопрофили Mycobacterium tuberculosis на Северо-Западе России. База данных № 2014620898 [Электронный ресурс] / ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера; ФГБУ «СПб НИИФ» Минздрава России. СПб., 2014. 1 электрон. опт. диск (CD-ROM): текст, табл. (336 Kb). Загл. с этикетки диска.
6. Огарков О. Б., Медведева Т. В., Zozio T. и др. Молекулярное типирование штаммов микобактерий туберкулеза в Иркутской области (Восточная Сибирь) в 2000-2005 гг. // Молекулярная медицина. - 2007. - № 2. - С. 33-38.
7. Эпидемическая ситуация по туберкулезу в России в 2014 г. (1.06 Mb) [Электронный ресурс] // Федеральный Центр мониторинга противодействия распространению туберкулеза [Офиц.сайт]. URL: http://www.mednet.ru/images/stories/files/CMT/tub_epidsituaciya.pdf (дата обращения: 15.09.2015).
8. Brudey K., Driscoll J. R., Rigouts L. et al. Mycobacterium tuberculosis complex genetic diversity: mining the fourth international spoligotyping database (SpolDB4) for classification, population genetics and epidemiology // BMC Microbiol. - 2006. - Vol. 6. - P. 23-30.
9. Demay C., Liens B., Burguière T. et al. SITVITWEB - A publicly available international multimarker database for studying Mycobacterium tuberculosis genetic diversity and molecular epidemiology // Infect. Genet. Evol. - 2012. - Vol. 12. - P. 755-766.
10. Gibson A., Huard R., Gey van Pittius N. et al. Application of sensitive and specific molecular methods to uncover global dissemination of the major RDRio Sublineage of the Latin American-Mediterranean Mycobacterium tuberculosis spoligotype family // J. Clin. Microbiol. - 2008. - Vol. 46, № 4. - P. 1259-1267.
11. Kamerbeek J., Schouls L., Kolk A. et al. Simultaneous detection and strain differentiation of Mycobacterium tuberculosis for diagnosis and epidemiology // J. Clin. Microbiol. - 1997. - Vol. 35, № 4. - P. 907-914.
12. Kovalev S. Y., Kamaev E. Y., Kravchenko M. A. et al. Genetic analysis of Mycobacterium tuberculosis strains isolated in Ural region, Russian Federation, by MIRU-VNTR genotyping // Int. J.Tuberc. Lung Dis. - 2005. - Vol. 9, № 7. - P. 46-52.
13. Mäkinen J., Marjamäki M., Haanperä-Heikkinen M. et al. Extremely high prevalence of multidrug resistant tuberculosis in Murmansk, Russia: a population-based study // Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. - 2011. - Vol. 30. - P. 1119-1126.
14. Mokrousov I., Narvskaya O., Vyazovaya A. et al. Russian „successful“ clone B0/W148 of Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype: a multiplex PCR assay for rapid detection and global screening // J. Clin. Microbiol. - 2012. - Vol. 50, № 11. - P. 3757-3759.
15. Smit P. W., Haanperä M., Rantala P. et al. Molecular epidemiology of tuberculosis in Finland, 2008-2011. // PLoS One. - 2013. - 26;8(12):e85027. doi: 10.1371 / journal. pone. 0085027. eCollection 2013.
16. Supply P., Allix C., Lesjean S. et al. Proposal for standardization of optimized mycobacterial interspersed repetitive unit-variable-number tandem repeat typing of Mycobacterium tuberculosis // J. Clin. Microbiol. - 2006. - Vol. 44, № 12. - P. 4498-4510.
17. Van Embden J., Cave M., Crawford J. et al. Strain identification on Mycobacterium tuberculosis by DNA fingerprinting: recommendations for a standardized methodology // J. Clin. Microbiol. - 1993. - Vol. 31. - Р. 406-409.
18. World Health Organisation. Multidrug and extensively drug-resistant TB (M/XDR-TB): 2010 global report on surveillance and response. WHO/HTM/TB/2010.3. WHO, Geneva; 2010.
Рецензия
Для цитирования:
Вязовая А.А., Соловьева Н.С., Сунчалина Т.В., Мокроусов И.В., Журавлев В.Ю., Нарвская О.В. Характеристика популяции Mycobacterium tuberculosis в Республике Карелия. Туберкулез и болезни легких. 2016;94(8):48-53. https://doi.org/10.21292/2075-1230-2016-94-8-48-53
For citation:
Vyazovaya A.A., Solovieva N.S., Sunchalina T.V., Mokrousov I.V., Zhuravlev V.Yu., Narvskaya O.V. CHARACTERISTICS OF MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS POPULATION IN KARELIYA REPUBLIC. Tuberculosis and Lung Diseases. 2016;94(8):48-53. (In Russ.) https://doi.org/10.21292/2075-1230-2016-94-8-48-53
Просмотров:
827
Послать статью по эл. почте 