Сполиготипирование туберкулезных микобактерий, выделенных от человека и крупного рогатого скота

Цель исследования: анализ видов и генетических линий туберкулезных микобактерий, выделенных от человека и крупного рогатого скота, 2 методом сполиготипирования.

Материалы и методы. Объектом исследования служил биологический материал от крупного рогатого скота, а также работников животноводческих ферм (ежегодно проходивших флюорографическое исследование) и больных туберкулезом пациентов. Для идентификации микобактерий использовали метод сполиготипирования.

Результаты. Представлена оценка вариабельности участков внутри прямых повторов (спейсеров), которые в лабораторной диагностике используются при сполиготипировании микобактерий и идентификации возбудителей туберкулеза. Сопоставление встречаемости комбинаций различных спейсеров у анализируемых микобактерий в исследуемом материале, идентифицированных как Mycobacteriumtuberculosiscomplex, со сполигопрофилем известных микобактерий устанавливает принадлежность их к конкретной генетической линии. Исследованные изоляты изучены микроскопическими, бактериологическими и молекулярно-генетическими (ПЦР) методами. По результатам сполиготипирования определена их принадлежность к генетическим линиям M. tuberculosisBeijing, LAM и Haarlem.

1. Гулюкин А. М., Хисматуллина Н. А., Хаертынов К. С., Шуралев Э. А., Ахмадеев Р. М., Найманов А. Х., Мукминов М. Н., Валеева А. Р. Использование антигенов микобактерий M. bovis BCG-1, M. bovis-8 и M. bovis Valee-88 для иммуноферментного анализа сывороток крови крупного рогатого скота // Труды Всероссийского НИИ экспериментальной ветеринарии им. Я. Р Коваленко. - 2013. - Т. 77. - С. 200-203.

2. Данко Ю. Ю. Постановка в Миланской клинике диагноза на туберкулез у кота, поступившего из Киевского питомника // Иппология и ветеринария. - 2016. - № 3 (21). - С. 110-115.

3. Завгородний А. И., Позмогова С. А., Дзьомбак Д. В., Гирка М. А. Выделение M. paratuberculosis из биоматериала от КРС // Ветеринарна медицина. -2011. - № 95. - С. 103-104.

4. Закон РФ от 14 мая 1993 г. № 4979-1 О ветеринарии (с изменениями на 27.12.2018 г.) // Электронный фонд правовой и нормативно-технической документации. АО «Кодекс», 2019. URL: http://docs.cntd.ru/document/9004249

5. Макарова М. В. Нетуберкулезные микобактерии: классификация, эпидемиология, патология у людей и животных, лабораторная диагностика // Пробл. туб. и болезней легких. - 2007. - Т. 84, № 10. - С. 7-17.

6. Павлова И. Б., Банникова Д. А. Экологические аспекты существования и развития популяций микобактерий // Ветеринарная патология. - 2004. -№ 1-2. - С. 65-68.

7. Прокопьева Н. И., Протодьяконова Г. П., Павлов Н. Г., Обоева Н. А. Нетуберкулезные (атипичные) микобактерии, выделенные от животных и людей // Аграрный вестник Урала. - 2011. - Т. 84, № 5. - С. 29-30.

8. Романенко В. Ф. Эпизоотолого-эпидемиологические особенности микобактерий туберкулеза // Ветеринария. - 2013. - № 7. - С. 23-28.

9. Санитарно-эпидемиологические правила СП 3.1.2.3114-13 (с изменениями на 06.02.2015 г.) // Электронный фонд правовой и нормативно-технической документации. АО «Кодекс», 2019. URL: http://docs.cntd.ru/document/499056594.

10. Старкова Д. А. Mycobacterium avium - актуальный возбудитель микобактериоза человека // Инфекция и иммунитет. - 2013. - Т. 3, № 1. - С. 7-14.

11. Хаммадов Н. И. Изучение эффективности различных молекулярногенетических методов идентификации и дифференциации возбудителей туберкулеза и атипичных микобактерий: Автореф. дис. ... канд. биол. наук. - Казань, 2010. - 23 c.

12. Kamerbeek J., Schouls L., Kolk A., van Agterveld M., van Soolingen D., Kuijper S., Bunschoten A., Molhuizen H., Shaw R., Goyal M., van Embden J. Simultaneous detection and strain differentiation of Mycobacterium tuberculosis for diagnosis and epidemiology // J. Clin. Microbiol. - 1997. - Vol. 35, № 4. -Р. 907-914.

13. Moravkova M., Slany M., Trcka I., Havelkova M., Svobodova J., Skoric M., Heinigeova B., Pavlik I. Human-to-human and human-to-dog Mycobacterium tuberculosis transmission studied by IS6110 RFLP analysis: a case report // Veterinarni Medicina. - 2011. - Vol. 56, № 6. - Р. 314-317.

14. Muwonge A., Johansen T. B., Vigdis E., Godfroid J., Olea-Popelka F., Biffa D., Skjerve E., Djonne B. Mycobacterium bovis infections in slaughter pigs in Mubende district, Uganda: a public health concern // BMC Veterinary Research. - 2012. - № 8. - Р. 168. DOI: 10.1186/1746-6148-8-168.

15. Tirkkonen T., Nieminen T., Ali-Vehmas T., Peltoniemi O. A. T., Wellenberg G. J., Pakarinen J. Quantification of Mycobacterium avium subspecies in pig tissues by real-time quantitative PCR // Acta. Vet. Scand. - 2013. - № 55. - Р. 26. DOI: 10.1186/1751-0147-55-26.

16. Vitol I., Driscoll J., Kreiswirth B., Kurepina N., Bennett K. P. Identifying Mycobacterium tuberculosis complex strain families using spoligotypes // Infect. Genet. Evol. - 2006. - Vol. 6, № 6. - Р 491-504. DOI: 10.1016/j.meegid.2006.03.003.

17. Zhang J., Abadia E., Refregier G., Tafaj S., Boschiroli M. L., Guillard B., Andremont A., Ruimy R., Sola C. Mycobacterium tuberculosis complex CRISPR genotyping: improving efficiency, throughput and discriminative power of 'spoligotyping' with new spacers and a microbead-based hybridization assay // J. Med. Microbiol. - 2010. - Vol. 59 (Pt. 3). - Р. 285-294. DOI: 10.1099/jmm.0.016949-0.