Анализ ассоциации полиморфизма Asp299Gln (rs 4986790) и Thr399Ile (rs 4986791) гена TLR4 с риском развития саркоидоза легких (на примере жителей Карелии)
https://doi.org/10.21292/2075-1230-2022-100-9-16-20
Аннотация
Цель исследования: изучить связи полиморфизма Asp299Gln (rs 4986790) и Thr399Ile (rs 4986791) гена TLR4 с риском развития саркоидоза легких у русского населения Республики Карелия.
Материалы и методы. Обследовано 253 человека: 122 больных с диагнозом морфологически верифицированного саркоидоза с поражением легких (средний возраст 41,00 ± 12,56 года) (группа саркоидоз) и 131 здоровый донор (группа сравнения) (средний возраст 44,00 ± 14,23 года). Все обследованные обеих групп считали себя по национальности русскими, о чем сообщили в проведенном анкетировании. Исследовано распределение аллелей и генотипов по полиморфным маркерам Asp299Gln (rs 4986790) и Thr399Ile (rs 4986791) гена TLR4 в группе больных саркоидозом легких и в группе сравнения. Генотипирование проводилось методом ПЦР-ПДРФ.
Результаты. Статистически значимых различий в распределении частот аллелей и генотипов по полиморфным маркерам Asp299Gln (rs 4986790) и Thr399Ile (rs 4986791) гена TLR4 между группой саркоидоз и группой сравнения не выявлено (χ2 = 0, df = 1, p = 0,997 и χ2 = 1,0, df = 2, p = 0,606; χ2 = 0,785, df = 1, p = 0,376 и χ2 = 0, df = 2, p = 1,0).
Заключение. Полиморфные маркеры Asp299Gln (rs 4986790) и Thr399Ile (rs 4986791) гена TLR4 не связаны с риском развития саркоидоза легких у русского населения Республики Карелия.
Ключевые слова
Об авторах
И. Е. МалышеваРоссия
Малышева Ирина Евгеньевна, кандидат биологических наук,
старший научный сотрудник лаборатории генетики
185910, г. Петрозаводск, ул. Пушкинская, д. 11
Тел./факс: (8142) 57-31-07 (р.); (8142) 76-98-10
Л. В. Топчиева
Россия
Топчиева Людмила Владимировна, кандидат биологических наук, ведущий научный сотрудник лаборатории генетики
185910, г. Петрозаводск, ул. Пушкинская, д. 11
Тел./факс: (8142) 57-31-07 (р.); (8142) 76-98-10
Э. Л. Тихонович
Россия
Тихонович Элла Леонидовна, заведующая отделением респираторной терапии
185019, г. Петрозаводск, ул. Пирогова, д. 3
Тел.: (8142) 76-39-10
Список литературы
1. Анохин В. А., Акчурина Л. Б., Хасанова Г. Р. Полиморфизмы толл-лайк-рецептора 4 и инфекционные болезни // Инфекционные болезни. ‒ 2013. ‒ Т. 11, № 4. ‒ С. 60-64.
2. Малышева И. Е., Топчиева Л. В., Тихонович Э. Л. Роль полиморфизма генов в чувствительности к саркоидозу легких // Пульмонология. ‒ 2019. ‒ Т. 29, № 5. ‒ С. 596-603. https://doi.org/10.18093/0869-0189-2019-29-5-596-603.
3. Чучалин А. Г., Визель А. А., Илькович М. М. и др. Диагностика и лечение саркоидоза. Резюме федеральных согласительных клинических рекомендаций. Часть 1 // Вестник современной клинической медицины. ‒ 2014. ‒ Т. 7, № 4. ‒ С. 62-70.
4. Agnese D., Calvano J., Hahm S., Coyle S., Hahm S., Coyle S., Corbett S., Calvano S., Lowry S. Human toll-like receptor 4 mutations but not CD14 polymorphisms are associated with an increased risk of gram-negative infections // J. Infect. Dis. ‒ 2002. ‒ Vol. 186, № 10. ‒ Р. 1522-1525.
5. Anwar M. A., Choi S. Structure-activity relationship in TLR4 mutations: atomistic molecular dynamics simulations and residue interaction network analysis // Sci. Rep. ‒ 2017. ‒ № 7. ‒ Р. 43807. doi: 10.1038/srep43807.
6. Arbour N. C., Lorenz E., Schutte B. C., Zabner J., Kline J. N., Jones M., Frees K., Watt J. L., Schwartz D. A. TLR4 mutations are associated with endotoxin hyporesponsiveness in humans // Nature Genet. ‒ 2000. ‒ Vol. 25, № 2. ‒ Р. 187-191.
7. Bickett A. N., Lower E. E., Baughman R. P. Sarcoidosis diagnostic score: a systematic evaluation to enhance the diagnosis of sarcoidosis // Chest. ‒ 2018. ‒ Vol. 154, № 5. ‒ Р. 1052-1060. DOI: 10.1016/j.chest.2018.05.003.
8. Dubaniewicz A., Dubaniewicz-Wybieralska M., Sternau A., Zwolska Z., Izycka-Swieszewska E., Augustynowicz-Kopec E., Skokowski J., Singh M., Zimnoch L. Mycobacterium tuberculosis complex and mycobacterial heat shock proteins in lymph node tissue from patients with pulmonary sarcoidosis // J. Clin. Microbiol. ‒ 2006. ‒ Vol. 44, № 9. ‒ Р. 3448-3451. doi: 10.1128/JCM.01433-06.
9. Fouad N. A., Saeed A. M., Mahedy A. W. Toll like receptor-4 gene polymorphism and susceptibility to pulmonary tuberculosis // Egypt. J. Immunol. ‒ 2019. ‒ Vol. 26, № 2. ‒ Р. 1-10.
10. Grunewald J., Grutters J. C., Arkema E. V., Saketkoo L. A., Moller D. R., Müller-Quernheim J. Sarcoidosis // Nat. Rev. Dis. Primers. ‒ 2019. ‒ Vol. 5, № 1. ‒ Р. 45. doi: 10.1038/s41572-019-0096-x.
11. Iliadi A., Makrythanasis P., Tzetis M., Tsipi M., Traeger-Synodinos J., Ioannou P. C., Rapti A., Kanavakis E., Christopoulos T. K. Association of TLR4 single-nucleotide polymorphisms and sarcoidosis in Greek patients // Genet Test Mol. Biomarkers. ‒ 2009. ‒ Vol. 13, № 6. ‒ Р. 849-853. doi: 10.1089/gtmb.2009.0117.
12. Ohto U., Yamakawa N., Akashi-Takamura S., Miyake K., Shimizu T. Structural analyses of human Toll-like receptor 4 polymorphisms D299G and T399I // J. Biol. Chem. ‒ 2012. ‒ Vol. 287, № 48. ‒ Р. 40611-40617. doi: 10.1074/jbc.M112.404608.
13. Pabst S., Baumgarten G., Stremmel A., Lennarz M., Knüfermann P., Gillissen A., Vetter H., Grohé C. Toll-like receptor (TLR)4 polymorphisms are associated with a chronic course of sarcoidosis // Clin. Exp.Immunol, ‒ 2006. ‒ Vol. 143, № 3. ‒ Р. 420-426.
14. Płóciennikowska A., Hromada-Judycka A., Borzęcka K., Kwiatkowska K. Co-operation of TLR4 and raft proteins in LPS-induced pro-inflammatory signaling // Cell Mol. Life Sci. ‒ 2015. ‒ Vol. 72, № 3. ‒ Р. 557-581. doi: 10.1007/s00018-014-1762-5.
15. Schroder N. W., Schumann R. R. Single nucleotide polymorphisms of toll-like receptors and susceptibility to infectious disease // Lancet Infect. Dis. ‒ 2005. ‒ № 5. ‒ Р. 156-164.
16. Schürmann M., Kwiatkowski R., Albrecht M., Fischer A., Hampe J., Müller-Quernheim J., Schwinger E., Schreiber S. Study of Toll-like receptor gene loci in sarcoidosis // Clin. Exp. Immunol. ‒ 2008. ‒ Vol. 152, № 3. ‒ Р. 423-431. doi: 10.1111/j.1365-2249.2008.03621.x.
17. Smirnova I., Hamblin M. T., McBride C., Beutler B. et al. Excess of rare amino acid polymorphisms in the Toll-like receptor 4 in humans // Genetics. ‒ 2001. ‒ Vol. 158, № 4. ‒ Р. 1657-1664.
18. Veltkamp M., Grutters J. C., van Moorsel C. H., Ruven H. J., van den Bosch J. M. Toll-like receptor (TLR) 4 polymorphism Asp299Gly is not associated with disease course in Dutch sarcoidosis patients // Clin. Exp. Immunol. ‒ 2006. ‒ Vol. 145, № 2. ‒ Р. 215-218. doi: 10.1111/j.1365-2249.2006.03127.x.
19. Veltkamp M., Wijnen P., van Moorsel C., Rijkers G., Ruven H., Heron M., Bekers O., Claessen A., Drent M., van den Bosch J., Grutters J. Linkage between Toll-like receptor (TLR) 2 promotor and intron polymorphisms: functional effects and relevance to sarcoidosis // Clin. Exp. Immunol. ‒ 2007. ‒ Vol. 149, № 3. ‒ Р. 453-462. doi: 10.1111/j.1365-2249.2007.03428.x.
Рецензия
Для цитирования:
Малышева И.Е., Топчиева Л.В., Тихонович Э.Л. Анализ ассоциации полиморфизма Asp299Gln (rs 4986790) и Thr399Ile (rs 4986791) гена TLR4 с риском развития саркоидоза легких (на примере жителей Карелии). Туберкулез и болезни легких. 2022;100(9):16-20. https://doi.org/10.21292/2075-1230-2022-100-9-16-20
For citation:
Malysheva I.E., Topchieva L.V., Tikhonovich E.L. Analysis of Association of Asp299Gln (rs 4986790) and Thr399Ile (rs 4986791) Polymorphisms of the TLR4 Gene with Risk of Developing Lung Sarcoidosis (Using the Example of Residents of Karelia). Tuberculosis and Lung Diseases. 2022;100(9):16-20. (In Russ.) https://doi.org/10.21292/2075-1230-2022-100-9-16-20