Внутривидовое разнообразие Mycobacterium abscessus, выделенных от пациентов с поражениями легких

Цель исследования: провести внутривидовую дифференциацию штаммов M. abscessus, выделенных от пациентов с поражениями легких, с использованием молекулярно-генетических методов.

Результаты. Внутривидовая дифференциация 164 культур M. abscessus от 114 пациентов без муковисцидоза показала, что в выборке доминировал подвид M. abscessus subsp. abscessus (90 пациентов из 114; 78,95%), на втором месте по частоте выявления шел M. abscessus subsp. massiliense (24/114; 21,05%). У 54 обследованных пациентов с муковисцидозом, выделяющих нетуберкулезные микобактерии, чаще всего выявляли M. abscessus (41 пациент из 54; 75,93%). Внутривидовая идентификация полученных изолятов M. abscessus, показала превалирование подвида M. abscessus subsp. abscessus (29/41; 70,73%) над M. abscessus subsp. massiliense (11/41; 26,83%). В одном случае был выявлен редкий M. abscessus subsp. bolletii (1/41; 2,44%).

1. Гунтупова Л. Д., Борисов С. Е., Соловьева И. П., Макарова М. В., Хачатурьянц Е. Н. Микобактериозы во фтизиопульмонологической практике: обзор литературы и собственный опыт // Практическая медицина. - 2011. - №. 51. - С. 39-50.

2. Смирнова Т. Г., Андреевская С. Н., Ларионова Е. Е., Андриевская И. Ю., Устинова В. В., Черноусова Л. Н. Мониторинг видового разнообразия нетуберкулезных микобактерий в ряде областей РФ с использованием ДНК-стрипов GenoType Mycobacterium CM/AS (Hain Lifescience, Германия) // Туберкулёз и болезни лёгких. - 2017. - Т. 95, № 5. - С. 54-59.

3. Старкова Д. А., Журавлев В. Ю., Вязовая А. А., Соловьева Н. С., Куликова О. Н., Нарвская О. В. Видовое разнообразие нетуберкулезных микобактерий у больных микобактериозом на территориях Северо-Западного федерального округа России. // Туберкулёз и болезни лёгких. - 2019. - Т. 97, № 6. - С. 16-22.

4. Шмелев Е. И., Ковалевская М. Н., Эргешов А. Э., Черноусова Л. Н., Ларионова Е. Е. Микобактериозы в практике врача-пульмонолога: состояние проблемы // Практическая пульмонология. - 2016. - № 3. - С. 37-42.

5. Adékambi T., Berger P., Raoult D., Drancourt M. rpoB gene sequence-based characterization of emerging non-tuberculous mycobacteria with descriptions of Mycobacterium bolletii sp. nov., Mycobacterium phocaicum sp. nov. and Mycobacterium aubagnense sp. nov. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2006, vol. 56, no. 1, pp. 133-143.

6. Adékambi T., Reynaud-Gaubert M., Greub G., Gevaudan M. J., La Scola B., Raoult D., Drancourt M. Amoebal coculture of «Mycobacterium massiliense» sp. nov. from the sputum of a patient with hemoptoic pneumonia. J Clin Microbiol., 2004, vol. 42, no. 12, pp. 5493-5501.

7. Aitken M. L., Burke W., McDonald G., Wallis C., Ramsey B., Nolan C. Nontuberculous mycobacterial disease in adult cystic fibrosis patients. Chest., 1993, vol. 103, no. 4, pp. 1096-1099.

8. Bryant J. M., Grogono D. M., Greaves D., Foweraker J., Roddick I., Inns T., Reacher M., Haworth C. S., Curran M. D., Harris S. R., Peacock S. J., Parkhill J., Floto R. A. Whole-genome sequencing to identify transmission of Mycobacterium abscessus between patients with cystic fibrosis: a retrospective cohort study. Lancet., 2013, vol. 4, no. 381, pp. 1551-1560.

9. Gupta R. S., Lo B., Son J. Phylogenomics and Comparative Genomic Studies Robustly Support Division of the Genus Mycobacterium into an Emended Genus Mycobacterium and Four Novel Genera. Front Microbiol., 2018, vol. 13, no. 9.

10. Haworth C. S., Banks J., Capstick T., Fisher A. J., Gorsuch T., Laurenson I. F., Leitch A., Loebinger M. R., Milburn H. J., Nightingale M., Ormerod P., Shingadia D., Smith D., Whitehead N., Wilson R., Floto R. A. British Thoracic Society guidelines for the management of non-tuberculous mycobacterial pulmonary disease (NTM-PD). Thorax., 2017, vol. 72 (Suppl. 2), pp. 1-64.

11. Hjelte L., Petrini B., Kallenius G., Strandvik B. Prospective study of mycobacterial infections in patients with cystic fibrosis. Thorax., 1990, vol. 45, no. 5, pp. 397-400.

12. Hoefsloot W., van Ingen J., Andrejak C., Angeby K., Bauriaud R., Bemer P., Beylis N., Boeree M. J., Cacho J., Chihota V., Chimara E., Churchyard G., Cias R., Daza R., Daley C. L., Dekhuijzen P. N., Domingo D., Drobniewski F., Esteban J., Fauville-Dufaux M., Folkvardsen D. B., Gibbons N., Gomez-Mampaso E., Gonzalez R., Hoffmann H., Hsueh P. R., Indra A., Jagielski T., Jamieson F., Jankovic M., Jong E., Keane J., Koh W. J., Lange B., Leao S., Macedo R., Mannsaker T., Marras T. K., Maugein J., Milburn H. J., Mlinko T., Morcillo N., Morimoto K., Papaventsis D., Palenque E., Paez-Pena M., Piersimoni C., Polanova M., Rastogi N., Richter E., Ruiz-Serrano M. J., Silva A., da Silva M. P., Simsek H., van Soolingen D., Szabo N., Thomson R., Tortola Fernandez T., Tortoli E., Totten S. E., Tyrrell G., Vasankari T., Villar M., Walkiewicz R., Winthrop K. L., Wagner D. Nontuberculous Mycobacteria Network European Trials Group. The geographic diversity of nontuberculous mycobacteria isolated from pulmonary samples: an NTM-NET collaborative study. Eur Respir J., 2013, vol. 42, no. 6, pp. 1604-1613.

13. Kusunoki S., Ezaki T. Proposal of Mycobacterium peregrinum sp. nov., nom. rev., and elevation of Mycobacterium chelonae subsp. abscessus (Kubica et al.) to species status: Mycobacterium abscessus comb. nov. Int. J. Syst. Bacteriol., 1992, vol. no. 42, pp. 240-245.

14. Leão S. C., Tortoli E., Euzeby J. P., Garcia M. J. Proposal that Mycobacterium massiliense and Mycobacterium bolletii be united and reclassified as Mycobacterium abscessus subsp. bolletii comb. nov., designation of Mycobacterium abscessus subsp. abscessus subsp. nov. and emended description of Mycobacterium abscessus. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2011, vol. 61, no. 9, pp. 2311-2313.

15. Moore M., Frerichs J. B. An unusual acid-fast infection of the knee with subcutaneous, abscess-like lesions of the gluteal region; report of a case with a study of the organism, Mycobacterium abscessus, n. sp. J Invest Dermatol., 1953, vol. 20, no. 2, pp. 133-169.

16. Olivier K. N., Weber D. J., Wallace R. J. Jr, Faiz A. R., Lee J. H., Zhang Y., Brown-Elliot B. A., Handler A., Wilson R. W., Schechter M. S., Edwards L. J., Chakraborti S., Knowles M. R. Nontuberculous Mycobacteria in Cystic Fibrosis Study Group. Nontuberculous mycobacteria. I: multicenter prevalence study in cystic fibrosis. Am J Respir Crit Care Med., 2003, vol. 15, no. 6, pp. 828-834.

17. Smirnova T., Ustinova V., Andreevskaya S., Larionova E., Kiseleva E., Chernousova L., Varlamov D., Sochivko D., Ergeshov A. Evaluation of a new assay for nontuberculous mycobacteria species identification in diagnostic material and cultures. Tuberculosis (Edinb). 2021, vol. 130, pp. 102124.

18. Tortoli E., Kohl T. A., Brown-Elliott B. A., Trovato A., Leao S. C., Garcia M. J., Vasireddy S., Turenne C. Y., Griffith D. E., Philley J. V., Baldan R., Campana S., Cariani L., Colombo C., Taccetti G., Teri A., Niemann S., Wallace R. J. Jr, Cirillo D. M. Emended description of Mycobacterium abscessus, Mycobacterium abscessus subsp. abscessus and Mycobacterium abscessus subsp. bolletii and designation of Mycobacterium abscessus subsp. massiliense comb. nov. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2016, vol. 66, no. 11, pp. 4471-4479.

19. Ustinova V. V., Smirnova T. G., Sochivko D. G., Varlamov D. A., Larionova E. E., Andreevskaya S. N., Andrievskaya I. Yu., Kiseleva E. A., Chernousova L. N., Ergeshov A. New assay to diagnose and differentiate between Mycobacterium tuberculosis complex and nontuberculous mycobacteria. Tuberculosis., 2019, vol. 114, pp. 17-23.