Анализ экспрессии генов в легочной ткани у мышей конгенных по комплексу Н2-линий, отличающихся по тяжести течения туберкулезной инфекции

С помощью ДНК-чипа на платформе Illumina проведен сравнительный анализ экспрессии в легочной ткани всех генов двух конгенных линий мышей - резистентной к туберкулезу В6 и гораздо более чувствительной B6.I-9.5.7, отличающейся от В6 лишь небольшой областью 17-й хромосомы, несущей гены МНС класса II. Сравнивали здоровых мышей и мышей, зараженных аэрогенным способом ~500 КОЕ Mycobacterium tuberculosis H37Rv за три недели до выделения мРНК. Верификация результатов методом количественной ПЦР в реальном времени показала, что тот участок генома, по которому отличаются линии мышей, генетически настолько полиморфен, что технически не позволяет применять для сравнения экспрессии содержащихся в нем генов методы на основе ДНК-чипов, разработанных специально для линии В6. Напротив, влияние инфекции на экспрессию всех остальных генов определялось с высокой точностью. Показано, что у мышей резистентной линии В6 число генов, изменивших экспрессию на ранней фазе инфекции, значительно выше, чем у чувствительной линии B6.I-9.5.7. У мышей двух линий отличается, прежде всего, экспрессия генов, ответственных за иммунный ответ, регуляцию клеточного цикла и работу лизосом. Можно предположить, что резистентность основана на вовлечении во взаимодействие с возбудителем большего количества метаболических путей и их регуляторов.

инбредные линии мышей, туберкулез, экспрессия генов, легкие

1. Коротецкая М. В., Авербах М. М., Апт А. С., Логунова Н. Н. Локус комплекса Н2, участвующий в контроле туберкулезной инфекции, локализуемый в области генов класса II // Туб. - 2013. - № 10. - С. 51-56.

2. Huang da W., Sherman B. T., Lempicki R. A. Systematic and integrative analysis of large gene lists using DAVID bioinformatics resources // Nat. Protoc. - 2009 - Vol. 4. - P. 44-57.

3. Lavebratt C., Apt A. S., Nikonenko B. V. et al. Severity of tuberculosis in mice is linked to distal chromosome 3 and proximal chromosome 9 // J. Inf. Dis. - 1999. - Vol. 180 - P. 150-155.

4. Logunova N. N., Korotetskaya M. V., Polshakov V. I. et al. The QTL within the H2 complexinvolved in the control of tuberculosis infection in mice is the classical Class II H2-Ab1 gene // PLoS Genetics. - 2015, submitted.

5. Pan H., Yan B. S., Rojas M. et al. Ipr1 gene mediates innate immunity to tuberculosis / Nature. - 2005. - Vol. 434. - P. 767-772.

6. Radaeva T. V., Kondratieva E. V., Sosunov V. V. et al. A human-like TB in genetically susceptible mice followed by the true dormancy in a Cornell-like model // Tuberculosis (Edinb.) - 2008. - Vol. 88. - P. 576-585.

7. Sanchez F., Radaeva T. V., Nikonenko B. V. et al. Multigenic control of disease severity after Mycobacterium tuberculosis infection in mice // Infect. Immun. - 2003. - Vol. 71. - P. 126-131.

8. Schurr E., Kramnik I. Genetic сontrol of hosts Susceptibility to tuberculosis. In: Handbook of tuberculosis: Immunology and cell biology / Eds. Kaufmann S. H. E., Britton W. J. Weinheim: WILEY-VCH Verlag. - 2008. - P. 295-336.

9. Yan B. S., Kirby A., Shebzukhov Y. V. et al. Genetic architecture of tuberculosis resistance in a mouse model of infection // Genes Immun. - 2006. - Vol. 7. - P. 201-210.