Генетические особенности возбудителя туберкулеза в Уральском федеральном округе России


https://doi.org/10.21292/2075-1230-2016-94-8-60-65

Полный текст:


Аннотация

Представлена молекулярно-генетическая характеристика изолятов Mycobacterium tuberculosis, полученных в 2009-2011 гг. на территории Урала от 178 ранее не леченных и 78 ранее леченных больных туберкулезом. ПЦР в режиме реального времени и MIRU-VNTR-типирование по 15 локусам выявили доминирование M. tuberculosis генотипа Beijing в обеих группах пациентов, однако доля изолятов Beijing у ранее леченных больных существенно превышала таковую в группе ранее не леченных больных: 80,8% против 55,1% (p = 0,0002). IS6110-RFLP-типирование доказало принадлежность большинства изолятов Beijing к эпидемиологически и клинически значимому в России клону В0. Установлено, что M. tuberculosis Beijing, несущие мутации rpoB Ser531→Leu и katG Ser315→Thr, играют ключевую роль в распространении туберкулеза с МЛУ возбудителя на Урале. Группа non-Beijing была представлена изолятами различных сполиготипов и MIRU-VNTR-типов, среди которых преобладали представители нескольких глобально-распространенных генетических групп LAM (LAM9, T5_RUS), URAL (Н3), Haarlem (H1, X), Т (Т1).

Об авторах

Т. В. Умпелева
Уральский НИИ фтизиопульмонологии
Россия

кандидат биологических наук, старший научный сотрудник,

620039, г. Екатеринбург, ул. 22 Партсъезда, д. 50



А. А. Вязовая
Санкт-Петербургский НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера
Россия

кандидат биологических наук, старший научный сотрудник,

197101, г. Санкт-Петербург, ул. мира, д. 14



Н. И. Еремеева
Уральский НИИ фтизиопульмонологии
Россия

кандидат биологических наук, старший научный сотрудник,

620039, г. Екатеринбург, ул. 22 Партсъезда, д. 50



М. А. Кравченко
Уральский НИИ фтизиопульмонологии
Россия

кандидат биологических наук, заведующая лабораторией,

620039, г. Екатеринбург, ул. 22 Партсъезда, д. 50



О. В. Нарвская
Санкт-Петербургский НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера
Россия

доктор медицинских наук, профессор, ведущий научный сотрудник,

197101, г. Санкт-Петербург, ул. мира, д. 14



С. Н. Скорняков
Уральский НИИ фтизиопульмонологии
Россия

доктор медицинских наук, профессор, директор,

620039, г. Екатеринбург, ул. 22 Партсъезда, д. 50



Список литературы

1. Балабанова Я. М., Николаевский В. В., Ради М. и др. Преобладание штаммов Mycobacterium tuberculosis семейства Beijing и факторы риска их трансмиссии в Самарской области // Пробл. туб. - 2006. - № 2. - С. 31-36.

2. Баранов А. А., Марьяндышев А. О. Взаимосвязь генотипов и лекарственной устойчивости микобактерий туберкулеза в Баренц-регионе Российской Федерации // Рос. мед. журнал. - 2009. - № 1. - С. 24-26.

3. Вязовая А. А., Мокроусов И. В., Оттен Т. Ф. и др. Молекулярно-генетическая характеристика штаммов Mycobacterium tuberculosis, циркулирующих в Псковской области // Туб. и болезни легких. - 2012. - № 6. - С. 35-39.

4. Еремеева Н. И., Кравченко М. А., Вахрушева Д. В. и др. Оценка контаминации внешней среды противотуберкулезного стационара как компонент системы инфекционного контроля // Мед. альянс. - 2013. - № 4. - С. 41-52.

5. Еремеева Н. И., Кравченко М. А., Канищев В. В. и др. Молекулярно-генетические и фенотипические свойства госпитальных штаммов микобактрией туберкулеза // Инфекция и иммунитет. - 2014. - Специальный выпуск. - С. 79.

6. Лац А. А., Жданова С.Н., Огарков О. Б. и др. Лекарственная устойчивость различных генотипов Mycobacterium tuberculosis у больных туберкулезом в Иркутской области // Известия Иркутского государственного университета. - 2011. - Т. 4, № 4. - С. 58-62.

7. Мокроусов И. В., Нарвская О. В., Вязовая А. А. и др. Геноидентификация эпидемиологически и клинически значимого варианта M. tuberculosis Beijing B0/W148 // Туб. и болезни легких. - 2012. - № 10. - С. 33-36.

8. Нарвская О. В. Геномный полиморфизм Mycobacterium tuberculosis и его роль в эпидемическом процессе: Дис. … д-ра мед. наук. - СПб., 2003.

9. Огарков О. Б., Медведева Т. В., Zozio Т. Молекулярное типирование штаммов микобактерий туберкулеза в Иркутской области (Восточная Сибирь) в 2000-2005 гг. // Молекулярная медицина. - 2007. - № 2. - С. 33-38.

10. Приказ Минздрава РФ № 109 от 21.03.2003 г. «О совершенствовании противотуберкулёзных мероприятий в Российской Федерации».

11. Bifani P. J. Plikaytis B. B., Kapur V. et al. Origin and interstate spread of a New York City multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis clone family // JAMA. - 1996. - Vol. 275. - P. 452-457.

12. Comas I., Homolka S., Niemann S. et al. Genotyping of genetically monomorphic bacteria: DNA sequencing in Mycobacterium tuberculosis highlights the limitations of current methodology // PLoS One. - 2009. - Vol. 4, № 11.

13. Demay C., Liens B., Burguiere Т. et al. SITVITWEB - A publicly available international multimarker database for studying Mycobacterium tuberculosis genetic diversity and molecular epidemiology // Infect. Genet. Evol. - 2012. - Vol. 12, № 4. - Р. 755 -766.

14. Dubiley S. Ignatova A., Mukhina T. et al. Molecular epidemiology of tuberculosis in Tula area, central Russia, before Directly Observed Therapy Strategy // Clin. Microbiol. Infect. - 2010. - Vol. 16, № 9. - P. 1421-1426.

15. van Embden J. D., Cave M. D., Crawford J. T. et al. Strain identification of Mycobacterium tuberculosis by DNA fingerprinting: recommendations for a standardized methodology // J. Clin. Microbiol. - 1993. - № 31. - Р. 406-409.

16. Iwamoto T. Yoshida S., Suzuki K. et al. Hypervariable loci that enhance the discriminatory ability of newly proposed 15-loci and 24-loci variable-number tandem repeat typing method on Mycobacterium tuberculosis strains predominated by the Beijing family // FEMS Microbiol. Lett. - 2007. - Vol. 272. - P. 282-283.

17. Kamerbeek J., Schouls L., Kolk A. et al. Simultaneous detection and strain differentiation of Mycobacterium tuberculosis for diagnosis and epidemiology // J. Clin. Microbiol. - 1997. - № 35. - Р. 907-914.

18. Kovalev S. Y., Kamaev E. Y., Kravchenko M. A. et al. Genetic analysis of Mycobacterium tuberculosis strains isolated in Ural region, Russian Federation, by MIRU-VNTR genotyping // International J. Tub. Lung Disease. - 2005. - № 9. - Р. 746-752.

19. Kremer K., Arnold C., Cataldi A. et al. Discriminatory power and reproducibility of novel DNA typing methods for Mycobacterium tuberculosis complex strains // J. Clin. Microbiol. - 2005. - № 43. -Р. 5628-5638.

20. Kubica T. Rüsch-Gerdes S., Niemann S. et al. The Beijing genotype is emerging among multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis strains from Germany // Int. J. Tuberc. Lung Dis. - 2004. - Vol. 8, № 9. - P. 1107-1113.

21. Kubica T., Agzamova R. Wright A. et al. The Beijing genotype is a major cause of drug-resistant tuberculosis in Kazakhstan // Int. J. Tuberc. Lung Dis. - 2005. - Vol. 9, № 6. - Р. 646-653.

22. Kurepina N. Ramaswamy S., Shashkina E. et al. The sequence analysis of the pncA gene determining the PZA-resistance in the predominant M. tuberculosis strains isolated in the Tomsk penitentiary system, Western Siberia, Russia // Int. J. Tuberc. Lung Dis. - 2001. - Vol. 5, № 11. - P. 41.

23. Mokrousov I. O., Narvskaya A., Vyazovaya et al. Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype in Russia: in search of informative VNTR loci // J. Clin. Microbiol. - 2008. - № 46. - P. 3576-3584.

24. Supply P., Allix C., Lesjean S. et al. Proposal for Standardization of Optimized Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit-Variable-Number Tandem Repeat Typing of Mycobacterium tuberculosis // J. Clin. Microbiol. - 2006. - № 44. - Р. 4498-4510.


Дополнительные файлы

Для цитирования: Умпелева Т.В., Вязовая А.А., Еремеева Н.И., Кравченко М.А., Нарвская О.В., Скорняков С.Н. Генетические особенности возбудителя туберкулеза в Уральском федеральном округе России. Туберкулез и болезни легких. 2016;94(8):60-65. https://doi.org/10.21292/2075-1230-2016-94-8-60-65

For citation: Umpeleva T.V., Vyazovaya A.A., Eremeeva N.I., Kravchenko M.A., Narvskaya O.V., Skornyakov S.N. SPECIFIC GENETIC FEATURES OF TUBERCULOUS MYCOBACTERIA IN URAL FEDERAL DISTRICT OF RUSSIA. Tuberculosis and Lung Diseases. 2016;94(8):60-65. (In Russ.) https://doi.org/10.21292/2075-1230-2016-94-8-60-65

Просмотров: 150

Обратные ссылки

  • Обратные ссылки не определены.


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2075-1230 (Print)
ISSN 2542-1506 (Online)