Определение роли полиморфных вариантов гена интерферона-гамма (IFNG) в развитии туберкулеза у лиц якутской национальности
https://doi.org/10.21292/2075-1230-2020-98-12-27-32
Аннотация
Цель исследования: определение роли полиморфных вариантов Т6000А (rs2430561), Т8360C (rs2069718) гена IFNG в развитии туберкулеза у лиц якутской национальности.
Материал и методы. Дизайн исследования – случай-контроль. Материалом для исследования послужили образцы ДНК 172 больных туберкулезом (группа «случай») и 367 человек с исключенным диагнозом туберкулеза (группа «контроль»). Все участники исследования ‒ лица якутской национальности. Для генотипирования выделена ДНК из венозной крови. Генотипирование проводили методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени. Для статистической обработки использовали критерий χ2 Пирсона и отношение шансов с 95%-ными доверительными интервалами.
Результаты исследования показали, что распределение генотипов полиморфизмов Т6000А (rs2430561), Т8360C (rs2069718) гена IFNG в группах «случай» и «контроль» соответствовало равновесию Харди ‒ Вайнберга. Частоты аллелей и генотипов полиморфизмов Т6000А (rs2430561), T8360C (rs2069718) гена IFNG у больных групп «случай» и «контроль» статистически значимо не отличались.
Выводы. Результаты исследования не выявили ассоциации аллелей и генотипов полиморфных вариантов rs2430561 и rs2069718 гена IFNG с риском развития туберкулеза для лиц якутской национальности.
Об авторах
Л. И. Мордовская
ГБУ РС (Я) «Научно-практический центр "Фтизиатрия"»; Медицинский институт ФГАОУ ВО «Северо-Восточный федеральный университет им. М. К. Аммосова»
Россия
Россия
Мордовская Лариса Ивановна – заведующая иммунологической лабораторией
677005, Республика Саха (Якутия), г. Якутск, ул. П. Алексеева, д. 87/5
Тел.: 8 (411) 240-24-43
М. В. Егорова
ГБУ РС (Я) «Научно-практический центр "Фтизиатрия"»
Россия
Россия
Егорова Марина Васильевна – врач КЛД иммунологической лаборатории
677005, Республика Саха (Якутия), г. Якутск, ул. П. Алексеева, д. 87/5
Тел.: 8 (411) 240-24-43
Т. М. Климова
Медицинский институт ФГАОУ ВО «Северо-Восточный федеральный университет им. М. К. Аммосова»; Якутский научный центр комплексных медицинских проблем
Россия
Россия
Климова Татьяна Михайловна – кандидат медицинских наук, доцент кафедры фармакологии и фармации
677013, Республика Саха (Якутия), г. Якутск, ул. Ойунского, д. 27
Тел.: 8 (411) 249-66-23
С. Д. Алексеева
ГБУ РС (Я) «Научно-практический центр "Фтизиатрия"»
Россия
Россия
Алексеева Светлана Дмитриевна – врач КЛД иммунологической лаборатории
677005, Республика Саха (Якутия), г. Якутск, ул. П. Алексеева, д. 87/5
Тел.: 8 (411) 240-24-43
Список литературы
1. Авербах М. М. Влияние полиморфизмов генов IFNγ и IL-10 на синтез цитокинов при туберкулезе легких у детей и подростков // Туб. и болезни легких. – 2011. – № 3. – С. 52-56.
2. Бабушкина Н. П., Рудко А. А., Фрейдин М. Б., Кучер А. Н., Пузырев В. П., Павлова Е. С., Алексеева Е. А., Лугинова Е. Ф., Горохов А. В., Кравченко А. Ф., Романов Н. Р. Изучение полиморфизма генов-кандидатов подверженности туберкулезу у разных этнотерриториальных групп Российской Федерации // Якутский медицинский журнал. – 2010. № 1 (29). – С. 35-39.
3. Бикмаева А. Р., Сибиряк С. В., Хуснутдинова Э. К. Генетический полиморфизм GSTM, CYP1A1 и CYP2E1 у больных инфильтративным туберкулезом легких (ИТЛ): возможная ассоциация с иммунологическими нарушениями // Медицинская иммунология. – 2002. – Т. 4, № 2. – С. 229.
4. Никулина Е. Л. Аллельный полиморфизм гена при туберкулезе легких // Медицинская иммунология. – 2010. – Т. 12, № 3. – С. 259-264.
5. Пузырев В. П., Фрейдин М. Б., Рудко А. А., Стрелис А. К., Колоколова О. В. Анализ взаимосвязи полиморфных маркеров генов NRAMP1 и IL-12р40 и туберкулеза // Медицинская генетика – 2002. – Т. 1, № 1. – С. 44-46.
6. Синьков В. В., Огарков О. Б., Зоркальцева Е. Ю., Скворцова Р. Г., Савилов Е. Д., Воробьева Д. В., Корчина С. И., Жданова С. Н., Косенкова Д. В., Медведева Т. В. Полиморфизм генов DC–SIGN –336 A/G, MCP1 –2518 A/G и INFγ +874 A/T у больных легочным туберкулезом в Иркутской области // Сибирский медицинский журнал. – 2009. – № 7. – С. 30-33.
7. Ansari A., Hasan Z., Dawood G. Differential combination of cytokine and interferon-gamma +874 T/A polymorphisms determines disease severity in pulmonary tuberculosis // PLoS ONE. – 2011. № – 6. – P. 1-5.
8. Asgharzadeh M., Ghorghanlu S., Rashedi J. Association of promoter polymorphisms of interleukin-10 and interferon-gamma genes with tuberculosis in Azeri population of Iran // Iran. J. Allergy Asthma Immunol. 2016. – Vol. 15, № 3. – P. 167-173.
9. Baghdadi J. El., Grant A.V., Sabri A. Human genetics of tuberculosis // Pathol Biol. – 2013. – Vol. 61, № 1. – P. 11-16.
10. Cellier M., Govoni G., Vidal S. Human natural resistance-associated macrophage protein: cDNA cloning, chromosomal mapping, genomic organization and tissue-specific expression // J. Exp. Med. – 1994. – № 180. – P. 1741-1752.
11. Cooper A. M., Dalton D. K., Stewart T. A., Griffin J. P., Russell D. G., Orme I. M. Disseminated tuberculosis in interferon gamma gene-disrupted mice // J. Exp. Med. – 1993. – № 178. – P. 2243-2247.
12. de Albuquerque A.C., Rocha L.Q., de Morais Batista A.H. Association of polymorphism +874 A/T of interferon-gamma and susceptibility to the development of tuberculosis: meta-analysis // Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. – 2012. – № 31. – P. 2887-2895.
13. Etokebe G. E. Interferon-gamma gene (T874A and G2109A) polymorphisms are associated with microscopy-positive tuberculosis // Scand. J. Immunol. 2006. – № 63. – P. 136-141.
14. Lee S. W., Chuang T. Y., Huang H. H., Lee K. F., Chen T. T., Kao Y. H., Wu L. S. Interferon gamma polymorphisms associated with susceptibility to tuberculosis in a Han Taiwanese population // J. Microbiol. Immunol. Infect. – 2015. Vol. 48, № 4. – P. 376-80.
15. Li J., Zhou Y., Zhang H. Association of IFNG gene polymorphisms with pulmonary tuberculosis but not with spinal tuberculosis in a Chinese Han population // Microb. Pathog. – 2017. – № 111. – P. 238-243. – Doi: 10.1016/j.micpath.2017.08.054.
16. Shen C., Jiao W. W., Feng W. X. IFNG polymorphisms are associated with tuberculosis in Han Chinese pediatric female population // Mol. Biol. Rep. 2013. – № 40. – Р. 5477-5482.
17. Shibasaki M., Yagi T., Yatsuya H. An influence of interferon-gamma gene polymorphisms on treatment response to tuberculosis in Japanese population // J. Infect. – 2009. – Vol. 58, № 6. – P. 467-469. – doi: 10.1016/j.jinf.2009.04.002.
18. Strachan D. P., Powell K. J., Thaker A. Vegetarian diet as a risk factor for tuberculosis in immigrant south London Asians // Thorax. – 1995. – № 50. P. 175-180.
19. Wei Z., Wenhao S., Yuanyuan M. A single nucleotide polymorphism in the interferon-gamma gene (IFNG+874 T/A) is associated with susceptibility to tuberculosis // Oncotarget. – 2017. – Vol. 8, № 31. – P. 50415-50429. – doi: 10.18632/oncotarget.17304.
20. Yerezhepov D., Zhabagin A., Askapuli A. Genetic diversity of IFgamma, IL1beta, TLR2 and TLR8 loci in pulmonary tuberculosis in Kazakhstan // Cent. Asian. J. Glob. Health. – 2014. – Vol. 12, № 3. – P. 181. Doi:10.5195/cajgh.2014.181.
Рецензия
Для цитирования:
Мордовская Л.И., Егорова М.В., Климова Т.М., Алексеева С.Д. Определение роли полиморфных вариантов гена интерферона-гамма (IFNG) в развитии туберкулеза у лиц якутской национальности. Туберкулез и болезни легких. 2020;98(12):27-32. https://doi.org/10.21292/2075-1230-2020-98-12-27-32
For citation:
Mordovskaya L.I., Egorova M.V., Klimova T.M., Аlekseeva S.D. Determination of the role of polymorphic variants of the interferon-gamma gene (IFNG) in the development of tuberculosis in the Yakut population. Tuberculosis and Lung Diseases. 2020;98(12):27-32. (In Russ.) https://doi.org/10.21292/2075-1230-2020-98-12-27-32
Просмотров: 392
Послать статью по эл. почте 