Генотипирование изолятов M. tuberculosis с широкой лекарственной устойчивостью, циркулирующих в южных регионах казахстана
Аннотация
Казахстан занимает одно из ведущих мест в мире по заболеваемости туберкулезом с лекарственной устойчивостью возбудителя. Цель - охарактеризовать изоляты M. tuberculosis, циркулирующие на юге Казахстана, на основе MIRU-VNTR-профиля и спектра мутаций генов, ответственных за появление лекарственной устойчивости к препаратам первого и второго рядов. Отобрано 58 клинических изолятов M. tuberculosis с широкой лекарственной устойчивостью. Генетический анализ проводили с помощью секвенирования генов rpoB, katG, embB и inhA-fabG оперона, а также генов gyrA, gyrB и rrs. Обнаружена ранее не описанная в научной литературе замена аспарагиновой кислоты цистеином в 94-м кодоне гена gyrA. Наблюдалось доминирование мутаций в 315-м кодоне гена katG (n = 53; 91,4%), в 531-м кодоне гена rpoB (n = 45; 77,6%), в положении 1 401 A/G гена rrs (n = 33; 56,9%) и в 94-м кодоне гена gyrA. MIRU-VNTR-типирование показало, что большинство изолятов относится к семейству W-Beijing (n = 53; 94,4%). Для семейства W-Beijing характерно появление устойчивости, что может объяснить рост показателей заболеваемости туберкулезом с лекарственной устойчивостью возбудителя в республике.
Об авторах
П. В. Тарлыков
Национальный центр биотехнологии КН МОН РК
Казахстан
Казахстан
старший научный сотрудник,
010000, г. Астана, ул. Валиханова, д. 13/1
Д. Р. Райымбек
Национальный центр биотехнологии КН МОН РК, г. Астана, Казахстан
Казахстан
Казахстан
А. Х. Аленова
Национальный центр проблем туберкулеза МЗ РК, г. Астана, Казахстан
Казахстан
Казахстан
Т. Ш. Абилдаев
Национальный центр проблем туберкулеза МЗ РК, г. Астана, Казахстан
Казахстан
Казахстан
Е. М. Раманкулов
Национальный центр биотехнологии КН МОН РК, г. Астана, Казахстан
Казахстан
Казахстан
Список литературы
1. Агзамова Р. А. Проблема лекарственной устойчивости микобактерий туберкулеза в Республике Казахстан // Фтизиопульмонология. - 2005. - № 1. - С. 12-16.
2. Исмаилов Ш. Ш. Эпидемиологическая ситуация по ТБ МЛУ в Республике Казахстан // Фтизиопульмонология. - 2006. - № 2. - С. 71-73.
3. Казенный Б. Я. Клиническое и эпидемиологическое значение первичной лекарственной устойчивости микобактерий туберкулеза: Автореф. … канд. мед. наук: 09.03.04. - М., 2004. - 27 с.
4. Мясникова Г. А., Ракишев Г. Б., Баймуханова К. Х. Туберкулез в тюрьмах // Актуальные вопросы фтизиатрии: сб. науч. тр. молодых ученых. - Алматы, 2002. - С. 30-33.
5. Статистический обзор по туберкулезу в Республике Казахстан за 2013-2014 гг. - Алматы: Атамура, 2014. - 5 с.
6. Ahmad S., Mokaddas E. Contribution of AGC to ACC and other mutations at codon 315 of the katG gene in isoniazid-resistant M. tuberculosis isolates from the Middle East // Int. J. Antimicrob. Ag. - 2004. - Vol. 32, № 5. - P. 1138-1152.
7. Allix-Béguec C., Supply P., Fauville-Dufaux M. Utility of fast mycobacterial interspersed repetitive unit-variable number tandem repeat genotyping in clinical mycobacteriological analysis // Clin. J. Infect. Dis. - 2004. - Vol. 39, № 6. - P. 783-789.
8. Drobnicwski F., Balabanova Y., Ruddy M. Rifampin- and multidrug-resistant tuberculosis in Russian civilians and prison inmates: dominance of the Beijing strain family // Emergency of Infection Disease. - 2002. - Vol. 8, № 11. - P. 127-132.
9. Dymova M. A., Cherednichenko A. G., Alkhovik O. I. Characterization of extensively drug-resistant Mycobacterium tuberculosis isolates circulating in Siberia // BMC Infect. Dis. - 2014. - Vol. 14, № 478. - P. 1471-2334.
10. Global Tuberculosis Report 2013. http://www.who.int/tb/publications/global_report/en/index.html
11. Hillemann D., Kubica T., Agzamova R. et al. Rifampicin and isoniazid resistance mutations in Mycobacterium tuberculosis strains isolated from patients in Kazakhstan // Int. J. Tuberc. Lung Dis. - 2005. - Vol. 9, № 10. - P. 1161-1167.
12. Takiff H. E., Salazar L., Guerrero C. et al. Cloning and nucleotide sequence of Mycobacterium tuberculosis gyrA and gyrB genes and detection of quinolone resistance mutations // Antimicrob. Agents Chemother. - 1994. - Vol. 38, № 4. - P. 773-780.
13. http://www.miru-vntrplus.org
14. http://www.miru-vntrplus.org/MIRU/
Для цитирования:
Тарлыков П.В., Райымбек Д.Р., Аленова А.Х., Абилдаев Т.Ш., Раманкулов Е.М. Генотипирование изолятов M. tuberculosis с широкой лекарственной устойчивостью, циркулирующих в южных регионах казахстана. Туберкулез и болезни легких. 2015;(9):41-46.
For citation:
Tarlykov P.V., Raiymbek D.R., Alenova A.K., Abildaev T.S., Ramankulov E.M. GENO-TYPING OF M. TUBERCULOSIS ISOLATES WITH MULTIPLE DRUG RESISTANCE CIRCULATING IN THE SOUTHERN REGIONS OF KAZAKHSTAN. Tuberculosis and Lung Diseases. 2015;(9):41-46. (In Russ.)
Просмотров: 347
Послать статью по эл. почте 